214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0329 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0329  Paraquat-inducible protein A  100 
 
 		 210 aa  418  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0258  paraquat-inducible protein A  81.25 
 
 		 212 aa  340  1e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44080  PqiA family protein  59.8 
 
 		 208 aa  240  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179105  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0402  paraquat-inducible protein A  59.13 
 
 		 213 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2673  paraquat-inducible protein A  57.14 
 
 		 209 aa  228  6e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.44394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  55.17 
 
 		 423 aa  222  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2678  paraquat-inducible protein A  53.85 
 
 		 252 aa  221  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0039  putative paraquat-inducible protein  55.39 
 
 		 220 aa  219  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.355976  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2534  paraquat-inducible protein A  50.48 
 
 		 224 aa  219  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0580  paraquat-inducible protein A  53.11 
 
 		 249 aa  218  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0166734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1999  Paraquat-inducible protein A  54.85 
 
 		 215 aa  217  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0518  Paraquat-inducible protein A  52.02 
 
 		 245 aa  216  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  51.15 
 
 		 449 aa  214  7e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0639  paraquat-inducible protein A  53.2 
 
 		 207 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4564  paraquat-inducible protein A  53.69 
 
 		 207 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0627  paraquat-inducible protein A  57.21 
 
 		 209 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0603  paraquat-inducible protein A  57.21 
 
 		 209 aa  211  7e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3999  putative paraquat-inducible protein  53.43 
 
 		 216 aa  210  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.5072 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0708  Paraquat-inducible protein A  53.43 
 
 		 220 aa  210  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.773576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0531  Paraquat-inducible protein A  50.67 
 
 		 245 aa  210  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1571  paraquat-inducible protein A  52.5 
 
 		 216 aa  210  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0228  paraquat-inducible protein A  56.04 
 
 		 211 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0712  paraquat-inducible protein A  56.04 
 
 		 211 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0679  paraquat-inducible protein A  56.04 
 
 		 211 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3800  paraquat-inducible protein A  56.22 
 
 		 209 aa  207  7e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1269  hypothetical protein  53.24 
 
 		 220 aa  207  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0293  paraquat-inducible protein A  53.46 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1155  paraquat-inducible protein A  53.46 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3339  paraquat-inducible protein A  53.46 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3373  paraquat-inducible protein A  53.46 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0644  paraquat-inducible protein A  52.22 
 
 		 207 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00578555 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4781  paraquat-inducible protein A  51.72 
 
 		 207 aa  202  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3381  putative paraquat-inducible protein  54.41 
 
 		 209 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1014  paraquat-inducible protein A  52.2 
 
 		 205 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3044  paraquat-inducible protein A  50 
 
 		 204 aa  197  9e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.123343 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42460  Paraquat-inducible protein A  49.26 
 
 		 207 aa  197  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5397  paraquat-inducible protein A  50.25 
 
 		 206 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36030  paraquat-inducible protein A  50.25 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000103971 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62030  paraquat-inducible protein A-like protein  50.25 
 
 		 206 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0602  hypothetical protein  50.46 
 
 		 247 aa  193  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0796336  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6817  paraquat-inducible protein A  50 
 
 		 215 aa  192  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3510  hypothetical protein  51.27 
 
 		 464 aa  189  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.21998  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3375  paraquat-inducible protein A  51.78 
 
 		 212 aa  187  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541727 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2007  hypothetical protein  51.23 
 
 		 444 aa  185  5e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3536  PqiA family integral membrane protein  51.01 
 
 		 449 aa  185  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2894  Paraquat-inducible protein A  50.99 
 
 		 238 aa  184  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.174277  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3289  paraquat-inducible protein A  47.98 
 
 		 214 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3140  paraquat-inducible protein A  48.73 
 
 		 209 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2440  paraquat-inducible protein A  48.77 
 
 		 223 aa  177  9e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3243  Paraquat-inducible protein A  51.71 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2581  paraquat-inducible protein A  49.51 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.502508 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2933  PqiA family integral membrane protein  45.96 
 
 		 423 aa  174  9e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5277  PqiA family integral membrane protein  48.02 
 
 		 460 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003029  paraquat-inducible protein A  44.78 
 
 		 401 aa  172  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02850  hypothetical protein  44.55 
 
 		 426 aa  171  5.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5801  PqiA family integral membrane protein  48.99 
 
 		 462 aa  171  9e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0413945  hitchhiker  0.00262359 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1108  hypothetical protein  44 
 
 		 419 aa  169  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000845315  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1351  paraquat-inducible protein A  47.21 
 
 		 434 aa  166  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00603606  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3327  paraquat-inducible protein A  42.16 
 
 		 201 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.695464  normal  0.406152 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3076  PqiA family integral membrane protein  47.51 
 
 		 405 aa  160  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1669  PqiA family integral membrane protein  43.39 
 
 		 415 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000392356  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1780  PqiA family integral membrane protein  43.39 
 
 		 450 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2666  PqiA family integral membrane protein  43.39 
 
 		 450 aa  158  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00001448  normal  0.0124404 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2114  PqiA family integral membrane protein  45.86 
 
 		 426 aa  158  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387585  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1864  PqiA family integral membrane protein  45.86 
 
 		 426 aa  158  6e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0424283 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1705  PqiA family integral membrane protein  52.41 
 
 		 402 aa  158  7e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1919  PqiA family integral membrane protein  42.11 
 
 		 427 aa  158  7e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2721  hypothetical protein  42.36 
 
 		 413 aa  157  8e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2073  PqiA family integral membrane protein  47.8 
 
 		 406 aa  155  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2693  paraquat-inducible protein A  44.78 
 
 		 219 aa  155  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2403  PqiA family integral membrane protein  39.2 
 
 		 427 aa  154  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1540  paraquat-inducible membrane protein A  40 
 
 		 408 aa  153  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.541735  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1446  Paraquat-inducible protein A  43.94 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.257026  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1570  paraquat-inducible protein A  39.81 
 
 		 204 aa  152  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1668  paraquat-inducible protein A  39.8 
 
 		 205 aa  152  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00504081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1743  paraquat-inducible protein A  39.8 
 
 		 205 aa  152  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1069  hypothetical protein  35.12 
 
 		 417 aa  151  7e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.633648  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1989  paraquat-inducible protein A  40.7 
 
 		 428 aa  150  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2550  paraquat-inducible protein A  40.7 
 
 		 428 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.731619  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2639  PqiA family integral membrane protein  40.7 
 
 		 428 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1651  integral membrane protein, PqiA family  41.87 
 
 		 422 aa  150  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1114  paraquat-inducible protein A  39.7 
 
 		 417 aa  149  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0100863  normal  0.917256 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1797  paraquat-inducible protein A  37.25 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0702887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2169  paraquat-inducible protein A  39.7 
 
 		 417 aa  149  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000394614  normal  0.228835 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02350  hypothetical protein  41.62 
 
 		 324 aa  149  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003427  paraquat-inducible protein A  42.41 
 
 		 416 aa  149  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0651922  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2207  paraquat-inducible protein A  38.73 
 
 		 210 aa  149  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584508  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2445  paraquat-inducible protein A  39.3 
 
 		 205 aa  148  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00132645  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2565  paraquat-inducible protein A  39.3 
 
 		 205 aa  148  5e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.56837  normal  0.166721 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2452  paraquat-inducible protein A  39.3 
 
 		 205 aa  148  6e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.241615  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1462  PqiA family integral membrane protein  40.7 
 
 		 417 aa  147  8e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.103115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2116  PqiA family integral membrane protein  43.92 
 
 		 416 aa  147  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.327223  decreased coverage  0.0000761316 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1899  Paraquat-inducible protein A  39.3 
 
 		 205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00518093  normal  0.194371 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00954  paraquat-inducible membrane protein A  39.2 
 
 		 417 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000174021  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2693  integral membrane protein, PqiA family  39.2 
 
 		 417 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.098958  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02655  integral membrane protein, PqiA family  44.81 
 
 		 380 aa  146  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.399105  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2646  PqiA family integral membrane protein  39.2 
 
 		 417 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.00049713 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1059  paraquat-inducible protein A  39.2 
 
 		 417 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000508779  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2367  paraquat-inducible protein A  39.2 
 
 		 417 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.658309  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1065  paraquat-inducible protein A  39.2 
 
 		 417 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>