77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0244 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0244  protein of unknown function DUF181  100 
 
 
555 aa  1123    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1835  hypothetical protein  43.03 
 
 
585 aa  404  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.444431  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3119  protein of unknown function DUF181  42.78 
 
 
590 aa  394  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0048478 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2408  hypothetical protein  41.65 
 
 
573 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115662  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1064  protein of unknown function DUF181  40.07 
 
 
604 aa  366  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000107969  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1373  hypothetical protein  38.93 
 
 
635 aa  322  8e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000799529  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1333  hypothetical protein  29.67 
 
 
404 aa  89.4  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157946  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1978  hypothetical protein  28.66 
 
 
403 aa  83.6  0.000000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.154455  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1401  hypothetical protein  30 
 
 
403 aa  83.2  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0527  hypothetical protein  28.48 
 
 
406 aa  77.8  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.518429 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3472  hypothetical protein  29.33 
 
 
389 aa  76.3  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4676  protein of unknown function DUF181  29.15 
 
 
752 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0821  hypothetical protein  26.32 
 
 
424 aa  74.3  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0310  hypothetical protein  26.21 
 
 
400 aa  74.7  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0379  hypothetical protein  25.79 
 
 
403 aa  74.3  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0537  hypothetical protein  26.5 
 
 
400 aa  73.9  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0125337  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2767  protein of unknown function DUF181  28.24 
 
 
757 aa  72.4  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128011  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1602  methanogenesis marker protein 1  26.21 
 
 
400 aa  71.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.192531  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6310  protein of unknown function DUF181  28.08 
 
 
443 aa  71.2  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0842  hypothetical protein  25.6 
 
 
404 aa  70.9  0.00000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0167577  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3967  hypothetical protein  26.24 
 
 
752 aa  70.5  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.154728 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1788  hypothetical protein  24.86 
 
 
746 aa  69.7  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0519  protein of unknown function DUF181  25.66 
 
 
762 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0591  NADPH-dependent FMN reductase  26.14 
 
 
403 aa  66.6  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0069008  hitchhiker  0.000778526 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0413  hypothetical protein  24.22 
 
 
584 aa  65.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4368  hypothetical protein  25.22 
 
 
727 aa  65.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.150776 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2957  protein of unknown function DUF181  26.29 
 
 
410 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6037  protein of unknown function DUF181  29.13 
 
 
420 aa  64.3  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463338  normal  0.501056 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2237  hypothetical protein  31.84 
 
 
397 aa  64.3  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3205  protein of unknown function DUF181  26.67 
 
 
391 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.687838  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2211  hypothetical protein  28.63 
 
 
404 aa  62.4  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471647  normal  0.108179 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2355  hypothetical protein  25 
 
 
769 aa  62  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.247728  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4504  hypothetical protein  24.75 
 
 
745 aa  62  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1738  protein of unknown function DUF181  25.9 
 
 
572 aa  62  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.858461 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  23.95 
 
 
575 aa  62  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7195  protein of unknown function DUF181  33.12 
 
 
420 aa  61.2  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175202  normal  0.168527 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0608  protein of unknown function DUF181  25.76 
 
 
388 aa  60.1  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1211  methanogenesis marker protein 1  29.46 
 
 
403 aa  60.1  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.882639 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0009  hypothetical protein  33.78 
 
 
353 aa  59.3  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.264047  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1001  protein of unknown function DUF181  25.15 
 
 
580 aa  59.3  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2348  hypothetical protein  25.93 
 
 
582 aa  57.4  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119117  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0517  hypothetical protein  27.3 
 
 
756 aa  56.6  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11147  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5723  hypothetical protein  24.07 
 
 
745 aa  56.6  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250134  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0004  protein of unknown function DUF181  26.04 
 
 
584 aa  56.6  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0544869 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5136  hypothetical protein  24.07 
 
 
745 aa  56.6  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00343987  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0880  hypothetical protein  25.14 
 
 
749 aa  55.5  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2261  hypothetical protein  25.75 
 
 
396 aa  54.3  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00608727  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2214  hypothetical protein  26.71 
 
 
763 aa  53.9  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2493  hypothetical protein  26.71 
 
 
763 aa  53.9  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3061  hypothetical protein  28.69 
 
 
736 aa  53.5  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493225  normal  0.24084 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5737  protein of unknown function DUF181  25.19 
 
 
750 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0622  hypothetical protein  26.71 
 
 
769 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.940579  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0023  hypothetical protein  26.71 
 
 
716 aa  53.5  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2869  hypothetical protein  26.71 
 
 
763 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0637  YcaO-like fatty acid binding domain-containing protein  26.71 
 
 
766 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4201  protein of unknown function DUF181  29.26 
 
 
647 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0013  hypothetical protein  29.93 
 
 
353 aa  52.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.077067  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0802  AknN  26.71 
 
 
844 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.919252  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2069  hypothetical protein  26.18 
 
 
426 aa  51.6  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0917  hypothetical protein  27.84 
 
 
437 aa  51.2  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3135  hypothetical protein  25.53 
 
 
745 aa  50.4  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.535305  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3864  protein of unknown function DUF181  27.91 
 
 
566 aa  50.4  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000000134117  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3716  hypothetical protein  29.73 
 
 
438 aa  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4992  hypothetical protein  25.23 
 
 
745 aa  48.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.934351  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1163  hypothetical protein  26.72 
 
 
649 aa  47.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2036  protein of unknown function DUF181  29.13 
 
 
563 aa  47.8  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0289934  normal  0.387863 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0235  protein of unknown function DUF181  24.16 
 
 
572 aa  47.4  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6320  hypothetical protein  31.08 
 
 
420 aa  47  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal  0.37052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3690  protein of unknown function DUF181  24.35 
 
 
669 aa  47  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3696  protein of unknown function DUF181  27.61 
 
 
644 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758721  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1028  hypothetical protein  24.48 
 
 
575 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2435  hypothetical protein  29.17 
 
 
630 aa  46.6  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0806076  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2590  hypothetical protein  26.38 
 
 
630 aa  45.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.188065  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3580  hypothetical protein  23.83 
 
 
618 aa  44.7  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000420617  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2949  protein of unknown function DUF181  27.15 
 
 
570 aa  43.9  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.108847  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2428  hypothetical protein  27.31 
 
 
641 aa  43.9  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149205  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2583  hypothetical protein  27.63 
 
 
607 aa  43.5  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.11419 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>