More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0623 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0623  ABC transporter related  100 
 
 
294 aa  593  1e-168  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.512401  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1014  ABC transporter related protein  45.75 
 
 
287 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2209  ATPase  51.15 
 
 
271 aa  236  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.412133  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1726  ABC transporter related  47.91 
 
 
268 aa  223  4e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0026  ABC transporter related  43.51 
 
 
273 aa  209  3e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0118  ABC transporter related  49.42 
 
 
308 aa  208  9e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.4303 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2734  ABC transporter related  44.76 
 
 
258 aa  204  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0401  ABC transporter-related protein  46.25 
 
 
257 aa  204  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  43.55 
 
 
249 aa  204  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0815  ABC transporter-related protein  43.43 
 
 
255 aa  199  3e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  43.78 
 
 
257 aa  199  5e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1890  ABC-type zinc transport system ATP-binding protein  42.97 
 
 
262 aa  198  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1103  ABC transporter related  44.26 
 
 
250 aa  194  1e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  40.73 
 
 
258 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  40.73 
 
 
258 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0097  ABC transporter ATP-binding protein  43.26 
 
 
281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00699805  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2422  ABC transporter, ATPase subunit  41.63 
 
 
243 aa  183  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0186  ABC transporter related  42.49 
 
 
251 aa  180  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0517  manganese transport system ATP-binding protein MntA  37.6 
 
 
273 aa  179  7e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_573  cation ABC transporter, ATP-binding protein  41.56 
 
 
254 aa  177  2e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0632  cation ABC transporter, ATP-binding protein  41.15 
 
 
254 aa  176  3e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0605  ABC transporter related  40.16 
 
 
254 aa  176  3e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1729  ABC transporter ATP-binding protein  38.8 
 
 
251 aa  177  3e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2087  ABC transporter related  39.44 
 
 
258 aa  175  7e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.454279  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2845  ABC transporter related  39.66 
 
 
288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0597  ABC transporter related protein  39.35 
 
 
230 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  38.02 
 
 
256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  38.02 
 
 
256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  37.7 
 
 
256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  40.09 
 
 
243 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4415  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  38.02 
 
 
256 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0995  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  40.56 
 
 
254 aa  171  9e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.597516  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4361  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.02 
 
 
256 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129987  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4183  cation ABC transporter ATP-binding protein  38.02 
 
 
256 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.420645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4021  cation ABC transporter, ATP-binding protein  38.02 
 
 
256 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100127  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4031  cation ABC transporter, ATP-binding protein  38.02 
 
 
256 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00593261  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  39 
 
 
254 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4505  cation ABC transporter ATP-binding protein  38.02 
 
 
256 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4303  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  38.02 
 
 
256 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9910000000000006e-20 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2475  ABC transporter related  41.2 
 
 
254 aa  168  9e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.322042  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0206  ABC transporter related  41.82 
 
 
222 aa  168  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0130  ABC transporter related protein  37.6 
 
 
253 aa  167  1e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1791  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.62 
 
 
260 aa  168  1e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1687  ABC transporter related protein  39.11 
 
 
260 aa  167  1e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0155  cation ABC transporter, ATP-binding protein  35.77 
 
 
284 aa  168  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2316  ABC transporter related  39.65 
 
 
251 aa  167  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0140  ATPase  41.78 
 
 
252 aa  166  5e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0265592  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0043  ABC transporter related  37.65 
 
 
247 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016055  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3009  ABC transporter-related protein  36.07 
 
 
257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.12216  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  39.91 
 
 
255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0137  cation ABC transporter, ATP-binding protein  34.55 
 
 
284 aa  162  5.0000000000000005e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2191  ABC transporter related  37.39 
 
 
249 aa  162  9e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000419302  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0178  cation ABC transporter, ATP-binding protein  34.96 
 
 
284 aa  161  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  40.42 
 
 
262 aa  159  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  35.8 
 
 
260 aa  158  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0548  ABC transporter related protein  39.83 
 
 
259 aa  157  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.324241  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1614  ABC transporter related  36.74 
 
 
261 aa  157  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.507834  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1648  ABC transporter related  36.74 
 
 
261 aa  157  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.168951  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  36.21 
 
 
254 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4183  ABC transporter related  37.89 
 
 
250 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00136273  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0439  ABC transporter related  38.39 
 
 
237 aa  154  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0164474  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  40.43 
 
 
259 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18340  ABC transporter related  41.87 
 
 
239 aa  152  5e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000733695  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  36.71 
 
 
261 aa  152  8e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  35.45 
 
 
252 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  37.55 
 
 
271 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  38.43 
 
 
262 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1536  ABC transporter related  41.25 
 
 
257 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.591155 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0038  cation ABC transporter, ATP-binding protein  34.98 
 
 
249 aa  149  4e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0371  ABC transporter-like protein  37.64 
 
 
256 aa  149  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1214  ABC transporter related protein  37.27 
 
 
245 aa  149  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3622  ABC transporter related protein  37.56 
 
 
255 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  38.91 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  38.91 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  40 
 
 
247 aa  147  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  38.3 
 
 
263 aa  147  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0168  ABC transporter related protein  38.64 
 
 
255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1112  ABC transporter related  34.84 
 
 
259 aa  146  5e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  37.96 
 
 
254 aa  145  5e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0988  ABC transporter related  34.86 
 
 
249 aa  145  6e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3479  ABC transporter related protein  39.82 
 
 
246 aa  145  7.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.319887  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1596  ABC transporter-like protein  38.86 
 
 
256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.309069  normal  0.368038 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3726  ABC transporter related  37.1 
 
 
255 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3599  ABC transporter related  34.1 
 
 
250 aa  145  9e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1589  ABC transporter related protein  36.61 
 
 
250 aa  145  9e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.741401  normal  0.0385936 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0414  ABC transporter related protein  40.09 
 
 
283 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  36.13 
 
 
255 aa  145  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  34.78 
 
 
259 aa  145  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  33.33 
 
 
247 aa  144  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0964  ABC transporter related protein  42.03 
 
 
250 aa  144  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000527176  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1675  ATPase  39.15 
 
 
233 aa  144  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000905168  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  38.07 
 
 
251 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3533  ABC transporter related protein  34.1 
 
 
250 aa  143  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  36.63 
 
 
258 aa  144  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  36.5 
 
 
265 aa  143  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2852  ABC transporter related  35.92 
 
 
271 aa  143  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  37.5 
 
 
256 aa  143  4e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1654  ABC transporter-like protein  33.88 
 
 
240 aa  142  6e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  33.79 
 
 
236 aa  142  7e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  40.99 
 
 
250 aa  142  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>