More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0534 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0534  aminotransferase class V  100 
 
 		 394 aa  800    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  66.06 
 
 		 401 aa  535  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  67.88 
 
 		 398 aa  535  1e-151  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  65.22 
 
 		 401 aa  530  1e-149  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  65.8 
 
 		 398 aa  527  1e-148  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  63.94 
 
 		 401 aa  526  1e-148  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  63.99 
 
 		 397 aa  511  1e-144  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  64.77 
 
 		 398 aa  512  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  50.9 
 
 		 396 aa  380  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  50.65 
 
 		 384 aa  380  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  50.26 
 
 		 384 aa  375  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  50.77 
 
 		 392 aa  375  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  49.24 
 
 		 394 aa  368  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  49.49 
 
 		 400 aa  370  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  48.72 
 
 		 414 aa  368  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  50.13 
 
 		 404 aa  368  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  49.1 
 
 		 384 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  47.45 
 
 		 392 aa  362  5.0000000000000005e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  48.09 
 
 		 398 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  50.13 
 
 		 394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  47.31 
 
 		 398 aa  356  5e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  47.04 
 
 		 391 aa  353  2e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  49.1 
 
 		 396 aa  353  4e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  47.68 
 
 		 402 aa  352  5.9999999999999994e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  47.34 
 
 		 394 aa  351  2e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  47.49 
 
 		 398 aa  349  6e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  47.49 
 
 		 398 aa  349  6e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  46.51 
 
 		 389 aa  348  9e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  51.42 
 
 		 394 aa  348  1e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  47.04 
 
 		 391 aa  347  2e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  47.56 
 
 		 399 aa  347  2e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  49.23 
 
 		 382 aa  347  3e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  47.03 
 
 		 391 aa  346  5e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  48.2 
 
 		 388 aa  345  7e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  47.55 
 
 		 389 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  47.03 
 
 		 389 aa  343  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  45.27 
 
 		 402 aa  344  2e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  46.77 
 
 		 388 aa  344  2e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  45.52 
 
 		 407 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  45.27 
 
 		 393 aa  343  4e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  46.82 
 
 		 400 aa  342  8e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  45.36 
 
 		 397 aa  340  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  45.98 
 
 		 398 aa  340  2e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  46.17 
 
 		 404 aa  340  2e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  47.84 
 
 		 393 aa  340  2e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  45.41 
 
 		 402 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  46.63 
 
 		 399 aa  339  4e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  47.69 
 
 		 400 aa  339  5.9999999999999996e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  46.94 
 
 		 400 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  46.56 
 
 		 386 aa  335  5.999999999999999e-91  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  45.05 
 
 		 401 aa  333  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  48.43 
 
 		 379 aa  334  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  45.05 
 
 		 401 aa  333  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  48.84 
 
 		 390 aa  333  3e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  44.82 
 
 		 400 aa  331  2e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  44.36 
 
 		 402 aa  330  3e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  44.96 
 
 		 400 aa  330  4e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  45.66 
 
 		 396 aa  328  8e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  43.58 
 
 		 404 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  44.01 
 
 		 398 aa  326  4.0000000000000003e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  47.04 
 
 		 387 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  45.83 
 
 		 401 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  45.34 
 
 		 402 aa  323  4e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  44.87 
 
 		 403 aa  322  5e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2182  aminotransferase, class V  47.29 
 
 		 388 aa  322  7e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.186921 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  42.67 
 
 		 398 aa  320  3e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3620  cysteine desulfurase NifS  45.41 
 
 		 400 aa  320  3e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.190149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  45.43 
 
 		 396 aa  320  3e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  46.62 
 
 		 409 aa  318  7.999999999999999e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0530  cysteine desulfurase  47.03 
 
 		 387 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  42.01 
 
 		 382 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  42.19 
 
 		 388 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  44.02 
 
 		 417 aa  313  3.9999999999999997e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  47.07 
 
 		 392 aa  312  4.999999999999999e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  42.56 
 
 		 389 aa  312  5.999999999999999e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  44.76 
 
 		 393 aa  311  9e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  44.22 
 
 		 393 aa  310  2e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  45.61 
 
 		 395 aa  307  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5907  cysteine desulfurase  45.66 
 
 		 404 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.469117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  43.08 
 
 		 386 aa  306  5.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  41.24 
 
 		 383 aa  301  1e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  42.67 
 
 		 394 aa  300  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  44.92 
 
 		 1135 aa  300  2e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  43.26 
 
 		 406 aa  300  3e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3581  cysteine desulfurase NifS  45.01 
 
 		 404 aa  300  4e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157563  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1163  NifS family cysteine desulfurase  42.01 
 
 		 396 aa  299  6e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  45.09 
 
 		 1139 aa  298  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  45.33 
 
 		 1143 aa  298  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  42.31 
 
 		 388 aa  298  2e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  41.93 
 
 		 381 aa  297  3e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1770  NifS family cysteine desulfurase  42.27 
 
 		 396 aa  296  4e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.406981  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2008  aminotransferase, class V  41.28 
 
 		 404 aa  294  2e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.475663  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  40.46 
 
 		 383 aa  293  3e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  43.83 
 
 		 381 aa  293  4e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  42.93 
 
 		 380 aa  292  8e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2179  cysteine desulfurase  42.49 
 
 		 373 aa  291  1e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0688  cysteine desulfurase NifS  41.28 
 
 		 388 aa  291  2e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0297222  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2154  cysteine desulfurase, NifS family  40.87 
 
 		 396 aa  290  3e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0042  NifS family cysteine desulfurase  41.13 
 
 		 396 aa  289  5.0000000000000004e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  42.64 
 
 		 410 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>