More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0263 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  100 
 
 
360 aa  736    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0486  HflK protein  61.67 
 
 
361 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.333714 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  62.11 
 
 
359 aa  420  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  54.24 
 
 
388 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2279  HflK protein  56.47 
 
 
378 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  51.71 
 
 
387 aa  363  2e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  47.13 
 
 
367 aa  294  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  48.91 
 
 
385 aa  292  6e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  45.98 
 
 
407 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  43.73 
 
 
382 aa  276  3e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3262  HflK protein  45.35 
 
 
383 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.264682  normal  0.260183 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  44.57 
 
 
385 aa  273  3e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3352  HflK protein  45.29 
 
 
389 aa  272  7e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  44.25 
 
 
383 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2038  HflK protein  45.78 
 
 
390 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6097  protease activity modulator HflK  44.78 
 
 
379 aa  259  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1730  HflK protein  43.02 
 
 
389 aa  259  4e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000348315 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  40.43 
 
 
405 aa  259  4e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0604  HflK protein  45.57 
 
 
368 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0450848 
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  44.44 
 
 
344 aa  254  1.0000000000000001e-66  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  44.22 
 
 
398 aa  251  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  45.21 
 
 
413 aa  250  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  39.87 
 
 
395 aa  237  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  41.48 
 
 
403 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  40.28 
 
 
433 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2780  HflK protein  40.13 
 
 
379 aa  233  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1886  hflK protein  43.29 
 
 
397 aa  232  8.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1561  HflK protein  43.29 
 
 
397 aa  232  8.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.920628  hitchhiker  0.00000000145898 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3384  HflK protein  41.56 
 
 
359 aa  231  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16512  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1050  hflK protein  42.05 
 
 
357 aa  231  2e-59  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0701  HflK protein  38.41 
 
 
389 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704502  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2658  HflK protein  40.58 
 
 
382 aa  230  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2885  HflK protein  40.58 
 
 
382 aa  230  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0630  HflK protein  44.91 
 
 
309 aa  229  5e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  39.14 
 
 
393 aa  229  8e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1107  HflK protein  40.61 
 
 
308 aa  228  8e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0999  HflK protein  40.61 
 
 
308 aa  228  1e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1089  HflK protein  37.5 
 
 
386 aa  227  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2024  HflK protein  39.69 
 
 
379 aa  226  4e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  39.38 
 
 
436 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2262  HflK protein  38.62 
 
 
333 aa  226  6e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015812  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  39.08 
 
 
435 aa  225  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  39.31 
 
 
395 aa  225  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0843  HflK  40.73 
 
 
355 aa  223  4e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  38.82 
 
 
399 aa  222  6e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  39.64 
 
 
376 aa  222  6e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4527  HflK protein  41.18 
 
 
394 aa  222  7e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1397  hflK protein  37.68 
 
 
382 aa  222  9.999999999999999e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  40.52 
 
 
464 aa  220  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  40 
 
 
391 aa  219  5e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000287062 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  40.2 
 
 
451 aa  219  5e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  40.2 
 
 
451 aa  219  5e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0164  HflK protein  41.29 
 
 
347 aa  219  6e-56  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000564548  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  41.12 
 
 
475 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1353  band 7 protein:stomatin  37.39 
 
 
384 aa  218  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  40.52 
 
 
477 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2818  HFLK protein  36.63 
 
 
383 aa  217  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2018  HflK protein  39.68 
 
 
362 aa  216  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  40.2 
 
 
471 aa  216  7e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  37.22 
 
 
447 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  39.31 
 
 
406 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  39.75 
 
 
471 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1794  HflK protein  38.67 
 
 
383 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  37.95 
 
 
498 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  39.54 
 
 
474 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0702  HflK protein  38.43 
 
 
306 aa  211  2e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  38.08 
 
 
503 aa  211  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3678  HflK protein  38.79 
 
 
350 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  38.05 
 
 
457 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3613  HflK protein  38.67 
 
 
350 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2011  HflK protein  38.82 
 
 
378 aa  210  3e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166821  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0184  HflK protein  34.28 
 
 
350 aa  209  5e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464888  normal  0.739242 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2300  HflK protein  41.16 
 
 
464 aa  208  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194929  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3670  HflK protein  36.7 
 
 
399 aa  208  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119308  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2800  HflK protein  39.74 
 
 
360 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182223  normal  0.400207 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3522  HflK protein  39.58 
 
 
378 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  38.24 
 
 
452 aa  206  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1321  HflK protein  37.59 
 
 
331 aa  206  7e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1222  hypothetical protein  39.12 
 
 
447 aa  205  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0015724  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2194  HflK protein  37.58 
 
 
456 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0605  hflK protein  37.22 
 
 
381 aa  203  5e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0665  HflK protein  38.64 
 
 
322 aa  202  5e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3708  HflK protein  37.54 
 
 
379 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000788714  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3891  HflK protein  37.54 
 
 
379 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000465537  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0560  HflK protein  37.54 
 
 
379 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000508673  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3765  HflK protein  37.54 
 
 
379 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000022736  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0575  HflK protein  35.03 
 
 
459 aa  202  7e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289879  hitchhiker  0.000000000363385 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2541  HflK protein  38.08 
 
 
362 aa  202  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0003  HflK protein  44.2 
 
 
329 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2861  HflK protein  39.94 
 
 
393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  35.71 
 
 
400 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3203  HflK protein  34.87 
 
 
386 aa  199  6e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.143701  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  37.22 
 
 
393 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  36.33 
 
 
395 aa  199  7e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3430  HflK protein  35.6 
 
 
381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0909026  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1827  HflK protein  36.51 
 
 
437 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1338  ftsH protease activity modulator HflK  36.51 
 
 
437 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.123813  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0069  ftsH protease activity modulator HflK  36.51 
 
 
449 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2182  HflK protein  36.51 
 
 
454 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2220  HflK protein  36.51 
 
 
454 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>