More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0443 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0443  aspartate aminotransferase  100 
 
 
384 aa  798    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0958  aspartate aminotransferase  60.16 
 
 
381 aa  476  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1584  aspartate aminotransferase  58.93 
 
 
379 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.697592  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1144  aspartate aminotransferase  57.89 
 
 
381 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.859107  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4053  aspartate aminotransferase  56.68 
 
 
383 aa  455  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2192  aspartate aminotransferase  58.42 
 
 
385 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  50.65 
 
 
398 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0680  aspartate aminotransferase  52.13 
 
 
387 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0881  hypothetical protein  41.34 
 
 
385 aa  297  2e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3276  aminotransferase  41.78 
 
 
394 aa  297  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2805  aminotransferase class I and II  40.93 
 
 
393 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2696  aminotransferase  41.32 
 
 
393 aa  285  7e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192367  normal  0.916147 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4010  aminotransferase class I and II  36.15 
 
 
388 aa  284  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0894361  normal  0.978493 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2053  aminotransferase, class I/class II  41.16 
 
 
400 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0836  hypothetical protein  39.52 
 
 
390 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149421 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2582  aminotransferase class I and II  40.41 
 
 
393 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2043  hypothetical protein  41.87 
 
 
388 aa  282  7.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1859  aminotransferase, class I and II  39.74 
 
 
383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1528  aminotransferase  40.71 
 
 
397 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.545419  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1189  aminotransferase class I and II  38.26 
 
 
376 aa  273  3e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00616768  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  38.9 
 
 
383 aa  273  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0767  aminotransferase  39.95 
 
 
393 aa  273  5.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  41.51 
 
 
393 aa  271  1e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0659  aminotransferase  39.49 
 
 
394 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  38.24 
 
 
393 aa  271  2e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0664  hypothetical protein  37.76 
 
 
386 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2610  aminotransferase class I and II  40.41 
 
 
393 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208035  normal  0.436935 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0401  aminotransferase class I and II  41.24 
 
 
395 aa  269  5e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0552062  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0768  aminotransferase  40.05 
 
 
389 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00291764  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0703  aminotransferase  39.59 
 
 
394 aa  267  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4803  hypothetical protein  38.96 
 
 
390 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0396768  hitchhiker  0.00689521 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3019  aminotransferase  40.85 
 
 
397 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2148  aminotransferase  40.85 
 
 
397 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2019  aminotransferase  40.85 
 
 
397 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.184615  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0761  aminotransferase  40.85 
 
 
397 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.590184  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3072  aminotransferase  40.85 
 
 
397 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2594  aminotransferase  40.85 
 
 
416 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3104  aminotransferase  40.85 
 
 
460 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5438  hypothetical protein  38.58 
 
 
390 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1089  hypothetical protein  39.63 
 
 
400 aa  265  1e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.806795  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  36.22 
 
 
387 aa  264  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0710  aminotransferase  39.49 
 
 
394 aa  263  4e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2719  aminotransferase  40.38 
 
 
392 aa  263  4e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1818  aminotransferase, class I and II  38.67 
 
 
378 aa  263  4e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2980  aminotransferase  39.16 
 
 
383 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0970  aminotransferase, classes I and II  38.2 
 
 
390 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103563  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3480  hypothetical protein  39.11 
 
 
394 aa  261  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.470485 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2671  aminotransferase  35.86 
 
 
397 aa  261  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1677  aminotransferase class I and II  38.12 
 
 
392 aa  261  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.206654  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3104  aminotransferase  39.02 
 
 
398 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0616  aminotransferase  38.86 
 
 
397 aa  261  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736327  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4903  aminotransferase class I and II  37.86 
 
 
392 aa  260  3e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234248  hitchhiker  0.00232672 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0890  aminotransferase  38.97 
 
 
398 aa  260  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04129  hypothetical protein  38.52 
 
 
394 aa  260  3e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.926001  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2920  aminotransferase  37.44 
 
 
398 aa  259  4e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.493105  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0865  aminotransferase  37.11 
 
 
381 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.424405  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2537  aminotransferase  37.43 
 
 
381 aa  258  9e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7413  normal  0.0409069 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0739  aminotransferase class I and II  36.87 
 
 
400 aa  258  2e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207853  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2888  aminotransferase  37.16 
 
 
398 aa  256  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.790701  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3474  aminotransferase class I and II  40 
 
 
393 aa  256  4e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.151006 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1903  aminotransferase, class I and II  33.94 
 
 
396 aa  256  5e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0815  aminotransferase  39.79 
 
 
398 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2269  aminotransferase class I and II  35.9 
 
 
412 aa  255  7e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0907  aminotransferase, class I  34.31 
 
 
387 aa  255  1.0000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0895132  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4055  aminotransferase  39.53 
 
 
414 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3584  hypothetical protein  38.16 
 
 
393 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42630  hypothetical protein  38.2 
 
 
391 aa  255  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.385949  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0824  aminotransferase  40.05 
 
 
398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62480  hypothetical protein  38.58 
 
 
390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0911  aminotransferase, class I  34.31 
 
 
387 aa  253  5.000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.390413  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  39.78 
 
 
387 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  34.37 
 
 
395 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0931  aminotransferase A  38.92 
 
 
382 aa  252  7e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2443  aminotransferase  39.53 
 
 
398 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693278  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0742  hypothetical protein  38.73 
 
 
390 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107858  hitchhiker  0.00000000116369 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2938  aminotransferase  36.17 
 
 
396 aa  251  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  36.34 
 
 
388 aa  250  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2229  aminotransferase  36.08 
 
 
394 aa  251  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.346154  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  39.33 
 
 
387 aa  250  4e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2710  aminotransferase A  38.31 
 
 
387 aa  249  7e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3951  aminotransferase class I and II  35.45 
 
 
387 aa  248  9e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  39.33 
 
 
387 aa  248  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1476  aspartate aminotransferase  37.5 
 
 
384 aa  247  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3658  aminotransferase class I and II  35.19 
 
 
387 aa  247  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0475  aminotransferase  39.53 
 
 
398 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0954  aminotransferase  39.53 
 
 
398 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  38.76 
 
 
385 aa  247  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4556  hypothetical protein  39.26 
 
 
390 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331626  hitchhiker  0.00000115439 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4692  hypothetical protein  39.26 
 
 
390 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246036 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  38.76 
 
 
387 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5290  aspartate aminotransferase  36.87 
 
 
384 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.084891 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  39.33 
 
 
387 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4690  hypothetical protein  38.99 
 
 
390 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000279841 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13598  aspartate aminotransferase  37.27 
 
 
388 aa  245  9e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0143941  normal  0.389087 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  38.48 
 
 
387 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  38.48 
 
 
387 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0916  aminotransferase  39.47 
 
 
398 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.403355  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  37.25 
 
 
370 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  35.79 
 
 
375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  36.44 
 
 
392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0276062 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>