33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0270 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0270  Nitrate reductase gamma subunit  100 
 
 
337 aa  691    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00809754  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0235  Nitrate reductase gamma subunit  68.98 
 
 
332 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.911573  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1602  nitrate reductase, gamma subunit  60.62 
 
 
330 aa  411  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000153702  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2271  nitrate reductase, gamma subunit, putative  61.14 
 
 
334 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.237982  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0256  Nitrate reductase gamma subunit  55.86 
 
 
333 aa  402  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1146  nitrate reductase, gamma subunit  60.26 
 
 
330 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.247321  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0070  Nitrate reductase gamma subunit  58.61 
 
 
335 aa  388  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.289973 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0450  nitrate reductase gamma subunit  55.65 
 
 
342 aa  386  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00150566  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1849  Nitrate reductase gamma subunit  57.14 
 
 
331 aa  384  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000160376  normal  0.155774 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1775  nitrate reductase, gamma subunit  58.43 
 
 
334 aa  379  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.377874  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0044  DsrM protein  50.46 
 
 
331 aa  344  1e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.877712 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0037  Nitrate reductase gamma subunit  50.76 
 
 
331 aa  343  2e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0703  Nitrate reductase gamma subunit  50.15 
 
 
331 aa  338  5.9999999999999996e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0396835  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0136  nitrate reductase, gamma subunit  49.54 
 
 
331 aa  337  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00937433  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2313  Nitrate reductase gamma subunit  48.63 
 
 
331 aa  329  4e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1948  DsrM protein  48.02 
 
 
332 aa  325  9e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.542498  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0451  Nitrate reductase gamma subunit  50.17 
 
 
339 aa  290  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.213571  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0049  nitrate reductase, gamma subunit  32.12 
 
 
233 aa  134  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000306057  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1957  nitrate reductase, gamma subunit  31.18 
 
 
248 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2191  Nitrate reductase gamma subunit  35.36 
 
 
249 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.258292  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1659  nitrate reductase, gamma subunit  32.87 
 
 
255 aa  124  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2479  putative DsrM protein  32.83 
 
 
244 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0343  nitrate reductase gamma subunit  24.81 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0242574 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0172  nitrate reductase, gamma subunit  24.81 
 
 
255 aa  65.5  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0075  Nitrate reductase gamma subunit  29.2 
 
 
289 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506128  hitchhiker  0.00856354 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3199  nitrate reductase, gamma subunit  27.2 
 
 
271 aa  59.3  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2192  hypothetical protein  28.08 
 
 
255 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0033  Nitrate reductase gamma subunit  29.07 
 
 
254 aa  55.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0852  nitrate reductase gamma subunit-like protein  27.16 
 
 
261 aa  55.5  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0248  Nitrate reductase gamma subunit  21.89 
 
 
299 aa  46.2  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0575  nitrate reductase gamma subunit  23.66 
 
 
277 aa  46.2  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0435677  normal  0.0173061 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0906  nitrate reductase, gamma subunit  26.04 
 
 
257 aa  43.9  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1535  nitrate reductase, gamma subunit  24.91 
 
 
262 aa  42.7  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>