More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0630 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0630  ABC transporter related  100 
 
 
263 aa  532  1e-150  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.764744  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2163  ABC transporter related  69.2 
 
 
264 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.573773 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2586  ABC transporter related protein  51.53 
 
 
262 aa  280  2e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000199395  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2862  ABC transporter related protein  55.02 
 
 
270 aa  279  4e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19970  ABC transporter related  54.37 
 
 
265 aa  278  6e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0719287  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1087  ABC transporter related  55.34 
 
 
264 aa  278  7e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0659  ABC transporter related  54.92 
 
 
264 aa  278  8e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.548438  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  54.96 
 
 
263 aa  277  1e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0323  hypothetical protein  50.57 
 
 
264 aa  276  2e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0704987  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1951  ABC transporter related  53.82 
 
 
264 aa  276  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1571  ABC transporter related  55.68 
 
 
265 aa  275  5e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1714  ABC transporter related  52.29 
 
 
264 aa  275  7e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0481461  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2854  ABC transporter related protein  53.23 
 
 
264 aa  272  3e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1475  ABC transporter related protein  54.75 
 
 
265 aa  273  3e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2830  ABC transporter related  50.76 
 
 
267 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0738  ABC transporter related  50.4 
 
 
265 aa  269  4e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124437 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1748  ABC transporter related  52.29 
 
 
264 aa  268  8e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1947  ABC transporter related  52.29 
 
 
264 aa  268  8e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.349831 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3143  ABC transporter-related protein  52.67 
 
 
264 aa  266  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.288919  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0212  ABC transporter, ATP-binding protein  48.86 
 
 
265 aa  265  4e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2076  ABC transporter, ATP-binding protein  49.81 
 
 
267 aa  265  7e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000172805  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3142  ABC transporter, ATP-binding protein  52.29 
 
 
264 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0690  ABC transport system ATP-binding protein  52.29 
 
 
264 aa  265  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.553471  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0524  ABC transporter, ATP-binding protein  52.29 
 
 
264 aa  265  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0111  ABC transporter, ATP-binding protein  52.29 
 
 
264 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2905  ABC transporter, ATP-binding protein  52.29 
 
 
264 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1477  ABC transporter, ATP-binding protein  52.29 
 
 
264 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0251  ABC transporter ATP-binding protein  48.29 
 
 
267 aa  265  7e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000273  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1738  ABC transporter ATP-binding protein  52.29 
 
 
264 aa  264  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.924585  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0442  ABC transporter, ATP-binding protein  52.29 
 
 
264 aa  264  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0762699  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1601  ABC transporter related  50.38 
 
 
264 aa  264  1e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.81737 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0507  ABC transporter, ATP-binding protein  51.91 
 
 
264 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4551  ABC transporter related  49.24 
 
 
264 aa  263  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000329769  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1437  ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 
264 aa  263  3e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.432186 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1111  ABC transporter, ATPase subunit  51.79 
 
 
260 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1118  ABC transporter, ATPase subunit  51.79 
 
 
270 aa  261  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.505252  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4313  ABC transporter related  51.53 
 
 
264 aa  261  8e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1463  ABC transporter related  51.91 
 
 
264 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  hitchhiker  0.000000593097 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1313  ABC transporter related  50.76 
 
 
264 aa  260  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1504  ABC transporter related  51.53 
 
 
264 aa  259  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1209  ABC transporter-related protein  50.76 
 
 
264 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2216  ABC transporter related  51.15 
 
 
264 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315955  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2829  ABC transporter related  51.15 
 
 
264 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0235677  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2840  ABC transporter related  51.15 
 
 
264 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0474  ABC transporter related  50.76 
 
 
264 aa  258  6e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.753612  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6159  ABC transporter, ATPase subunit  50.38 
 
 
264 aa  256  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0075  ABC transporter related  51 
 
 
282 aa  255  6e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0725  ABC transporter related protein  48.39 
 
 
265 aa  254  7e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.129055  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1945  ABC transporter related  49.43 
 
 
264 aa  254  8e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.446826  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0865  ABC transporter related  49.62 
 
 
264 aa  249  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1275  ABC transporter ATP-binding protein  52.29 
 
 
264 aa  248  6e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14370  putative ABC-transporter ATP-binding component  51.91 
 
 
264 aa  248  8e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3721  ABC transporter related  50.76 
 
 
264 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4044  ABC transporter related  50.76 
 
 
264 aa  247  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1504  ABC transporter related  50.76 
 
 
296 aa  247  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2104  ABC transporter component  52.65 
 
 
264 aa  245  4e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3065  ABC transporter related  50.76 
 
 
264 aa  245  4.9999999999999997e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2040  ABC transporter-related protein  50.76 
 
 
264 aa  245  6e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2225  ABC transporter related  45.38 
 
 
257 aa  239  4e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0489859  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2869  ABC transporter related  49.42 
 
 
265 aa  238  5.999999999999999e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0621  ABC transporter, ATP-binding protein  48.57 
 
 
245 aa  238  6.999999999999999e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183641  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1976  ABC transporter, ATP-binding protein  48.47 
 
 
264 aa  237  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2056  ABC transporter, ATP-binding protein  48.47 
 
 
264 aa  237  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002972  ABC transporter ATP-binding protein  46.18 
 
 
264 aa  236  4e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02938  hypothetical protein  48.47 
 
 
264 aa  231  9e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2362  ABC transporter related protein  43.98 
 
 
261 aa  231  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000588091  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0823  ABC transporter ATP-binding protein  47.37 
 
 
267 aa  231  1e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0106274 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0207  ABC transporter related protein  45.21 
 
 
262 aa  226  2e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1153  ABC transporter ATP-binding protein  50.44 
 
 
252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0266393  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0044  ABC transporter related  40.64 
 
 
251 aa  215  7e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0269  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  48.93 
 
 
256 aa  215  7e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0077  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  47.23 
 
 
251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0049  ABC transporter, ATP-binding protein  43.51 
 
 
264 aa  211  9e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0260  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  47.19 
 
 
254 aa  206  4e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1819  ABC transporter related  41.37 
 
 
254 aa  203  2e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000182766  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1187  ABC transporter, ATP-binding protein  44.4 
 
 
253 aa  198  7.999999999999999e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1100  ABC transporter related  39.91 
 
 
242 aa  179  2.9999999999999997e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0476  ABC transporter related  32.35 
 
 
259 aa  124  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.61284 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4373  ABC transporter related  37.67 
 
 
252 aa  124  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2020  ABC transporter related  34.35 
 
 
246 aa  123  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  33.91 
 
 
256 aa  123  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3187  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  33.48 
 
 
248 aa  122  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3326  ABC transporter related  33.48 
 
 
248 aa  122  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3466  ABC transporter related protein  33.76 
 
 
247 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  33.91 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3446  purine catabolism protein PucG  33.48 
 
 
506 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0297  ABC transporter ATP-binding protein  31.45 
 
 
339 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0281  ABC transporter, ATP-binding protein  31.45 
 
 
339 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0312  ABC transporter ATP-binding protein  31.45 
 
 
339 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0343  ABC transporter, ATP-binding protein  31.45 
 
 
339 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0494  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  31.9 
 
 
245 aa  120  3e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000537818  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  32.63 
 
 
257 aa  119  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0787  ABC transporter related  37.26 
 
 
281 aa  118  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.638665  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0341  ABC transporter, ATP-binding protein  31.05 
 
 
339 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0519  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  31.47 
 
 
245 aa  118  7.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0385  ABC transporter, ATP-binding protein  31.05 
 
 
339 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0490  ABC transporter related  33.05 
 
 
241 aa  118  7.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0663  SMR family multidrug efflux pump  32.17 
 
 
245 aa  118  9e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  33.04 
 
 
275 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  37.07 
 
 
328 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>