204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0473 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0473  tol-pal system protein YbgF  100 
 
 		 350 aa  709    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0955872  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0772  tol-pal system protein YbgF  33.33 
 
 		 285 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0818446 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1158  TPR repeat-containing protein  36.08 
 
 		 257 aa  93.6  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.188926  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  33.1 
 
 		 239 aa  90.5  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0965  tol-pal system protein YbgF  39.64 
 
 		 487 aa  86.3  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.666424  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  41.28 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  33.83 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3269  tol-pal system protein YbgF  38.39 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00753149  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1580  TPR domain-containing protein  38.39 
 
 		 263 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0635876  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0500  tol-pal system protein YbgF  37.27 
 
 		 343 aa  78.2  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  29.41 
 
 		 283 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  32.46 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0826  tol-pal system protein YbgF  36.28 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  33.09 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0201  TPR repeat-containing protein  35.11 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000441439  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0641  tol-pal system protein YbgF  31.85 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000302592  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0951  tol-pal system protein YbgF  32.62 
 
 		 271 aa  75.9  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1070  hypothetical protein  31.54 
 
 		 271 aa  75.9  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387649  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  35.59 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  28.68 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0240  hypothetical protein  32.52 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  30.87 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  29.03 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3038  TPR domain-containing protein  34.55 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  30.56 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  31.82 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  33.67 
 
 		 263 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  33.67 
 
 		 263 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  33.67 
 
 		 263 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  39.5 
 
 		 257 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  33.67 
 
 		 263 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  33.67 
 
 		 263 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  33.67 
 
 		 263 aa  69.3  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  33.67 
 
 		 263 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  33.67 
 
 		 263 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  33.67 
 
 		 263 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1733  TPR domain-containing protein  31.48 
 
 		 263 aa  68.6  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2208  Tol-Pal system YbgF  31.67 
 
 		 275 aa  68.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00178877  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  26.92 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  31.63 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0537  tol-pal system protein YbgF  30.23 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  31.63 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  31.63 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2219  tetratricopeptide domain-containing protein  34.82 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85463  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0797  TPR repeat-containing protein  34.95 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146467  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3991  tol-pal system protein YbgF  36.46 
 
 		 271 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2124  Tol-Pal system YbgF  32.54 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186495  normal  0.327311 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0273  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0105531  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1253  Tol-Pal system, YbgF  36.46 
 
 		 268 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0226612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0484  tol-pal system protein YbgF  29.13 
 
 		 318 aa  67  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0301  tol-pal system protein YbgF  31.25 
 
 		 243 aa  67  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.658955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3117  tol-pal system protein YbgF  32.26 
 
 		 272 aa  67  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.35815  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  33.33 
 
 		 262 aa  67  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  35.34 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2973  TPR domain-containing protein  32.85 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.485874  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  36.46 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2145  TPR domain-containing protein  29.63 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0848355  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1237  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.638629  normal  0.0592665 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0889  hypothetical protein  33.33 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.189152  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  33.88 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1281  tol-pal system protein YbgF  32 
 
 		 266 aa  65.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000295525  decreased coverage  0.00000450337 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4194  tol-pal system protein YbgF  36.46 
 
 		 268 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.90283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1627  transmembrane protein  31.19 
 
 		 284 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2562  Tol-Pal system YbgF  34.41 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000429972  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1096  hypothetical protein  33.98 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0281  tol-pal system protein YbgF  40 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433103  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3970  hypothetical protein  34.31 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178755  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1417  TPR repeat-containing protein  34.31 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  30.38 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  30.3 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  30.3 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36620  tol-pal system YbgF-like protein  34.19 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  30.38 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  29.19 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  30.7 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2900  tol-pal system protein YbgF  26.77 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000143705  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0686  tol-pal system protein YbgF  33.98 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379534  normal  0.398306 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0730  tol-pal system protein YbgF  33.98 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18828  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4400  hypothetical protein  35.29 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374202  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2673  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 		 252 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0909  tol-pal system protein YbgF  31.63 
 
 		 262 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0263  tol-pal system protein YbgF  26.85 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.067735 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5489  tol-pal system protein YbgF  37.65 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39153  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0737  hypothetical protein  31.19 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.790435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1855  tetratricopeptide TPR_2  35.56 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4333  tol-pal system protein YbgF  28.57 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.105755 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1114  tol-pal system protein YbgF  30.91 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.875403  normal  0.0458265 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1427  hypothetical protein  29.25 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610917  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0753  tol-pal system protein YbgF  31 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000204373  normal  0.160376 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1859  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 		 242 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000136736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  30.58 
 
 		 265 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4534  TPR repeat-containing protein  36.17 
 
 		 274 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1315  tol-pal system protein YbgF  30.36 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3115  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.479676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1986  tetratricopeptide TPR_2  30 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.396777  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  35.42 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128207  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2625  Tol-Pal system YbgF  30.09 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>