25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0311 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0311  hypothetical protein  100 
 
 		 535 aa  1110    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000410606  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1882  hypothetical protein  40.41 
 
 		 552 aa  436  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785906 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0197  hypothetical protein  40.46 
 
 		 555 aa  415  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2025  hypothetical protein  40.38 
 
 		 554 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0121  hypothetical protein  42.47 
 
 		 558 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2324  FG-GAP repeat protein  35.58 
 
 		 561 aa  346  6e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000100122  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1746  hypothetical protein  26.94 
 
 		 614 aa  189  8e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000631337  hitchhiker  0.00120069 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0012  integrin-like repeat-containing protein  26.61 
 
 		 565 aa  172  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257714  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3256  hypothetical protein  23.11 
 
 		 510 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000373547  hitchhiker  9.15864e-19 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3306  hypothetical protein  22.96 
 
 		 505 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00244316  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0660  hypothetical protein  22.18 
 
 		 492 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00298688  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0520  hypothetical protein  21.33 
 
 		 505 aa  75.1  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000613286  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3253  hypothetical protein  21.07 
 
 		 510 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000436664  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2185  hypothetical protein  22.07 
 
 		 498 aa  68.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000017001  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0939  FG-GAP repeat protein  20.47 
 
 		 568 aa  65.1  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.659758  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  31.4 
 
 		 888 aa  61.2  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1310  hypothetical protein  22.78 
 
 		 376 aa  56.6  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0554  hypothetical protein  19.18 
 
 		 476 aa  53.9  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000494552  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0567  hypothetical protein  20.59 
 
 		 476 aa  53.9  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.15788e-22 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.15 
 
 		 895 aa  50.8  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2475  hypothetical protein  28.57 
 
 		 312 aa  47.4  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000341463  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0891  surface antigen (D15)  25.56 
 
 		 896 aa  47.4  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.32 
 
 		 892 aa  47  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.82 
 
 		 895 aa  45.4  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0323  TPR repeat-containing protein  23.37 
 
 		 212 aa  44.7  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00135307  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>