More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0167 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.06 
 
 		 676 aa  652    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3552  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.41 
 
 		 960 aa  668    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0641  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.47 
 
 		 979 aa  646    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6354  putative formate dehydrogenase alpha subunit  42.48 
 
 		 909 aa  647    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1109  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.96 
 
 		 963 aa  679    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.612386  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2185  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.43 
 
 		 960 aa  667    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.602321  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1391  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.66 
 
 		 947 aa  684    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.58 
 
 		 925 aa  737    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4582  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.77 
 
 		 989 aa  702    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.656955 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3266  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.88 
 
 		 988 aa  713    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271284  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2058  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.92 
 
 		 967 aa  695    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.896651  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4024  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.99 
 
 		 966 aa  677    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0988  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.01 
 
 		 1428 aa  721    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  49.72 
 
 		 917 aa  924    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3926  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.67 
 
 		 924 aa  721    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.9 
 
 		 1421 aa  716    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4998  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.96 
 
 		 953 aa  691    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217845  hitchhiker  0.000835215 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2366  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.17 
 
 		 983 aa  691    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.739285 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.35 
 
 		 983 aa  694    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.656443 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0450  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.53 
 
 		 984 aa  689    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.858013  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2383  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.09 
 
 		 959 aa  671    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3710  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  40.46 
 
 		 977 aa  676    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.749683  normal  0.699855 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0619  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.04 
 
 		 956 aa  678    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.961077  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4651  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.52 
 
 		 937 aa  730    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  48.47 
 
 		 695 aa  641    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0180  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.53 
 
 		 984 aa  689    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.65 
 
 		 951 aa  684    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3012  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  42.53 
 
 		 984 aa  690    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.467116  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1080  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  41.02 
 
 		 960 aa  671    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4144  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.06 
 
 		 983 aa  695    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2902  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.53 
 
 		 984 aa  690    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679741  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3051  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.4 
 
 		 1424 aa  713    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0389  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.84 
 
 		 944 aa  682    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.92 
 
 		 676 aa  652    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1861  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.61 
 
 		 978 aa  651    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0937  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.82 
 
 		 1426 aa  650    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.42 
 
 		 1410 aa  693    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.69 
 
 		 674 aa  669    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.06 
 
 		 676 aa  652    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  51.39 
 
 		 899 aa  908    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3023  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.14 
 
 		 982 aa  693    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0162015  normal  0.0152175 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1622  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.76 
 
 		 984 aa  677    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.437101  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2274  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.03 
 
 		 956 aa  684    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.217783 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0839  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.7 
 
 		 946 aa  659    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.331727  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0724  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.37 
 
 		 948 aa  661    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.696908  normal  0.792249 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0735  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.72 
 
 		 952 aa  654    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1708  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.99 
 
 		 959 aa  671    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  46 
 
 		 677 aa  662    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.58 
 
 		 674 aa  678    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2750  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.79 
 
 		 969 aa  677    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0453604 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6171  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.95 
 
 		 989 aa  699    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.796652 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2558  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.24 
 
 		 973 aa  664    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.779669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0871  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.65 
 
 		 1425 aa  702    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.510403  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3269  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.57 
 
 		 942 aa  696    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3089  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.67 
 
 		 959 aa  661    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.440267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4645  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.64 
 
 		 948 aa  671    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0720  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.31 
 
 		 949 aa  664    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2805  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.97 
 
 		 945 aa  719    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0964  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  41.57 
 
 		 982 aa  695    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0623  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.57 
 
 		 948 aa  669    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.816724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0997  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.7 
 
 		 953 aa  697    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0555  formate dehydrogenase subunit alpha  40.97 
 
 		 957 aa  694    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.358497 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.14 
 
 		 893 aa  885    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3190  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.31 
 
 		 924 aa  693    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.523924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0552  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.46 
 
 		 983 aa  695    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.918724  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4406  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.86 
 
 		 950 aa  671    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2427  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.75 
 
 		 929 aa  682    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0967  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.53 
 
 		 984 aa  689    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2964  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.42 
 
 		 984 aa  687    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0825  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.77 
 
 		 1432 aa  702    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3198  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.13 
 
 		 1432 aa  712    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.554904 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2513  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.48 
 
 		 927 aa  719    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0190469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.93 
 
 		 1406 aa  690    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2897  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.89 
 
 		 959 aa  663    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0727  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.29 
 
 		 979 aa  676    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216931  normal  0.398444 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.44 
 
 		 674 aa  675    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2684  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.42 
 
 		 951 aa  650    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.801873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0895  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.17 
 
 		 983 aa  696    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.99873  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2741  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.02 
 
 		 960 aa  671    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.313061 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3660  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.81 
 
 		 888 aa  655    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1031  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.46 
 
 		 983 aa  695    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52357  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.51 
 
 		 687 aa  639    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3479  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.79 
 
 		 946 aa  671    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.389807 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.12 
 
 		 920 aa  782    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.47 
 
 		 1440 aa  695    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0907  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.39 
 
 		 983 aa  699    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.979482  decreased coverage  0.00925571 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3493  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.65 
 
 		 1425 aa  699    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06362  oxidoreductase  44.34 
 
 		 1412 aa  653    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.81 
 
 		 1440 aa  714    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.99 
 
 		 905 aa  820    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3298  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.13 
 
 		 1432 aa  712    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.44 
 
 		 674 aa  676    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.28 
 
 		 904 aa  888    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2856  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.14 
 
 		 959 aa  681    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1282  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.79 
 
 		 933 aa  719    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.402771 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2853  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.3 
 
 		 960 aa  670    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.771386 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0337  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.51 
 
 		 955 aa  664    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1809  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.33 
 
 		 960 aa  669    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3470  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.06 
 
 		 963 aa  678    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.873157  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2595  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.53 
 
 		 984 aa  689    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.619743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>