More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0091 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0091  stationary-phase survival protein SurE  100 
 
 
250 aa  514  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0021  stationary-phase survival protein SurE  60.32 
 
 
269 aa  312  3.9999999999999997e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0198928 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1399  stationary-phase survival protein SurE  62.8 
 
 
259 aa  309  2.9999999999999997e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.964234  normal  0.440968 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2340  exopolyphosphatase / 3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase  59.11 
 
 
259 aa  301  8.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1090  stationary-phase survival protein SurE  59.51 
 
 
250 aa  290  1e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.437878  normal  0.427988 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0130  stationary-phase survival protein SurE  56.2 
 
 
257 aa  280  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  50.81 
 
 
250 aa  235  4e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  42.17 
 
 
255 aa  211  7.999999999999999e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  42.69 
 
 
270 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2063  stationary phase survival protein SurE  43.72 
 
 
258 aa  205  5e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  45.24 
 
 
260 aa  205  7e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0953  stationary phase survival protein SurE  42.8 
 
 
259 aa  201  8e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  41.31 
 
 
281 aa  199  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  41.31 
 
 
281 aa  199  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3028  stationary phase survival protein SurE  41.37 
 
 
271 aa  198  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  42.06 
 
 
264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  44.18 
 
 
293 aa  194  9e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08830  stationary-phase survival protein SurE  40.87 
 
 
255 aa  194  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000859123  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  40.55 
 
 
259 aa  193  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2116  stationary phase survival protein SurE  40.61 
 
 
265 aa  193  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  41.04 
 
 
251 aa  193  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3256  stationary-phase survival protein SurE  40.15 
 
 
265 aa  192  4e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14701  stationary phase survival protein SurE  41.31 
 
 
269 aa  192  4e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  42.26 
 
 
252 aa  192  5e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  41.94 
 
 
260 aa  192  6e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0291  stationary phase survival protein SurE  41.06 
 
 
272 aa  191  7e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14321  stationary phase survival protein SurE  41.87 
 
 
269 aa  191  7e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.34395  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0048  stationary phase survival protein SurE  41.43 
 
 
252 aa  191  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.764456  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14561  stationary phase survival protein SurE  41.94 
 
 
269 aa  190  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.934406  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1365  stationary phase survival protein SurE  40.93 
 
 
269 aa  188  5e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1841  stationary phase survival protein SurE  41.06 
 
 
257 aa  189  5e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3481  stationary phase survival protein SurE  39.38 
 
 
268 aa  189  5e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189726  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13151  stationary phase survival protein SurE  44.5 
 
 
269 aa  188  8e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.146893  normal  0.400321 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2386  stationary phase survival protein SurE  40.65 
 
 
265 aa  187  1e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0401  stationary phase survival protein SurE  39.84 
 
 
258 aa  186  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.341473  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0361  stationary phase survival protein SurE  39.27 
 
 
259 aa  186  3e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.228867  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2034  stationary phase survival protein SurE  40.65 
 
 
258 aa  186  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4690  stationary phase survival protein SurE  44.18 
 
 
255 aa  185  7e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.651437  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0932  stationary phase survival protein SurE  40.32 
 
 
259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147904  normal  0.032325 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1665  stationary-phase survival protein SurE  41.13 
 
 
258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7059  stationary phase survival protein SurE  43.04 
 
 
259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3515  stationary phase survival protein SurE  41.8 
 
 
287 aa  182  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298961  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1231  stationary phase survival protein SurE  42.46 
 
 
257 aa  183  3e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.195993  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  43.48 
 
 
255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  44.35 
 
 
248 aa  182  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1429  stationary phase survival protein SurE  41.2 
 
 
259 aa  181  8.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  41.25 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  42.46 
 
 
253 aa  179  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  42.29 
 
 
257 aa  178  5.999999999999999e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2041  stationary phase survival protein SurE  37.8 
 
 
263 aa  176  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_004310  BR0886  stationary phase survival protein SurE  42.17 
 
 
255 aa  176  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0837  stationary phase survival protein SurE  43.06 
 
 
262 aa  176  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.915903  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1163  stationary phase survival protein SurE  41.94 
 
 
252 aa  176  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1129  stationary phase survival protein SurE  39.43 
 
 
247 aa  176  3e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434367  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2692  stationary-phase survival protein SurE  38.34 
 
 
255 aa  176  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00465836  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  42.08 
 
 
253 aa  176  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16901  stationary phase survival protein SurE  42.58 
 
 
262 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.256333  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1167  stationary phase survival protein SurE  38.62 
 
 
247 aa  175  5e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000789201  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0877  stationary phase survival protein SurE  41.77 
 
 
266 aa  174  9e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0394814  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  39.11 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  42.23 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  38.15 
 
 
251 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  42.4 
 
 
250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2341  stationary phase survival protein SurE  42.17 
 
 
258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1351  stationary phase survival protein SurE  40.16 
 
 
256 aa  170  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0474  stationary phase survival protein SurE  39.52 
 
 
255 aa  170  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122396  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0721  stationary phase survival protein SurE  43.15 
 
 
273 aa  169  5e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0339  stationary phase survival protein SurE  40.23 
 
 
258 aa  167  1e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.726536  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  41.94 
 
 
254 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1992  stationary phase survival protein SurE  37.7 
 
 
262 aa  167  2e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1918  stationary phase survival protein SurE  37.7 
 
 
262 aa  167  2e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0317  stationary phase survival protein SurE  40.23 
 
 
258 aa  167  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  39.76 
 
 
250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  40.73 
 
 
252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  39.76 
 
 
250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1769  stationary phase survival protein SurE  39.36 
 
 
261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1187  stationary-phase survival protein SurE  40.96 
 
 
270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0875437  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1345  stationary-phase survival protein SurE  39.67 
 
 
252 aa  165  5e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  39.11 
 
 
248 aa  165  8e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  39.43 
 
 
257 aa  164  9e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3860  stationary-phase survival protein SurE  37.25 
 
 
248 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5133  stationary-phase survival protein SurE  38.89 
 
 
273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.704246 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3275  stationary-phase survival protein SurE  38.65 
 
 
259 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  40.48 
 
 
245 aa  162  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0722  stationary phase survival protein SurE  44.05 
 
 
253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  38.4 
 
 
257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  42.11 
 
 
262 aa  161  7e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0899  stationary phase survival protein SurE  41.15 
 
 
269 aa  162  7e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  38.74 
 
 
252 aa  161  8.000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1904  stationary phase survival protein SurE  39.23 
 
 
264 aa  161  9e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.370679 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  38.74 
 
 
252 aa  161  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1499  stationary phase survival protein SurE  38.62 
 
 
269 aa  161  1e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19351  stationary phase survival protein SurE  42.18 
 
 
269 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.692347 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  42.56 
 
 
265 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1245  stationary phase survival protein SurE  35.48 
 
 
259 aa  160  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1381  stationary phase survival protein SurE  41.5 
 
 
257 aa  159  3e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1057  stationary phase survival protein SurE  40.08 
 
 
249 aa  159  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2664  stationary phase survival protein SurE  38.98 
 
 
256 aa  159  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4403  stationary phase survival protein SurE  39.13 
 
 
280 aa  159  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508997  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0329  stationary phase survival protein SurE  38.15 
 
 
258 aa  158  6e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>