More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0439 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  100 
 
 		 517 aa  1043    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  46.52 
 
 		 547 aa  426  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  45.4 
 
 		 520 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  43.67 
 
 		 500 aa  385  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2689  GntR family transcriptional regulator  33.27 
 
 		 498 aa  302  1e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00169618  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  36.68 
 
 		 498 aa  300  5e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 477 aa  291  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  36.61 
 
 		 493 aa  284  3.0000000000000004e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 397 aa  283  7.000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  39.15 
 
 		 400 aa  281  2e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0901  putative transcriptional regulator  33.27 
 
 		 554 aa  276  9e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  41.51 
 
 		 397 aa  275  2.0000000000000002e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.43 
 
 		 468 aa  271  2.9999999999999997e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 340 aa  269  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 383 aa  269  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  39.23 
 
 		 397 aa  266  8.999999999999999e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 450 aa  263  6e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 403 aa  261  2e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  38.21 
 
 		 463 aa  261  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 398 aa  260  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0411  aminotransferase  35.03 
 
 		 405 aa  259  7e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.894171  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2742  transcriptional regulator, GntR family  31.79 
 
 		 482 aa  259  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.254452  hitchhiker  0.00000487111 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  39.95 
 
 		 393 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  39.33 
 
 		 398 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  38.94 
 
 		 406 aa  256  6e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  37.14 
 
 		 440 aa  256  6e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  38.76 
 
 		 398 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2525  transcriptional regulator  30.9 
 
 		 482 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0126099  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 399 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2581  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 482 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  38.38 
 
 		 399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  36.86 
 
 		 446 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 409 aa  254  4.0000000000000004e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 401 aa  253  7e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  35.48 
 
 		 401 aa  252  1e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  38.83 
 
 		 417 aa  252  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 393 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2665  transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 		 482 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.135654  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  38.93 
 
 		 393 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  38.93 
 
 		 393 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2434  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 482 aa  251  3e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523883  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2355  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 482 aa  251  3e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2609  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 482 aa  251  3e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2626  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 		 482 aa  251  3e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000240701 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2627  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 482 aa  250  4e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0343754  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 393 aa  250  4e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  38.68 
 
 		 393 aa  250  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2749  transcriptional regulator, GntR family  32.09 
 
 		 477 aa  250  5e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 386 aa  250  5e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  38.05 
 
 		 420 aa  249  6e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2389  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 477 aa  249  7e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  31.94 
 
 		 477 aa  249  7e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  32.65 
 
 		 484 aa  249  7e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 406 aa  249  7e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  38.81 
 
 		 393 aa  249  9e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  38.87 
 
 		 407 aa  249  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  38.3 
 
 		 433 aa  249  1e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2769  GntR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 477 aa  248  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000296805  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  38.42 
 
 		 393 aa  248  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 393 aa  248  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 398 aa  248  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1240  transcriptional regulator  31.33 
 
 		 478 aa  248  3e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  37.77 
 
 		 432 aa  247  4e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 399 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 395 aa  246  9e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 413 aa  245  9.999999999999999e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  37.98 
 
 		 406 aa  244  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2506  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 477 aa  244  3e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00205118  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 480 aa  244  3e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 480 aa  243  5e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 480 aa  243  5e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  30.6 
 
 		 483 aa  243  7e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2745  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  31.54 
 
 		 477 aa  243  7e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.59979e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2472  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 477 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.656755  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 395 aa  243  7.999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2550  GntR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 477 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241547  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 480 aa  242  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  30.6 
 
 		 480 aa  242  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  30.6 
 
 		 480 aa  242  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2737  GntR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 477 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  37.54 
 
 		 426 aa  242  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2469  transcriptional regulator  30.32 
 
 		 503 aa  242  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0495293  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1052  putative transcriptional regulator, GntR family  37.98 
 
 		 398 aa  242  1e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1924  GntR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 468 aa  242  1e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2409  transcriptional regulator  31.67 
 
 		 479 aa  241  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00453228  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 395 aa  241  2e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  34.42 
 
 		 436 aa  241  2e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  36.59 
 
 		 438 aa  241  2e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  30.39 
 
 		 480 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2212  GntR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 468 aa  241  2e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2708  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 477 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0205476  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 480 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 395 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  35.97 
 
 		 400 aa  240  5e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  37.83 
 
 		 437 aa  240  5.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0093  putative transcriptional regulator, GntR family  35.49 
 
 		 425 aa  239  5.999999999999999e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  36.58 
 
 		 611 aa  239  6.999999999999999e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  30.02 
 
 		 480 aa  239  8e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  35.15 
 
 		 430 aa  239  8e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  31.4 
 
 		 396 aa  239  1e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>