More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0031 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0031  UspA domain protein  100 
 
 		 163 aa  332  1e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.781417  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0179  hypothetical protein  44.76 
 
 		 141 aa  128  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.019159  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0609  hypothetical protein  44.76 
 
 		 142 aa  120  7e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0479495  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1445  UspA domain protein  39.16 
 
 		 144 aa  103  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228504  normal  0.253406 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1250  hypothetical protein  43.06 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.284687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001681  universal stress protein family 3  39.73 
 
 		 145 aa  101  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2329  hypothetical protein  39.16 
 
 		 143 aa  101  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0727438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00791  hypothetical protein  38.36 
 
 		 145 aa  97.1  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0354  universal stress protein F  36.3 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1327  hypothetical protein  38.19 
 
 		 141 aa  90.9  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5541  putative universal stress protein (Usp)  40.28 
 
 		 141 aa  90.1  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2846  hypothetical protein  34.72 
 
 		 145 aa  88.2  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3824  hypothetical protein  37.93 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4244  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 		 144 aa  85.1  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3802  hypothetical protein  37.76 
 
 		 141 aa  84.7  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.356211  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3481  UspA domain-containing protein  37.76 
 
 		 141 aa  84.7  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3686  hypothetical protein  35.66 
 
 		 141 aa  84.3  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.460591 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1477  hypothetical protein  36.11 
 
 		 141 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41182  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1834  universal stress protein F  39.07 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1502  universal stress protein F  39.07 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432099  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1685  universal stress protein F  39.07 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0435547 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1773  universal stress protein F  39.07 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.633651  normal  0.0944552 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1771  universal stress protein F  39.07 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0837729 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1559  universal stress protein F  36.67 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01347  stress-induced protein, ATP-binding protein  36 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2270  UspA domain protein  36 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.397995  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2280  UspA domain-containing protein  36 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2836  UspA domain protein  34.03 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123614  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01359  hypothetical protein  36 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1462  universal stress protein F  36 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.694319  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1232  UspA domain protein  35.17 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1613  universal stress protein F  36 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1777  universal stress protein F  36 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1994  universal stress protein F  36 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4462  UspA domain protein  36.99 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.60022  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1660  hypothetical protein  36.36 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2676  UspA domain protein  34.03 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2532  UspA domain protein  34.01 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1834  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2213  putative UspA domain protein  30.07 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  35.71 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  35.17 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  30.41 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  32.68 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  32.45 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  29.87 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  28.19 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2734  universal stress protein  39.24 
 
 		 141 aa  62  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  28.76 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0521  universal stress protein G  30.14 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  31.79 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0659  universal stress protein G  30.14 
 
 		 142 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0693  universal stress protein G  30.14 
 
 		 142 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.727878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0628  universal stress protein G  30.14 
 
 		 142 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00576  universal stress protein UP12  29.45 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3017  UspA domain protein  29.45 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1115  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00565  hypothetical protein  29.45 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3036  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1147  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.280901 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  33.55 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  27.81 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0628  universal stress protein G  29.45 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2171  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.981815  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  29.81 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  29.53 
 
 		 304 aa  58.2  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  26.17 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2040  putative universal stress protein  28.67 
 
 		 135 aa  57  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.190459  normal  0.175544 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  26.83 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  31.61 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  26 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.75 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3858  hypothetical protein  32.37 
 
 		 297 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  30.19 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  31.29 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  29.17 
 
 		 288 aa  54.7  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  30.57 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  30.61 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  29.19 
 
 		 280 aa  54.3  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  31.71 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  30.63 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1937  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  28.57 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  28.86 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  32.65 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  33.33 
 
 		 283 aa  53.9  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  30 
 
 		 173 aa  53.9  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  30.46 
 
 		 307 aa  53.5  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  32.41 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0603  UspA domain-containing protein  26.39 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  25.85 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0712  universal stress protein G  39.74 
 
 		 97 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.9695 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1352  hypothetical protein  43.33 
 
 		 137 aa  53.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.486756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0726  universal stress protein G  39.74 
 
 		 97 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.678292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  31.17 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  32.45 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0653  universal stress protein G  39.74 
 
 		 97 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.51 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  28.1 
 
 		 151 aa  53.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0667  universal stress protein G  39.74 
 
 		 97 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.576414  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>