More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0117 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0117  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
777 aa  1618    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.389637  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  35.68 
 
 
322 aa  150  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  38.58 
 
 
334 aa  146  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  33.2 
 
 
1177 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  33.2 
 
 
1177 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0430  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.49 
 
 
642 aa  130  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  33.19 
 
 
268 aa  127  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  32.62 
 
 
1032 aa  124  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  31.63 
 
 
272 aa  122  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  33.5 
 
 
336 aa  120  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  29.61 
 
 
261 aa  119  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4074  glycosyl transferase, group 1  33.51 
 
 
773 aa  113  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5479  glycosyl transferase family 2  29.66 
 
 
655 aa  113  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  29.21 
 
 
316 aa  112  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  29.57 
 
 
330 aa  111  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3637  glycosyl transferase group 1  32.99 
 
 
756 aa  110  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  hitchhiker  0.00349398 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2746  glycosyl transferase family 2  32.64 
 
 
260 aa  110  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
314 aa  108  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  29.07 
 
 
337 aa  108  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  32.27 
 
 
306 aa  108  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  32.18 
 
 
253 aa  107  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2672  glycosyl transferase family protein  26.83 
 
 
316 aa  106  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.650455  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  29.71 
 
 
337 aa  104  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 
324 aa  104  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2704  glycosyl transferase family 2  32.54 
 
 
278 aa  104  7e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00294002 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  30.7 
 
 
305 aa  104  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1087  glycosyl transferase family 2  32.82 
 
 
209 aa  104  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.674225 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  31.11 
 
 
347 aa  103  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  34.2 
 
 
289 aa  103  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 
318 aa  103  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  33.68 
 
 
321 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14161  hypothetical protein  32.37 
 
 
314 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0192453  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  38.18 
 
 
325 aa  103  2e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  31.91 
 
 
318 aa  102  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  32.45 
 
 
327 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
333 aa  102  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5459  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 
660 aa  100  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001770  probable glycosyl transferase  28.51 
 
 
292 aa  100  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  31.71 
 
 
390 aa  100  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  31.38 
 
 
1035 aa  100  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0769  glycosyl transferase family 2  29.54 
 
 
352 aa  100  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  34.57 
 
 
276 aa  99  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3250  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
302 aa  99  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.48335 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  29.66 
 
 
689 aa  99  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1425  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 
357 aa  97.8  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  31.94 
 
 
573 aa  97.8  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 
347 aa  97.4  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  31.14 
 
 
351 aa  97.4  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0309  glycosyltransferase  34.2 
 
 
318 aa  97.1  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  29.78 
 
 
341 aa  96.7  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  27.12 
 
 
299 aa  97.1  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1642  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
297 aa  97.1  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.26 
 
 
310 aa  95.9  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00155  putative fucosyl transferase  30.85 
 
 
311 aa  95.9  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.749849  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2150  glycosyl transferase family 2  26.24 
 
 
302 aa  95.9  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 
303 aa  96.3  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
261 aa  96.3  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  31.37 
 
 
331 aa  96.3  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  29.27 
 
 
373 aa  95.5  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2182  glycosyl transferase family 2  28.82 
 
 
293 aa  95.5  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 
305 aa  95.1  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5156  family 2 glycosyl transferase  30.93 
 
 
216 aa  95.1  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0478  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
300 aa  94.7  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  30.96 
 
 
380 aa  94.7  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  28.21 
 
 
301 aa  94.4  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  30.46 
 
 
398 aa  94.4  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0943  glycosyl transferase family 2  41.58 
 
 
351 aa  94  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.799144  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 
373 aa  93.6  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  28.74 
 
 
300 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  28.71 
 
 
274 aa  92.8  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1730  glycosyl transferase family 2  31.55 
 
 
326 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  31.63 
 
 
308 aa  93.2  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  26.51 
 
 
332 aa  92.8  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
347 aa  92.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  28.79 
 
 
313 aa  92.4  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 
336 aa  92  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
597 aa  92  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  28.97 
 
 
299 aa  92.4  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1412  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 
255 aa  92  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
386 aa  92  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  33.33 
 
 
326 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 
317 aa  92  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1918  glycosyl transferase family 2  32.26 
 
 
290 aa  91.7  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.238052  hitchhiker  0.00463208 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2846  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
305 aa  92  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.2 
 
 
321 aa  91.7  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  33.33 
 
 
326 aa  91.7  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 
1250 aa  91.7  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  30.54 
 
 
300 aa  91.7  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  39.45 
 
 
326 aa  91.3  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  32.61 
 
 
323 aa  91.3  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 
1156 aa  91.3  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  37.5 
 
 
326 aa  90.9  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  39.06 
 
 
330 aa  91.3  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  30.16 
 
 
1015 aa  90.9  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0590  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 
294 aa  90.9  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  26.64 
 
 
255 aa  90.9  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  29 
 
 
374 aa  90.9  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2628  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 
350 aa  90.1  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 
352 aa  90.1  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  39.45 
 
 
322 aa  90.1  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>