More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0586 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0586  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 136 aa  267  2.9999999999999997e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  66.67 
 
 		 138 aa  173  7e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2363  protein TolR  64.39 
 
 		 139 aa  169  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372464 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0281  biopolymer transport protein ExbD/TolR  62.88 
 
 		 139 aa  165  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149561  hitchhiker  0.000106063 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3630  biopolymer ExbD/TolR family transporter  61.65 
 
 		 146 aa  165  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0861  protein TolR  57.35 
 
 		 152 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000417761  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0840  biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.38 
 
 		 137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0352738 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1460  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.66 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2977  TolR protein  50.76 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.41 
 
 		 144 aa  120  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0745  protein TolR  43.94 
 
 		 140 aa  117  7.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000786072  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  49.24 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.09 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0857  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.8 
 
 		 139 aa  115  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.345374  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0612  ExbD/TolR family protein  43.38 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  46.88 
 
 		 139 aa  111  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1908  ExbD/TolR family protein  44.93 
 
 		 141 aa  110  9e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  45.52 
 
 		 139 aa  110  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2212  biopolymer transport TolR  43.31 
 
 		 140 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000948089  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2418  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.04 
 
 		 144 aa  107  7.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0748  protein TolR  41.94 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.031429  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1109  biopolymer transport TolR  48.78 
 
 		 134 aa  105  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00176605  normal  0.311844 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0661  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.32 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602006  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0696  protein TolR  46.32 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0695  protein TolR  46.32 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.31 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2231  TolR protein  42.86 
 
 		 148 aa  103  9e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  43.18 
 
 		 150 aa  103  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  42.75 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0135  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.14 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.67 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  42.75 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0205  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.84 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000105504  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0705  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.97 
 
 		 152 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105618  normal  0.350278 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0391  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.72 
 
 		 159 aa  101  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2163  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.28 
 
 		 131 aa  100  6e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0401461  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.67 
 
 		 151 aa  100  8e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  41.73 
 
 		 152 aa  99.8  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.74 
 
 		 154 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529067  hitchhiker  0.000695312 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2629  biopolymer transport TolR  43.65 
 
 		 149 aa  97.8  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3514  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.16 
 
 		 151 aa  97.4  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262132  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  41.1 
 
 		 146 aa  96.3  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.65 
 
 		 166 aa  96.3  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  41.35 
 
 		 167 aa  96.3  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  42.06 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.16 
 
 		 147 aa  95.9  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1015  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45 
 
 		 150 aa  95.5  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1701  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.96 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0404269  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0150  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.48 
 
 		 149 aa  94.7  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000194485  hitchhiker  0.00605756 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.73 
 
 		 148 aa  94.7  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2192  biopolymer transport TolR  38.46 
 
 		 142 aa  94  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164726  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.44 
 
 		 155 aa  94  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0971  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.28 
 
 		 137 aa  94  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2145  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.52 
 
 		 167 aa  94  7e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2215  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.06 
 
 		 154 aa  94  7e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.32 
 
 		 138 aa  93.6  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3498  protein TolR  38.58 
 
 		 151 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  42.11 
 
 		 152 aa  92.8  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0684  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.22 
 
 		 154 aa  92.8  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.508331  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3203  protein TolR  38.58 
 
 		 151 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.349327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10620  TonB system transport protein ExbD  42.86 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160821  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3389  protein TolR  44.44 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436196  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3472  protein TolR  45.74 
 
 		 137 aa  92.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0578496  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  40.32 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2367  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.8 
 
 		 162 aa  91.7  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.46 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4434  protein TolR  42.74 
 
 		 147 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620039  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5556  biopolymer transport protein ExbD  47.06 
 
 		 142 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5304  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.48 
 
 		 149 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.159444  normal  0.423662 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0725  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.48 
 
 		 145 aa  90.5  7e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.154388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0564  protein TolR  40 
 
 		 150 aa  90.5  7e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.434395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0470  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.4 
 
 		 141 aa  90.5  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923665 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2531  biopolymer transport protein  37.86 
 
 		 142 aa  90.1  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000400528  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.68 
 
 		 140 aa  90.1  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.13 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1803  biopolymer ExbD/TolR family transporter  40 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.831218  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0204  biopolymer transport protein ExbD  42.11 
 
 		 141 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5229  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.32 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.334933  normal  0.0672636 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2064  ExbD/TolR family transport energizing protein  40 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132783  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2118  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.41 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1930  biopolymer ExbD/TolR family transporter  40 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0617  ExbD/TolR family transport energizing protein  40 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1092  ExbD/TolR family transport energizing protein  40 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0520  ExbD/TolR family transport energizing protein  40 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.01 
 
 		 145 aa  89.4  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0800  ExbD/TolR family transport energizing protein  40 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4762  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.32 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.718124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.62 
 
 		 156 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0663066  normal  0.292388 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0560  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.62 
 
 		 156 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0068  TonB system transport protein ExbD  42.11 
 
 		 141 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0746  protein TolR  42.97 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0863  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.23 
 
 		 138 aa  89  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0638904  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0671  ExbD/TolR family protein  42.62 
 
 		 156 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045773  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5529  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.46 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0374  TonB system transport protein ExbD type-1  41.27 
 
 		 141 aa  89.4  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1855  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.6 
 
 		 144 aa  88.6  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3325  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.7 
 
 		 137 aa  89  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.110206  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5877  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.46 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2200  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.46 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1238  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.53 
 
 		 137 aa  88.6  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>