72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0071 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0071  protein of unknown function DUF177  100 
 
 
176 aa  365  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1411  protein of unknown function DUF177  50.32 
 
 
177 aa  153  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1847  hypothetical protein  40.34 
 
 
178 aa  134  9e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3104  protein of unknown function DUF177  37.25 
 
 
203 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0203008 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2426  hypothetical protein  38.38 
 
 
179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00706179  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1610  protein of unknown function DUF177  34.72 
 
 
192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00433257  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1368  hypothetical protein  29.55 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000101542  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1151  protein of unknown function DUF177  31.94 
 
 
178 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3111  protein of unknown function DUF177  31.25 
 
 
185 aa  74.3  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0354098  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1730  hypothetical protein  33.12 
 
 
161 aa  70.5  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000131873  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0774  hypothetical protein  31.25 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000032907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0797  hypothetical protein  32.46 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000798674  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0826  protein of unknown function DUF177  26.35 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000168903  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10220  predicted metal-binding, possibly nucleic acid-binding protein  29.23 
 
 
157 aa  63.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.30799e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0769  metal-binding protein  31.37 
 
 
186 aa  63.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1976  hypothetical protein  28 
 
 
164 aa  63.9  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1358  protein of unknown function DUF177  33.33 
 
 
185 aa  63.5  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0534521  normal  0.432426 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1805  hypothetical protein  35.71 
 
 
182 aa  63.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1328  hypothetical protein  33.33 
 
 
175 aa  63.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000416974  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1339  protein of unknown function DUF177  30.28 
 
 
167 aa  62.8  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.518128  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1258  protein of unknown function DUF177  30.57 
 
 
173 aa  62.8  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000135148  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0474  hypothetical protein  29.29 
 
 
182 aa  62  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000014524  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2558  protein of unknown function DUF177  33.85 
 
 
179 aa  62  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1433  hypothetical protein  29.05 
 
 
185 aa  61.2  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000012888  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1104  protein of unknown function DUF177  32.58 
 
 
187 aa  60.5  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000578932  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1843  hypothetical protein  27.21 
 
 
187 aa  60.5  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000297886  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1354  protein of unknown function DUF177  30.12 
 
 
183 aa  60.1  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000453474  normal  0.152935 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1598  hypothetical protein  27.78 
 
 
179 aa  60.5  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2612  hypothetical protein  36.75 
 
 
182 aa  59.7  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.801895 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1694  hypothetical protein  27.86 
 
 
131 aa  59.7  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0235271  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3825  protein of unknown function DUF177  29.08 
 
 
169 aa  59.3  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000165612  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1872  hypothetical protein  27.4 
 
 
178 aa  58.2  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000360622  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1576  hypothetical protein  36.07 
 
 
180 aa  58.2  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000754833  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1739  hypothetical protein  27.64 
 
 
180 aa  57  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000472305  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0656  hypothetical protein  31.36 
 
 
159 aa  57  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0856  protein of unknown function DUF177  31.01 
 
 
189 aa  56.2  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0939  protein of unknown function DUF177  27.94 
 
 
179 aa  56.2  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000128856  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2079  hypothetical protein  23.42 
 
 
166 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0352499  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0951  protein of unknown function DUF177  32.32 
 
 
179 aa  55.5  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000012525  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2120  hypothetical protein  26.62 
 
 
183 aa  55.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.16235 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2135  protein of unknown function DUF177  27.59 
 
 
165 aa  55.5  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000607383  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1173  protein of unknown function DUF177  31.67 
 
 
172 aa  54.7  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000208772  normal  0.0342021 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0941  hypothetical protein  26.71 
 
 
193 aa  54.3  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248202  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1596  hypothetical protein  25.87 
 
 
179 aa  53.9  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.3780500000000002e-18  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0636  hypothetical protein  30.77 
 
 
172 aa  53.9  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000112577  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4143  hypothetical protein  28.97 
 
 
183 aa  53.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.155219 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1284  hypothetical protein  34.02 
 
 
187 aa  53.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1889  protein of unknown function DUF177  27.37 
 
 
230 aa  52.4  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2742  hypothetical protein  30.17 
 
 
186 aa  51.6  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0662187  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1942  protein of unknown function DUF177  27.34 
 
 
180 aa  51.6  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000072056  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2937  protein of unknown function DUF177  47.06 
 
 
186 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3282  hypothetical protein  30.48 
 
 
192 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2845  protein of unknown function DUF177  47.06 
 
 
186 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.623121  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1027  hypothetical protein  26.23 
 
 
167 aa  50.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000775006  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2753  hypothetical protein  46.94 
 
 
186 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0339  hypothetical protein  30 
 
 
216 aa  49.7  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.834637  normal  0.0667006 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1174  hypothetical protein  31.96 
 
 
187 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000602797 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10040  predicted metal-binding protein, possibly nucleic-acid binding  34.91 
 
 
183 aa  49.3  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000141201  hitchhiker  0.000000328703 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0835  hypothetical protein  29.46 
 
 
179 aa  48.1  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000635204  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8019  protein of unknown function DUF177  31.63 
 
 
204 aa  48.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343031  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0232  protein of unknown function DUF177  26.76 
 
 
171 aa  47.8  0.00007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000764043  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0849  hypothetical protein  25.99 
 
 
184 aa  47  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05650  predicted metal-binding protein, possibly nucleic-acid binding  29.52 
 
 
140 aa  46.6  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00861555  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1647  protein of unknown function DUF177  26.79 
 
 
186 aa  46.6  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3435  protein of unknown function DUF177  29 
 
 
195 aa  45.1  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.756504  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1607  protein of unknown function DUF177  25.33 
 
 
192 aa  45.1  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0562637  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1668  protein of unknown function DUF177  26.52 
 
 
176 aa  44.3  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.323385  normal  0.0100711 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5966  protein of unknown function DUF177  30.21 
 
 
148 aa  42.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3693  protein of unknown function DUF177  29.59 
 
 
171 aa  41.6  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4031  protein of unknown function DUF177  27.18 
 
 
215 aa  41.6  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10850  predicted metal-binding protein, possibly nucleic-acid binding  30.77 
 
 
187 aa  41.6  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00522306  normal  0.125771 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1576  hypothetical protein  31.13 
 
 
185 aa  40.8  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0723626 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>