221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0347 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0347  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 117 aa  243  6.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0720  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  48.18 
 
 		 110 aa  108  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1795  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  37.04 
 
 		 110 aa  94.7  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1039  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  38.68 
 
 		 112 aa  83.6  8e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.305591  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0862  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  37.74 
 
 		 112 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.895218  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0751  anti-sigma-factor antagonist  36.94 
 
 		 111 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0517631  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1526  anti-sigma-factor antagonist  39.39 
 
 		 111 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  33.96 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0062  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.46 
 
 		 116 aa  79  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0726506 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1873  anti-sigma-factor antagonist  33.93 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.108927  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1663  anti-anti-sigma factor family protein  37.65 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.88575  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2467  anti-sigma-factor antagonist  32.46 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0932  anti-sigma-factor antagonist  30.19 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.554798  normal  0.118928 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  34.02 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1178  anti-sigma-factor antagonist  37.8 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.0000418281  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  30.93 
 
 		 269 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2440  anti-sigma-factor antagonist  34.04 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1492  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0707  anti-anti-sigma factor  26.55 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0434926  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0701  anti-sigma-factor antagonist  30.61 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2983  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 111 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2160  anti-sigma-factor antagonist  31.68 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1146  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  26.8 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0512464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  30.28 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0702  anti-sigma-factor antagonist  26.8 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  27.84 
 
 		 250 aa  60.8  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  28.3 
 
 		 120 aa  60.1  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  27.55 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1194  anti-sigma-factor antagonist  30.69 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179967  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1431  anti-anti-sigma factor family protein  24.78 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  23.42 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  28 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2937  anti-sigma-factor antagonist  31.76 
 
 		 101 aa  58.2  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2556  anti-sigma-factor antagonist  29.59 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2436  anti-sigma-factor antagonist  29.9 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000162384  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2062  anti-sigma F factor antagonist (stage II sporulation protein AA)  31.96 
 
 		 99 aa  57.8  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.360402  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  31.71 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  25.96 
 
 		 249 aa  58.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1995  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  30.91 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.400716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0046  anti-sigma-factor antagonist  30.61 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  27.06 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4443  anti-sigma-factor antagonist  30.39 
 
 		 114 aa  57  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  27.5 
 
 		 115 aa  57  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  26.42 
 
 		 112 aa  57  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  27.78 
 
 		 117 aa  57  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  29.59 
 
 		 116 aa  57  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  28.57 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  28.57 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4094  anti-sigma-factor antagonist  26 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  28.57 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  26.8 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  28.57 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  28.57 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  28.57 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  28.57 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  28.57 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  28.57 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1930  anti-sigma-factor antagonist  28.28 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0790604  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  26 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  28.57 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  24.74 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2860  anti-anti-sigma factor  28.57 
 
 		 429 aa  55.1  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  30.56 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4431  anti-sigma-factor antagonist  28.05 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0194  anti-sigma F factor antagonist  27.84 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0177  anti-sigma-factor antagonist  30.49 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3440  anti-sigma-factor antagonist  31.4 
 
 		 115 aa  53.5  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0146  anti-anti-sigma factor  25 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0642638  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  32.99 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2057  anti-anti-sigma factor  27.03 
 
 		 117 aa  52.8  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1017  anti-sigma-factor antagonist  28 
 
 		 117 aa  53.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.128025  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  25.27 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  25 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1430  anti-sigma-factor antagonist  28.12 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2330  anti-sigma-factor antagonist  25.74 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1084  anti sigma b factor antagonist RsbV  25 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2067  anti-sigma-factor antagonist  25.74 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  26 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  25 
 
 		 112 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  29.35 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  29.35 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  26.6 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1506  anti-sigma-factor antagonist  31.68 
 
 		 405 aa  51.6  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2064  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0033219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  26.42 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1451  hypothetical protein  26.53 
 
 		 98 aa  51.2  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1663  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.457146  normal  0.122734 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  23.68 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  25.66 
 
 		 115 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  27.06 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  27.06 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3235  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  26.83 
 
 		 437 aa  50.8  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  26.74 
 
 		 109 aa  50.4  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4407  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 127 aa  50.1  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.508963  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3738  anti-sigma-factor antagonist  26 
 
 		 121 aa  50.4  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2462  anti-sigma-factor antagonist  26.74 
 
 		 142 aa  50.1  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  22.83 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1161  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 436 aa  49.7  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.871215  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>