More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0365 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0365  Nucleotidyl transferase  100 
 
 
355 aa  726    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0529  Nucleotidyl transferase  59.71 
 
 
352 aa  434  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4088  nucleotidyl transferase  49.4 
 
 
351 aa  339  4e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0598  nucleotidyl transferase  43.2 
 
 
348 aa  314  9.999999999999999e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.534705  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2301  nucleotidyl transferase  44.78 
 
 
348 aa  308  1.0000000000000001e-82  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2335  putative sugar-phosphate nucleotide transferase  41.4 
 
 
352 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0321237  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1580  nucleotidyl transferase  41.23 
 
 
352 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.995766  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14051  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  38.35 
 
 
356 aa  280  3e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3102  mannose-1-phosphate guanyltransferase  41.42 
 
 
352 aa  278  8e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2982  nucleotidyl transferase  40.46 
 
 
350 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0566081  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3126  nucleotidyl transferase  40.46 
 
 
350 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2394  nucleotidyl transferase  41.52 
 
 
346 aa  275  9e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3979  Nucleotidyl transferase  39.83 
 
 
360 aa  273  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4857  nucleotidyl transferase  42.15 
 
 
351 aa  273  4.0000000000000004e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  0.292001 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0633  Nucleotidyl transferase  39.88 
 
 
353 aa  272  7e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00676  mannose-1-phosphate guanyltransferase  43.23 
 
 
352 aa  271  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001798  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  40.35 
 
 
352 aa  271  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0560  nucleotidyl transferase  41.57 
 
 
351 aa  267  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0256  nucleotidyl transferase  40.17 
 
 
352 aa  253  3e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01171  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  41.8 
 
 
320 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0167  nucleotidyl transferase  40.17 
 
 
352 aa  253  3e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1968  nucleotidyltransferase family protein  38.26 
 
 
476 aa  251  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0051  nucleotidyl transferase  40.06 
 
 
351 aa  250  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1456  nucleotidyl transferase  37.57 
 
 
361 aa  243  3e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1518  nucleotidyltransferase family protein  34.91 
 
 
341 aa  240  2.9999999999999997e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.973367  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12391  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  38.66 
 
 
353 aa  239  4e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0812001  normal  0.0145083 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2585  nucleotidyl transferase  36.07 
 
 
367 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000196984 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0380  nucleotidyltransferase family protein  35.03 
 
 
341 aa  236  3e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1231  flagellin modification protein PtmE, putative sugar-phosphate nucleotide transferase  33.92 
 
 
345 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000208573  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0757  nucleotidyl transferase  36.56 
 
 
354 aa  218  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.550626 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1584  nucleotidyl transferase  41.3 
 
 
238 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2643  nucleotidyl transferase  32.08 
 
 
348 aa  171  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  39.73 
 
 
818 aa  159  5e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  40.55 
 
 
827 aa  158  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4077  nucleotidyl transferase  39.45 
 
 
238 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.957763  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  38.89 
 
 
816 aa  153  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3557  nucleotidyl transferase  35.91 
 
 
238 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4321  Nucleotidyl transferase  33.04 
 
 
238 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  39.17 
 
 
820 aa  150  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  36.4 
 
 
349 aa  150  5e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0409  Nucleotidyl transferase  38.6 
 
 
237 aa  149  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149684  normal  0.359368 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3723  Nucleotidyl transferase  35.65 
 
 
240 aa  147  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  37.28 
 
 
784 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  36.36 
 
 
828 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  40.91 
 
 
835 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  37.99 
 
 
841 aa  145  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  39.81 
 
 
820 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  37.96 
 
 
830 aa  144  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0541  nucleotidyl transferase  33.18 
 
 
238 aa  142  8e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  36.4 
 
 
784 aa  142  8e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  36.4 
 
 
784 aa  142  9e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0885  Nucleotidyl transferase  32.6 
 
 
229 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  37.5 
 
 
810 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  37.61 
 
 
843 aa  141  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  38.05 
 
 
842 aa  139  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  38.53 
 
 
832 aa  139  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  37.39 
 
 
832 aa  139  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  35.53 
 
 
784 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  35.53 
 
 
784 aa  138  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  35.53 
 
 
784 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  38.25 
 
 
833 aa  138  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  35.53 
 
 
784 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  35.53 
 
 
784 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  35.96 
 
 
785 aa  138  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  37.22 
 
 
828 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  35.32 
 
 
396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  35.53 
 
 
784 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  34.21 
 
 
836 aa  137  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  35.53 
 
 
784 aa  137  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7616  Nucleotidyl transferase  36.4 
 
 
364 aa  136  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0702464  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3465  Nucleotidyl transferase  34.21 
 
 
836 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  37.12 
 
 
843 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1855  Nucleotidyl transferase  37.95 
 
 
370 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  37.17 
 
 
842 aa  135  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  37.33 
 
 
842 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5876  nucleotidyl transferase  37.27 
 
 
357 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.624445  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  36.99 
 
 
842 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  31.14 
 
 
348 aa  133  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  35.09 
 
 
821 aa  133  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  37.89 
 
 
828 aa  133  5e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  34.93 
 
 
834 aa  133  6e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  37.1 
 
 
833 aa  132  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  34.08 
 
 
835 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  35.65 
 
 
818 aa  132  9e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  37.95 
 
 
840 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  38.07 
 
 
832 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
835 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1729  nucleotidyl transferase  36.04 
 
 
359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442987  normal  0.868818 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  37.33 
 
 
841 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  33.48 
 
 
347 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  36.12 
 
 
827 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  32.89 
 
 
835 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  37.67 
 
 
828 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0737  nucleotidyl transferase  36.36 
 
 
357 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.879816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1374  mannose-1-phosphate guanyltransferase  35.06 
 
 
364 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  33.33 
 
 
836 aa  127  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1489  nucleotidyl transferase  35.9 
 
 
230 aa  127  3e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.523541  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  33.04 
 
 
347 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  37.16 
 
 
830 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  36.04 
 
 
363 aa  125  9e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>