224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0116 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0116  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  100 
 
 		 223 aa  456  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.786197  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1841  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  63.68 
 
 		 225 aa  291  4e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0438  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  63.68 
 
 		 224 aa  289  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1279  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  48.92 
 
 		 266 aa  191  8e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0891  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  49.78 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3985  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  46.52 
 
 		 241 aa  185  5e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.755294 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1173  hypothetical protein  46.43 
 
 		 237 aa  171  6.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0210885  normal  0.86006 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1575  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  42.86 
 
 		 247 aa  171  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00205775  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  33.33 
 
 		 250 aa  103  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  31.95 
 
 		 241 aa  93.6  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0871  sugar nucleotidyltransferase-like protein  32.6 
 
 		 232 aa  92  7e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1601  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  30.71 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.659292  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3871  hypothetical protein  27.39 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0425  nucleotidyl transferase  29.39 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4299  hypothetical protein  26.56 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.293361  normal  0.44964 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  27.16 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1907  hypothetical protein  29.05 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0157  sugar nucleotidyltransferase-like protein  28.97 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000014669 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5001  nucleotidyl transferase  29.54 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1767  hypothetical protein  28.63 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1050  hypothetical protein  28.63 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0692  hypothetical protein  28.63 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2025  hypothetical protein  28.63 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458858  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0757  hypothetical protein  28.63 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2067  ADP-glucose pyrophosphorylase  28.63 
 
 		 255 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104928  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0781  hypothetical protein  28.63 
 
 		 255 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3867  Nucleotidyl transferase  29.54 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.911834 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4487  nucleotidyl transferase  29.11 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0231829 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0662  hypothetical protein  24.22 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2534  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  27.85 
 
 		 243 aa  72  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398326  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1913  sugar nucleotidyltransferase-like  26.12 
 
 		 255 aa  72  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0627  hypothetical protein  26.14 
 
 		 254 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4244  sugar nucleotidyltransferases-like  26.12 
 
 		 255 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4122  sugar nucleotidyltransferases-like protein  26.12 
 
 		 255 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282311  normal  0.65781 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1632  sugar metabolism cluster protein  29.61 
 
 		 247 aa  71.6  0.000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1354  sugar nucleotidyltransferase-like protein  27.73 
 
 		 244 aa  71.6  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3397  sugar nucleotidyltransferase-like protein  26.12 
 
 		 255 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3536  sugar nucleotidyltransferase-like protein  25.71 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4017  sugar nucleotidyltransferase-like protein  25.71 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4470  sugar nucleotidyltransferase-like protein  27.08 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.75477  normal  0.556357 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0788  nucleotidyl transferase  27.8 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000772544  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1671  nucleotidyltransferase family protein  28.63 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0753313  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4108  Nucleotidyl transferase  27.85 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1309  nucleotidyl transferase  28.75 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.364184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1807  rfbF; ADP-glucose pyrophosphorylase  27.2 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191256  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3392  transferase, putative  37.8 
 
 		 253 aa  68.6  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0149  hypothetical protein  35.62 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0197  hypothetical protein  37.14 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.950311  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1406  nucleotidyl transferase  26.23 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  28.17 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  29.27 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5514  nucleotidyl transferase  28.27 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2240  nucleotidyl transferase  24.28 
 
 		 254 aa  65.1  0.0000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1317  phosphoenolpyruvate phosphomutase  26.86 
 
 		 556 aa  61.6  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0722  nucleotidyltransferase family protein  27.98 
 
 		 243 aa  61.6  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.646872  normal  0.0100327 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3873  nucleotidyl transferase  25.69 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1318  hypothetical protein  26.51 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1431  Nucleotidyl transferase  27.66 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5681  nucleotidyl transferase  28.81 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1415  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  27.2 
 
 		 253 aa  58.5  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.136987  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  26.27 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  34.13 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1749  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  26 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  31.34 
 
 		 393 aa  56.2  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  35.94 
 
 		 402 aa  55.5  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  35.07 
 
 		 411 aa  55.5  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50310  sugar nucleotidyltransferase  34.43 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000057924  hitchhiker  0.000309665 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  30.93 
 
 		 384 aa  55.1  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0726  transferase, putative  31.97 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  35.07 
 
 		 411 aa  54.3  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  33.91 
 
 		 393 aa  54.7  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0316  putative sugar nucleotidyltransferase  23.02 
 
 		 253 aa  53.9  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.923111  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0596  licC protein  27.66 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  34.43 
 
 		 397 aa  54.3  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  28.33 
 
 		 248 aa  53.1  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  35.82 
 
 		 411 aa  53.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0610  nucleotidyl transferase family protein  27.12 
 
 		 227 aa  53.1  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0093  sugar nucleotidyltransferase-like protein  31.75 
 
 		 226 aa  52.8  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0370  nucleotidyl transferase  34.18 
 
 		 227 aa  52.8  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.357076 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2615  putative sugar nucleotidyltransferase  31.71 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  26.41 
 
 		 403 aa  52.4  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29421  hypothetical protein  22.77 
 
 		 244 aa  52.4  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  27.43 
 
 		 245 aa  52  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1757  nucleotidyl transferase  35.16 
 
 		 228 aa  51.6  0.000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  34.38 
 
 		 402 aa  51.2  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0708  Nucleotidyl transferase  27.85 
 
 		 334 aa  50.4  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.509912  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1749  aminotransferase class I and II  30.3 
 
 		 630 aa  50.4  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  34.96 
 
 		 784 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  33.88 
 
 		 388 aa  50.1  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1908  phosphoenolpyruvate phosphomutase  27.62 
 
 		 562 aa  49.3  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  27.4 
 
 		 818 aa  49.3  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1337  nucleotidyl transferase  32.7 
 
 		 228 aa  49.3  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0683407  normal  0.343314 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0608  MarR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 622 aa  48.5  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4321  Nucleotidyl transferase  29.38 
 
 		 238 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1808  2,3-dimethylmalate lyase  30.64 
 
 		 564 aa  48.5  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185861  normal  0.0864763 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5109  Nucleotidyl transferase  27.04 
 
 		 393 aa  47.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000303329  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2065  phosphoenolpyruvate phosphomutase  27.07 
 
 		 562 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.226403  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0780  phosphoenolpyruvate phosphomutase  27.07 
 
 		 562 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0691  phosphoenolpyruvate phosphomutase  27.07 
 
 		 562 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2026  phosphoenolpyruvate phosphomutase  27.07 
 
 		 562 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>