More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0118 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
1156 aa  2384    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  34.68 
 
 
456 aa  192  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  32 
 
 
703 aa  188  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  25.26 
 
 
1340 aa  174  5.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  31.4 
 
 
499 aa  157  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
535 aa  144  9e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1898  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 
443 aa  133  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  25 
 
 
700 aa  133  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  28 
 
 
1119 aa  132  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1964  sugar transferase  26.26 
 
 
443 aa  131  6e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23345  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 
956 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  26.53 
 
 
860 aa  125  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  25.89 
 
 
902 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  31.7 
 
 
390 aa  119  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 
581 aa  118  6.9999999999999995e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1550  glycosyl transferase, group 1  25.89 
 
 
414 aa  114  9e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 
994 aa  114  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  29.59 
 
 
376 aa  111  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  29.25 
 
 
235 aa  110  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2501  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 
414 aa  110  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 
432 aa  109  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  28.89 
 
 
337 aa  109  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1794  glycosyl transferase, group 1  30.07 
 
 
419 aa  109  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.164392  normal  0.0769947 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2866  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 
410 aa  109  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.614431  hitchhiker  0.0000195595 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 
405 aa  108  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  32.47 
 
 
324 aa  108  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4699  glycosyl transferase, group 1  29.85 
 
 
409 aa  107  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793347  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3294  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
402 aa  107  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1340  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
410 aa  106  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  30.87 
 
 
358 aa  105  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1770  putative glycosyltransferase  31.73 
 
 
419 aa  105  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 
389 aa  104  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
421 aa  104  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0439  hypothetical protein  25.79 
 
 
419 aa  104  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  31.6 
 
 
233 aa  104  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  28.73 
 
 
373 aa  104  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2710  hypothetical protein  27.17 
 
 
402 aa  103  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0543542  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  28.38 
 
 
344 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0408  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 
410 aa  102  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4911  family 2 glycosyl transferase  29.8 
 
 
316 aa  102  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  30.1 
 
 
333 aa  102  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  22.74 
 
 
1106 aa  101  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0823  glycosyl transferase group 1  34.23 
 
 
411 aa  101  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2362  hypothetical protein  25.48 
 
 
413 aa  100  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  28.71 
 
 
387 aa  100  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2000  glycosyl transferase, group 1  27.31 
 
 
403 aa  100  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0417  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
402 aa  100  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  26.15 
 
 
280 aa  99.4  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  26.4 
 
 
341 aa  99.8  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  34.73 
 
 
746 aa  99  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3506  glycosyl transferase family 2  31.6 
 
 
318 aa  99.4  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33454e-25 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0462  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 
408 aa  99  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  29.72 
 
 
373 aa  98.6  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02426  putative glycosyltransferase  21.72 
 
 
423 aa  98.2  9e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2443  hypothetical protein  32.96 
 
 
407 aa  97.8  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000302372 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  26.03 
 
 
335 aa  97.8  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3183  glycosyl transferase, group 1  26.55 
 
 
404 aa  97.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3977  glycosyl transferase, group 1  32.35 
 
 
412 aa  96.3  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.696397 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26.29 
 
 
321 aa  96.3  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3182  glycosyl transferase, group 1  24.69 
 
 
406 aa  96.3  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0929  a-glycosyltransferase  25.81 
 
 
397 aa  95.9  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0122739 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
1035 aa  95.9  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4281  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 
418 aa  95.5  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0930783  normal  0.115686 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 
350 aa  95.5  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 
268 aa  95.1  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35650  hypothetical protein  28.07 
 
 
402 aa  95.5  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  hitchhiker  0.00000000053006 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1494  glycosyl transferase, group 1  31.45 
 
 
435 aa  95.1  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  28.35 
 
 
360 aa  94.7  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  25.34 
 
 
1739 aa  94.7  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4345  glycosyl transferase family 2  28.64 
 
 
847 aa  94.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321273  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  30.41 
 
 
330 aa  94.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2643  hypothetical protein  29.07 
 
 
429 aa  94.4  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 
812 aa  94  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  25.11 
 
 
466 aa  94.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3003  hypothetical protein  28.07 
 
 
402 aa  94.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  30.18 
 
 
299 aa  94.4  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3748  glycosyl transferase family 2  34.43 
 
 
329 aa  93.2  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
316 aa  93.6  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3797  glycosyl transferase family 2  34.43 
 
 
329 aa  93.2  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.5387  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0145  hypothetical protein  30.54 
 
 
414 aa  93.2  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  30.95 
 
 
274 aa  93.6  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
277 aa  92.8  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  22.74 
 
 
347 aa  93.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  22.68 
 
 
683 aa  92.8  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07275  glycosyl transferase  35.05 
 
 
296 aa  92.4  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.170431  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.63 
 
 
312 aa  92  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2061  glycosyltransferase  24.28 
 
 
537 aa  92  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4233  glycosyl transferase, group 1  27.19 
 
 
405 aa  92.4  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968175  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2244  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.28 
 
 
324 aa  92  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07620  hypothetical protein  24.8 
 
 
410 aa  92  6e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  32.16 
 
 
307 aa  91.7  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0117  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 
777 aa  91.3  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.389637  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 
310 aa  90.5  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4316  glycosyl transferase family 2  28.37 
 
 
450 aa  91.3  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  30.99 
 
 
332 aa  90.9  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0773  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
396 aa  90.5  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.784478  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  31.43 
 
 
272 aa  90.1  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  28.19 
 
 
386 aa  90.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  29.7 
 
 
302 aa  90.5  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 
750 aa  90.1  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>