26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0078 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0078  glutaredoxin  100 
 
 		 84 aa  170  5.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1406  glutaredoxin  60.76 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.583835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0348  glutaredoxin  70.83 
 
 		 81 aa  109  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2933  glutaredoxin  59.49 
 
 		 87 aa  100  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2739  hypothetical protein  58.75 
 
 		 119 aa  99.4  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2101  glutaredoxin  50.6 
 
 		 85 aa  97.4  6e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.367308 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2968  glutaredoxin  50 
 
 		 85 aa  91.3  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000425942  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0908  glutaredoxin  50 
 
 		 93 aa  89.7  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000277595  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2431  glutaredoxin  48.72 
 
 		 103 aa  89.4  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00565496  normal  0.121902 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2455  glutaredoxin  46.15 
 
 		 95 aa  86.3  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0501  glutaredoxin  48.72 
 
 		 92 aa  83.6  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.839911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0832  glutaredoxin  46.84 
 
 		 92 aa  82  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.536089  normal  0.276362 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0928  glutaredoxin, putative  47.37 
 
 		 79 aa  81.3  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0522717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0155  glutaredoxin  42.31 
 
 		 91 aa  73.9  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0968575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0198  glutaredoxin family protein  42.31 
 
 		 91 aa  72  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000961716  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_186  glutaredoxin protein  42.31 
 
 		 91 aa  67.4  0.00000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.017665  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2348  glutaredoxin  32.5 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0181488 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0422  hypothetical protein  25.97 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2435  YruB family glutaredoxin-like protein  30.38 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2749  YruB family glutaredoxin-like protein  30.38 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2625  glutaredoxin  28.75 
 
 		 86 aa  43.9  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.253894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  31.71 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  32.88 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0886  glutaredoxin  27.38 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  30.38 
 
 		 391 aa  40.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2423  glutaredoxin  31.65 
 
 		 85 aa  40  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>