More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0103 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0103  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 
382 aa  749  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  55.65 
 
 
392 aa  409  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  57.26 
 
 
400 aa  397  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  54.6 
 
 
422 aa  389  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  58.01 
 
 
394 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109026  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3499  RND family efflux transporter MFP subunit  58.18 
 
 
395 aa  382  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0344164  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0497  RND family efflux transporter MFP subunit  55.08 
 
 
423 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479969  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  56.64 
 
 
405 aa  383  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.61 
 
 
433 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3435  efflux transporter, RND family, MFP subunit  55.76 
 
 
399 aa  375  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.169321  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  54.98 
 
 
394 aa  369  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  54.68 
 
 
395 aa  364  1e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  2.30672e-08 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3715  RND family efflux transporter MFP subunit  52.19 
 
 
382 aa  364  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.970475  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.07 
 
 
386 aa  362  4e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4007  secretion protein HlyD  51.34 
 
 
386 aa  362  5e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430649  normal  0.0665893 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2894  RND family efflux transporter MFP subunit  50.93 
 
 
397 aa  359  4e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.781676  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3923  multidrug efflux system protein  51.47 
 
 
387 aa  358  7e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4427  RND family efflux transporter MFP subunit  52.8 
 
 
384 aa  357  1e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.123796 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1386  efflux transporter, RND family, MFP subunit  53.55 
 
 
384 aa  357  2e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1026  RND family efflux transporter MFP subunit  52.66 
 
 
384 aa  357  2e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4337  RND family efflux transporter MFP subunit  53.25 
 
 
384 aa  355  6e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.235617 
 
 
-
 
NC_003296  RS01888  drug efflux lipoprotein  54.6 
 
 
409 aa  353  4e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.524066  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0943  RND family efflux transporter MFP subunit  53.98 
 
 
397 aa  351  1e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  54.76 
 
 
400 aa  350  2e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01880  Secretion protein HlyD  53.6 
 
 
383 aa  350  3e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  51.47 
 
 
395 aa  346  3e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  51.47 
 
 
388 aa  347  3e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  51.47 
 
 
395 aa  346  3e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05530  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  49.87 
 
 
383 aa  345  7e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  51.84 
 
 
381 aa  345  9e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4090  secretion protein HlyD  53.64 
 
 
386 aa  345  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  49.3 
 
 
386 aa  344  2e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1070  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.63 
 
 
397 aa  343  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00558937  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.15 
 
 
395 aa  343  3e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0525  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  49.6 
 
 
442 aa  343  3e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3241  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.94 
 
 
398 aa  341  1e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4061  RND family efflux transporter MFP subunit  51.04 
 
 
383 aa  341  1e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  2.65031e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2050  secretion protein HlyD  49.19 
 
 
426 aa  339  4e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  50.59 
 
 
425 aa  339  4e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03314  hypothetical protein  46.4 
 
 
385 aa  335  9e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3999  multidrug efflux system protein MdtE  46.4 
 
 
385 aa  335  9e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3715  multidrug efflux system protein MdtE  46.4 
 
 
385 aa  335  9e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00203932  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03361  multidrug resistance efflux transporter  46.4 
 
 
385 aa  335  9e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3816  multidrug efflux system protein MdtE  46.4 
 
 
385 aa  335  9e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0409403 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0200  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.4 
 
 
385 aa  335  9e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4873  multidrug efflux system protein MdtE  46.67 
 
 
385 aa  335  9e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0204  multidrug efflux system protein MdtE  46.4 
 
 
385 aa  335  9e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0378135 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0506  acriflavine resistance protein A  53.1 
 
 
409 aa  334  2e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.951175  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3553  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  48.51 
 
 
378 aa  334  2e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0504  efflux transporter, RND family, MFP subunit  54.29 
 
 
399 aa  333  3e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196433  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0539  acriflavine resistance protein A  52.8 
 
 
397 aa  333  4e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0497  acriflavine resistance protein A  52.8 
 
 
397 aa  333  4e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00419  hypothetical protein  52.8 
 
 
397 aa  333  4e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3147  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.8 
 
 
397 aa  333  4e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.035839  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00414  multidrug efflux system  52.8 
 
 
397 aa  333  4e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3153  RND family efflux transporter MFP subunit  52.8 
 
 
397 aa  333  4e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0553  acriflavine resistance protein A  52.8 
 
 
409 aa  333  4e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3911  multidrug efflux system protein MdtE  46.13 
 
 
385 aa  332  4e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  50.3 
 
 
381 aa  332  7e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.912914  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2529  RND family efflux transporter MFP subunit  51.48 
 
 
432 aa  332  7e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.210606 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3582  acriflavine resistance protein E  49.56 
 
 
385 aa  332  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.372723  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1886  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.56 
 
 
379 aa  332  8e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0158662  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3655  acriflavine resistance protein E  49.56 
 
 
385 aa  332  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.369196 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3689  acriflavine resistance protein E  49.56 
 
 
385 aa  332  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.10776 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4212  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50 
 
 
381 aa  331  1e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2656  RND family efflux transporter MFP subunit  51.48 
 
 
432 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444245  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4251  RND family efflux transporter MFP subunit  50 
 
 
381 aa  331  1e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.397426  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0395  acriflavine resistance protein A  52.51 
 
 
409 aa  331  1e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.19 
 
 
403 aa  331  1e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4006  RND family efflux transporter MFP subunit  48.63 
 
 
386 aa  330  2e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3586  RND family efflux transporter MFP subunit  48.63 
 
 
386 aa  330  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2638  RND family efflux transporter MFP subunit  51.48 
 
 
424 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  52.79 
 
 
412 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1999  secretion protein HlyD  51.48 
 
 
424 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.931394  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2609  RND family efflux transporter MFP subunit  51.48 
 
 
424 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3699  RND family efflux transporter MFP subunit  47.58 
 
 
390 aa  329  4e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0680  RND family efflux transporter MFP subunit  50.15 
 
 
420 aa  329  5e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.557778  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3837  RND family efflux transporter MFP subunit  51.49 
 
 
382 aa  329  6e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0152  RND family efflux transporter MFP subunit  48.96 
 
 
385 aa  328  7e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.06 
 
 
410 aa  328  7e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3047  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.04 
 
 
396 aa  328  7e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.376069  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0090  RND family efflux transporter MFP subunit  52.19 
 
 
381 aa  328  8e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  53.08 
 
 
411 aa  327  1e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6204  RND family efflux transporter MFP subunit  51.18 
 
 
412 aa  328  1e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103192  hitchhiker  0.00610274 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  51.49 
 
 
382 aa  328  1e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3583  acriflavine resistance protein E  49.27 
 
 
385 aa  327  2e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6607  HlyD family secretion protein  50.3 
 
 
418 aa  327  2e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.032922  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003895  membrane fusion protein of RND family multidrug efflux pump  47.78 
 
 
379 aa  327  2e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3560  acriflavine resistance protein E  48.54 
 
 
385 aa  327  2e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0550362  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51550  multidrug efflux pump membrane fusion protein  51.63 
 
 
383 aa  327  2e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6680  RND family efflux transporter MFP subunit  51.18 
 
 
412 aa  327  2e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231623  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4693  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  51.49 
 
 
382 aa  327  2e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1280  secretion protein HlyD  51.34 
 
 
385 aa  327  3e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0347794  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3648  acriflavine resistance protein E  48.69 
 
 
385 aa  327  3e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.444601  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0688  RND family efflux transporter MFP subunit  50.89 
 
 
431 aa  327  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.921638  normal  0.624256 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2967  multidrug resistance protein  53.12 
 
 
415 aa  326  4e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4046  RND family efflux transporter MFP subunit  47.72 
 
 
382 aa  326  5e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2866  secretion protein HlyD  48.94 
 
 
400 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.21396  normal  0.0804187 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1193  HlyD family secretion protein  48.97 
 
 
386 aa  325  6e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  6.22308e-11  normal  0.342064 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3458  acriflavine resistance protein E  48.4 
 
 
385 aa  325  7e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.10651e-05  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>