More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0393 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0393  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
283 aa  580  1e-164  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  31.6 
 
 
297 aa  112  9e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  25.78 
 
 
300 aa  106  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  27.75 
 
 
299 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  26.87 
 
 
299 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  30.26 
 
 
274 aa  101  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  30.7 
 
 
517 aa  100  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  27.23 
 
 
283 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1388  putative signal transduction protein  29.64 
 
 
282 aa  100  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  28.86 
 
 
285 aa  99  7e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  28.9 
 
 
298 aa  98.6  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  28.02 
 
 
284 aa  98.2  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  25.33 
 
 
297 aa  97.4  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  29.82 
 
 
282 aa  97.4  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  27.23 
 
 
283 aa  97.8  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  28.38 
 
 
302 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  29.34 
 
 
340 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  28.04 
 
 
407 aa  95.9  7e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  25.34 
 
 
303 aa  95.1  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  26.36 
 
 
282 aa  95.1  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1992  putative signal transduction protein  27.87 
 
 
287 aa  92.8  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.880925  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2233  putative signal transduction protein  27.46 
 
 
456 aa  92.8  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  24.36 
 
 
298 aa  92.4  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2207  putative signal transduction protein  27.62 
 
 
281 aa  92.4  8e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00317318  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  28.2 
 
 
284 aa  91.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  28.22 
 
 
304 aa  90.9  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  24.44 
 
 
297 aa  91.3  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  26.75 
 
 
279 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  27.31 
 
 
279 aa  90.1  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  27.98 
 
 
287 aa  90.1  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  23.38 
 
 
290 aa  89.4  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2635  metal dependent phosphohydrolase  27.16 
 
 
283 aa  89.4  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1670  putative signal transduction protein  26.34 
 
 
297 aa  89  7e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  26.82 
 
 
302 aa  89  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  27.95 
 
 
297 aa  88.6  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  25.84 
 
 
284 aa  88.6  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  27.71 
 
 
275 aa  87.8  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 
286 aa  87.8  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  27.54 
 
 
280 aa  87.4  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  27.44 
 
 
291 aa  87.4  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  27.75 
 
 
280 aa  87  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  28.26 
 
 
281 aa  87  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  25.32 
 
 
412 aa  87  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  27.98 
 
 
285 aa  86.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  26.02 
 
 
291 aa  86.3  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  26.39 
 
 
284 aa  86.3  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  23.27 
 
 
280 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  25.6 
 
 
289 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  23.55 
 
 
283 aa  84.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2422  cyclic nucleotide-binding protein  31.43 
 
 
430 aa  84.7  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4397  putative signal transduction protein  28.5 
 
 
422 aa  84.3  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  28.51 
 
 
408 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  24.29 
 
 
292 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3649  hypothetical protein  27.72 
 
 
283 aa  84  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0674  hypothetical protein  27.92 
 
 
284 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  23.36 
 
 
275 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  25.76 
 
 
280 aa  82.8  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  24.36 
 
 
505 aa  82.8  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  27.09 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  28.94 
 
 
291 aa  82.4  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  28.81 
 
 
287 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  24.57 
 
 
274 aa  81.3  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1469  putative signal transduction protein  27.83 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  27.59 
 
 
716 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  26.6 
 
 
274 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  26.6 
 
 
274 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5311  putative signal transduction protein  27.45 
 
 
467 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0528676 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  29.07 
 
 
397 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  24.29 
 
 
289 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  26.44 
 
 
279 aa  80.5  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5359  putative signal transduction protein  26.97 
 
 
467 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.42347 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1061  putative signal transduction protein  26.42 
 
 
271 aa  80.1  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.580141  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5220  putative signal transduction protein  27.62 
 
 
467 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.743433 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  26.89 
 
 
378 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1772  metal dependent phosphohydrolase  25.44 
 
 
440 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0702712  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  25.21 
 
 
287 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0162  putative signal transduction protein  27.62 
 
 
467 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.229614 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2873  diguanylate cyclase  22.39 
 
 
650 aa  79.3  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  27.8 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  27.32 
 
 
455 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  26.32 
 
 
274 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  25.81 
 
 
289 aa  79  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  25.98 
 
 
718 aa  79  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  22.26 
 
 
287 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0200  hypothetical protein  27.18 
 
 
465 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.41443  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.91 
 
 
412 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5352  signal transduction protein  23.11 
 
 
288 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194147  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4398  putative signal transduction protein  26.47 
 
 
468 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.30911 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  25.54 
 
 
369 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02425  putative signal transduction protein  28.31 
 
 
281 aa  78.2  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.885003  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  22.77 
 
 
297 aa  77  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2268  putative signal transduction protein  25.77 
 
 
277 aa  76.6  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  29.74 
 
 
397 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  24.22 
 
 
352 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0348  putative signal transduction protein  24.36 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000208885 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2988  putative signal transduction protein  24.14 
 
 
281 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1996  putative signal transduction protein  27.06 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.490329  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1708  putative signal transduction protein  27.06 
 
 
274 aa  76.3  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.538449  normal  0.498965 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0064  hypothetical protein  27.18 
 
 
465 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  25.35 
 
 
427 aa  75.5  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>