More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0464 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0464  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  619  1e-176  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2105  hypothetical protein  67.24 
 
 
305 aa  384  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0641  hypothetical protein  65.58 
 
 
297 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.576648  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1298  hypothetical protein  53.95 
 
 
288 aa  307  1.0000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0540  hypothetical protein  53.98 
 
 
299 aa  306  3e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.612157  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2099  hypothetical protein  55.17 
 
 
303 aa  304  1.0000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1082  hypothetical protein  55.4 
 
 
301 aa  296  4e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.868958  normal  0.280339 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0619  hypothetical protein  57.65 
 
 
291 aa  296  4e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.437288  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0045  hypothetical protein  52.33 
 
 
268 aa  295  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1355  hypothetical protein  52.86 
 
 
279 aa  295  7e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774682  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1132  hypothetical protein  51.97 
 
 
274 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2793  hypothetical protein  52.73 
 
 
268 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0471  hypothetical protein  52.52 
 
 
292 aa  293  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0872  hypothetical protein  56.54 
 
 
302 aa  293  3e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128408  normal  0.238224 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0477  hypothetical protein  57.95 
 
 
292 aa  291  9e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0968  hypothetical protein  52.86 
 
 
279 aa  291  1e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1027  hypothetical protein  52.86 
 
 
276 aa  290  2e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1265  hypothetical protein  56.3 
 
 
288 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0810477  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2341  hypothetical protein  52.36 
 
 
284 aa  287  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3301  hypothetical protein  51.61 
 
 
301 aa  286  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0516405  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0004  hypothetical protein  50.17 
 
 
285 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1373  hypothetical protein  53.82 
 
 
287 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2487  hypothetical protein  53.44 
 
 
287 aa  285  5e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.100188 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0347  hypothetical protein  55.17 
 
 
279 aa  285  7e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2515  hypothetical protein  51.61 
 
 
284 aa  284  1.0000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921995  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0063  hypothetical protein  51.08 
 
 
288 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2235  hypothetical protein  51.53 
 
 
287 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0080  hypothetical protein  51.44 
 
 
288 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569789  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1624  hypothetical protein  50.36 
 
 
287 aa  278  6e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.216103  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16211  dehydrogenase  50.76 
 
 
288 aa  275  5e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3075  hypothetical protein  52.11 
 
 
287 aa  275  8e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0386  hypothetical protein  53.38 
 
 
283 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254572  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0070  hypothetical protein  51.01 
 
 
299 aa  271  9e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.631232  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4735  hypothetical protein  52.85 
 
 
289 aa  269  5e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.691032 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1777  hypothetical protein  52.73 
 
 
297 aa  265  5e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11771  Rossmann fold nucleotide-binding protein  50.58 
 
 
282 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0454643 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0462  putative dape gene and orf2  50.19 
 
 
282 aa  263  4e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0269  hypothetical protein  49.26 
 
 
270 aa  262  4.999999999999999e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3012  hypothetical protein  52.4 
 
 
282 aa  261  1e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.290365 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12211  dehydrogenase  48.29 
 
 
294 aa  260  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.316821  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1542  hypothetical protein  46.21 
 
 
304 aa  259  3e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0225266  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1322  hypothetical protein  47.18 
 
 
272 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0454  decarboxylase family protein  51.35 
 
 
318 aa  256  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2614  decarboxylase family protein  51.14 
 
 
292 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1022  decarboxylase family protein  51.14 
 
 
315 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2756  decarboxylase family protein  51.14 
 
 
292 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1095  hypothetical protein  50 
 
 
275 aa  255  7e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537193  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0158  decarboxylase family protein  50.76 
 
 
319 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0183  decarboxylase family protein  50.76 
 
 
319 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1327  decarboxylase family protein  50.76 
 
 
319 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1359  hypothetical protein  49.25 
 
 
285 aa  251  9.000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.220346  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0149  hypothetical protein  48.92 
 
 
296 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1495  putative dape protein  47.69 
 
 
291 aa  245  8e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.395565  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0106  hypothetical protein  48.47 
 
 
273 aa  240  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6192  hypothetical protein  49.2 
 
 
342 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194706  normal  0.269121 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1077  hypothetical protein  47.64 
 
 
276 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5908  hypothetical protein  46.54 
 
 
342 aa  235  7e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0391937  normal  0.412056 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7791  hypothetical protein  46.62 
 
 
261 aa  227  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4407  hypothetical protein  46.3 
 
 
318 aa  221  8e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0590  hypothetical protein  54.34 
 
 
175 aa  198  9e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2839  hypothetical protein  41.54 
 
 
271 aa  194  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3325  hypothetical protein  42.08 
 
 
251 aa  192  7e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1009  hypothetical protein  63.71 
 
 
147 aa  175  8e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  49.39 
 
 
273 aa  156  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  49.7 
 
 
247 aa  154  2e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3030  hypothetical protein  50.59 
 
 
235 aa  154  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862157  hitchhiker  0.00666776 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2835  hypothetical protein  47.83 
 
 
216 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181982  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4084  hypothetical protein  42.94 
 
 
275 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2461  hypothetical protein  46.82 
 
 
220 aa  151  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000124566  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4510  hypothetical protein  45.4 
 
 
242 aa  150  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.649813  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0974  hypothetical protein  35.77 
 
 
229 aa  149  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  45.83 
 
 
263 aa  149  7e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10023  hypothetical protein  45.14 
 
 
229 aa  149  8e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  46.99 
 
 
225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  40.5 
 
 
266 aa  147  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  45.18 
 
 
263 aa  145  9e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1915  hypothetical protein  38 
 
 
266 aa  144  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15410  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 1 TIGR00725/conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2 TIGR00730  43.89 
 
 
267 aa  144  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.47781  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3314  hypothetical protein  43.78 
 
 
270 aa  142  6e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.686515  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8428  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  43.72 
 
 
267 aa  142  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676666  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6911  hypothetical protein  42.05 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135288  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3814  hypothetical protein  47.7 
 
 
241 aa  141  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.383956  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1863  hypothetical protein  50.35 
 
 
217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.9915  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  33.45 
 
 
280 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0806  hypothetical protein  35.34 
 
 
267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.489855 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1842  hypothetical protein  42.68 
 
 
289 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0573823  normal  0.171511 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0727  hypothetical protein  46.58 
 
 
247 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0774  hypothetical protein  34.27 
 
 
255 aa  139  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4873  hypothetical protein  34.6 
 
 
244 aa  139  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2861  hypothetical protein  45.4 
 
 
241 aa  139  6e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.33158  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1161  hypothetical protein  35.74 
 
 
264 aa  139  7.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1094  hypothetical protein  40.74 
 
 
279 aa  139  7.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208202  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7947  hypothetical protein  44.71 
 
 
259 aa  139  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2426  lysine decarboxylase family protein  43.9 
 
 
249 aa  138  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000109192 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0299  hypothetical protein  47.1 
 
 
244 aa  138  1e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000150026  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06300  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  34.68 
 
 
260 aa  138  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3023  hypothetical protein  42.16 
 
 
248 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.897661  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  44.38 
 
 
245 aa  137  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3171  hypothetical protein  46.78 
 
 
260 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.809527 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1000  hypothetical protein  36.55 
 
 
278 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>