27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0310 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0310  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  878    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000163597  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1011  hypothetical protein  37.04 
 
 
448 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000669415  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2176  hypothetical protein  34.76 
 
 
466 aa  224  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000312867  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2846  hypothetical protein  33.68 
 
 
464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1010  hypothetical protein  35.96 
 
 
447 aa  219  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.395908  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2177  hypothetical protein  34.36 
 
 
476 aa  216  5e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00360265  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2562  hypothetical protein  30.74 
 
 
474 aa  205  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382555 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2707  hypothetical protein  33.05 
 
 
460 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.205798  normal  0.461713 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2558  hypothetical protein  33.33 
 
 
471 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1883  hypothetical protein  34.07 
 
 
476 aa  196  6e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0565061  hitchhiker  0.00344442 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0563  hypothetical protein  29.56 
 
 
510 aa  171  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1248  hypothetical protein  30.78 
 
 
542 aa  160  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0419522  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0582  hypothetical protein  28.27 
 
 
505 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000609741  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1856  hypothetical protein  26.08 
 
 
543 aa  138  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1413  hypothetical protein  24.9 
 
 
510 aa  123  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2095  hypothetical protein  23.96 
 
 
529 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1745  hypothetical protein  31.55 
 
 
534 aa  66.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000216111  unclonable  0.0000185199 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0570  hypothetical protein  32.06 
 
 
433 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.74433e-18 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3254  LamB porin family protein, putative  29.63 
 
 
472 aa  57.4  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000126624  decreased coverage  1.37943e-21 
 
 
 
NC_008609  Ppro_0521  LamB porin family protein, putative  35.65 
 
 
464 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000174972  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3304  LamB porin family protein, putative  35.53 
 
 
457 aa  48.9  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00991387  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0557  hypothetical protein  32.5 
 
 
452 aa  47.4  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000338101  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3403  hypothetical protein  31.68 
 
 
460 aa  45.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0717001  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2284  hypothetical protein  29.75 
 
 
447 aa  44.7  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000344842 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0011  hypothetical protein  30 
 
 
435 aa  43.9  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000177215  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1309  hypothetical protein  24.74 
 
 
381 aa  43.9  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1933  hypothetical protein  27.82 
 
 
434 aa  43.1  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000351856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>