84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0086 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0086  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
361 aa  746    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1404  metal dependent phosphohydrolase  50.46 
 
 
343 aa  335  9e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.248325  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1091  metal dependent phosphohydrolase  45.48 
 
 
347 aa  317  2e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal  0.443941 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0022  metal dependent phosphohydrolase  44.84 
 
 
361 aa  301  2e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0126816 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2339  metal dependent phosphohydrolase  42.43 
 
 
347 aa  293  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0129  metal dependent phosphohydrolase  41.67 
 
 
343 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0157  metal dependent phosphohydrolase  33.91 
 
 
348 aa  219  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2675  metal dependent phosphohydrolase  37.46 
 
 
384 aa  216  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.606537 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2929  metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 
366 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.220477  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1122  HD domain-containing protein  34.6 
 
 
375 aa  211  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2466  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  37.08 
 
 
328 aa  210  3e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0701415  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1665  metal dependent phosphohydrolase  31.82 
 
 
388 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2548  metal dependent phosphohydrolase  32.53 
 
 
386 aa  206  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.98451e-17 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2013  HD-superfamily hydrolase  37.22 
 
 
387 aa  203  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000276986  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4294  metal dependent phosphohydrolase  36.18 
 
 
375 aa  202  6e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298288  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0049  metal dependent phosphohydrolase  36.62 
 
 
371 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0440  metal dependent phosphohydrolase  35.56 
 
 
377 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000386707  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1988  metal dependent phosphohydrolase  35.81 
 
 
295 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.489678  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1026  metal dependent phosphohydrolase  36.34 
 
 
327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1025  metal dependent phosphohydrolase  34.56 
 
 
336 aa  185  8e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0158  metal dependent phosphohydrolase  34.09 
 
 
315 aa  182  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1796  metal dependent phosphohydrolase  31.45 
 
 
315 aa  180  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000175278  normal  0.229909 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2543  metal dependent phosphohydrolase  33.61 
 
 
531 aa  176  8e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738894  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0691  metal dependent phosphohydrolase  31.78 
 
 
344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000585513  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2639  metal dependent phosphohydrolase  32.49 
 
 
528 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.130174  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0667  metal dependent phosphohydrolase  31.78 
 
 
336 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0904  HD-superfamily hydrolase  34.8 
 
 
322 aa  169  1e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2446  metal dependent phosphohydrolase  32.9 
 
 
534 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1164  metal dependent phosphohydrolase  30.7 
 
 
320 aa  168  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1317  metal dependent phosphohydrolase  31.01 
 
 
534 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0700325  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0147  metal dependent phosphohydrolase  30.67 
 
 
344 aa  162  6e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1378  3'-5' exoribonuclease YhaM  33.22 
 
 
313 aa  163  6e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.280441  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0796  3'-5' exoribonuclease YhaM  31.96 
 
 
318 aa  162  9e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2404  HD-superfamily hydrolase  33.55 
 
 
321 aa  161  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0036501  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1895  3'-5' exoribonuclease YhaM  31.51 
 
 
313 aa  159  9e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.469436  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1929  3'-5' exoribonuclease YhaM  31.51 
 
 
313 aa  159  9e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0927  3'-5' exoribonuclease YhaM  31.96 
 
 
314 aa  158  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.475944  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1180  3'-5' exoribonuclease YhaM  31.27 
 
 
314 aa  155  9e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000316143  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0947  3'-5' exoribonuclease YhaM  31.27 
 
 
314 aa  155  9e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0716307  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1012  3'-5' exoribonuclease YhaM  31.27 
 
 
314 aa  155  9e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1111  3'-5' exoribonuclease YhaM  31.27 
 
 
314 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189435  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1052  3'-5' exoribonuclease YhaM  31.27 
 
 
314 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299092  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4249  3'-5' exoribonuclease YhaM  31.27 
 
 
314 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000074521 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1087  3'-5' exoribonuclease YhaM  31.27 
 
 
314 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6154099999999997e-58 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0920  3'-5' exoribonuclease YhaM  31.27 
 
 
314 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0118856  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0933  3'-5' exoribonuclease YhaM  31.27 
 
 
314 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0143521  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0847  metal dependent phosphohydrolase  34.21 
 
 
354 aa  154  2e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.241634  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1448  HD-superfamily hydrolase  29.82 
 
 
325 aa  154  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000046208  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0730  HD-superfamily hydrolase  33.93 
 
 
316 aa  153  4e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0636  3'-5' exoribonuclease YhaM  30.19 
 
 
324 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000053339  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1452  3'-5' exoribonuclease YhaM  31.91 
 
 
376 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl244  cmp-binding factor-1  32.18 
 
 
326 aa  145  1e-33  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5827  metal dependent phosphohydrolase  32.42 
 
 
295 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.163543  normal  0.236354 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0317  metal dependent phosphohydrolase  29.69 
 
 
333 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1645  metal dependent phosphohydrolase  30.1 
 
 
352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5784  metal dependent phosphohydrolase  31.83 
 
 
327 aa  132  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.825544 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1773  HD domain-containing protein  27.87 
 
 
313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0235466  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3087  metal dependent phosphohydrolase  30.92 
 
 
330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0027  3'-5' exoribonuclease YhaM  27.91 
 
 
323 aa  129  9.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.838244  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1766  HD-superfamily hydrolase  29.43 
 
 
313 aa  126  5e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00925857  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0027  HD domain-containing protein  27.57 
 
 
323 aa  125  9e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0473  hypothetical protein  27.62 
 
 
326 aa  125  1e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2193  HD-superfamily hydrolase  26.95 
 
 
314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0450  metal dependent phosphohydrolase  28.26 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1871  metal dependent phosphohydrolase  29.07 
 
 
317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0913  hypothetical protein  26.56 
 
 
313 aa  92  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2850  metal dependent phosphohydrolase  26.14 
 
 
309 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1243  metal dependent phosphohydrolase  31.17 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0723  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 
228 aa  69.7  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1232  metal dependent phosphohydrolase  29.93 
 
 
228 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1443  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 
228 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.281894  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0933  metal dependent phosphohydrolase  29.33 
 
 
249 aa  62  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0254  metal dependent phosphohydrolase  27.71 
 
 
320 aa  58.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00126604  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1141  metal dependent phosphohydrolase  23.47 
 
 
320 aa  55.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00121912  hitchhiker  0.00000000000000887406 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1501  metal dependent phosphohydrolase  32.77 
 
 
198 aa  54.3  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2427  metal dependent phosphohydrolase  32.77 
 
 
192 aa  51.2  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.530207  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1475  metal dependent phosphohydrolase  28.12 
 
 
512 aa  49.3  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.331031  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2021  metal dependent phosphohydrolase  36.23 
 
 
287 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000315761  decreased coverage  0.0000000241246 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0221  hypothetical protein  31.78 
 
 
286 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.705839  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1162  metal dependent phosphohydrolase  29.17 
 
 
217 aa  43.5  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.031643  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1835  metal dependent phosphohydrolase  27.91 
 
 
212 aa  43.5  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.930216  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0222  metal dependent phosphohydrolase  30.95 
 
 
170 aa  43.5  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1508  metal dependent phosphohydrolase  31.09 
 
 
199 aa  42.7  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1280  metal dependent phosphohydrolase  25.79 
 
 
165 aa  42.7  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.107883 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>