191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0025 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0685  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase family protein/molybdopterin binding protein  62.14 
 
 
551 aa  701    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.518875  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1225  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  60.22 
 
 
543 aa  665    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.524983  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0554  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  59.93 
 
 
559 aa  664    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1613  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  61.06 
 
 
547 aa  677    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0025  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  100 
 
 
540 aa  1106    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0032  molybdopterin binding domain-containing protein  56.99 
 
 
544 aa  619  1e-176  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360956  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2793  molybdopterin binding domain-containing protein  59.23 
 
 
543 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1566  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  53.86 
 
 
557 aa  593  1e-168  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0642  molybdopterin binding domain protein  42.57 
 
 
347 aa  277  3e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.138777 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1552  molybdopterin binding domain-containing protein  42.98 
 
 
340 aa  274  3e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0997  molybdopterin binding domain-containing protein  41.86 
 
 
340 aa  274  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1824  molybdopterin binding domain protein  42.74 
 
 
346 aa  263  8e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0289646  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2764  molybdopterin binding domain-containing protein  40.36 
 
 
335 aa  262  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1807  molybdopterin binding domain protein  38.05 
 
 
345 aa  261  2e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0932  molybdopterin binding domain-containing protein  41.04 
 
 
344 aa  260  4e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1563  molybdopterin binding domain protein  41.18 
 
 
340 aa  260  4e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.229434  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3538  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  40.87 
 
 
341 aa  258  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0219  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  40.47 
 
 
341 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.416217  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3441  molybdopterin binding domain protein  40.59 
 
 
340 aa  252  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.593613  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1478  molybdopterin binding domain-containing protein  37.65 
 
 
341 aa  249  8e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1761  molybdenum cofactor biosynthesis protein, putative  37.65 
 
 
337 aa  244  3e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.647505  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2761  molybdopterin binding domain protein  35.09 
 
 
340 aa  243  9e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00889272  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2046  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.35 
 
 
337 aa  242  1e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1573  molybdopterin binding domain-containing protein  38.44 
 
 
339 aa  239  1e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.214865  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3500  molybdopterin binding domain protein  36.98 
 
 
341 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1027  molybdopterin biosynthesis protein, putative  36.66 
 
 
343 aa  229  7e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1688  molybdopterin binding domain protein  36.92 
 
 
324 aa  216  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1600  molybdopterin binding domain protein  36.87 
 
 
339 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.511958  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1437  molybdenum cofactor synthesis domain protein  34.76 
 
 
324 aa  208  2e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0377  molybdopterin binding domain protein  35.28 
 
 
330 aa  199  7.999999999999999e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000620361  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0260  molybdopterin binding domain protein  35.69 
 
 
344 aa  198  2.0000000000000003e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.501358  normal  0.241129 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2212  molybdopterin binding domain  40 
 
 
409 aa  179  8e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000001586  hitchhiker  0.00707587 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0190  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  44.12 
 
 
189 aa  159  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000060037  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1398  molybdopterin binding domain protein  30 
 
 
332 aa  127  7e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0660  molybdopterin binding domain-containing protein  31.56 
 
 
329 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0197  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  37.79 
 
 
182 aa  106  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.104926  normal  0.013421 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0826  molybdopterin binding domain-containing protein  31.33 
 
 
330 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000805611  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  30.68 
 
 
534 aa  103  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  30.31 
 
 
534 aa  103  7e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  28.19 
 
 
544 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  31.36 
 
 
534 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5449  molybdopterin binding domain-containing protein  30.65 
 
 
342 aa  101  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1309  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  35.98 
 
 
247 aa  100  6e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.142506  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.88 
 
 
534 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.21 
 
 
539 aa  95.1  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1985  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  32.81 
 
 
212 aa  94.7  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.237325  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1057  molybdopterin binding domain-containing protein  31.97 
 
 
336 aa  94.4  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0040  hypothetical protein  24.32 
 
 
401 aa  94.4  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1187  molybdopterin binding domain  31.66 
 
 
336 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262321  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1417  molybdopterin binding domain-containing protein  25.1 
 
 
342 aa  92.8  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.36 
 
 
533 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.63 
 
 
533 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1046  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  34.21 
 
 
213 aa  92  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.901443  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0040  hypothetical protein  24.32 
 
 
321 aa  91.3  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.74 
 
 
533 aa  91.3  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3468  molybdopterin binding domain-containing protein  29.33 
 
 
348 aa  89  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  28.27 
 
 
546 aa  87  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  28.74 
 
 
575 aa  84.3  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  24.9 
 
 
538 aa  83.2  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0082  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  32.4 
 
 
194 aa  83.2  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.474566  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0985  molybdopterin binding domain  30.5 
 
 
336 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.087675  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0046  hypothetical protein  23.65 
 
 
319 aa  81.3  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  25.9 
 
 
539 aa  79.7  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1756  molybdopterin binding domain protein  27.68 
 
 
341 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195217  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1762  molybdopterin biosynthesis protein  26.24 
 
 
333 aa  73.9  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.248299  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2350  putative molybdopterin biosynthesis protein  27.2 
 
 
337 aa  72  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.294499  normal  0.371201 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1936  molybdopterin biosynthesis protein  26.61 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0205763  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1287  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  28.89 
 
 
200 aa  69.7  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0587  Fis family transcriptional regulator  26.21 
 
 
334 aa  68.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  24 
 
 
538 aa  67.4  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0286  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  29.05 
 
 
196 aa  67.4  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.240193  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1589  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  31.94 
 
 
187 aa  66.6  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00866751  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0332  molybdopterin binding domain-containing protein  27.23 
 
 
336 aa  66.6  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1661  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  27.81 
 
 
191 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1452  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  27.62 
 
 
190 aa  64.7  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1767  molybdopterin binding domain-containing protein  25.22 
 
 
357 aa  64.3  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2569  molybdopterin biosynthesis protein  32.14 
 
 
405 aa  63.9  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.635561  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1529  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  27.59 
 
 
191 aa  63.5  0.000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000347929 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2359  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  28.12 
 
 
190 aa  62  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0396741  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0383  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  26.7 
 
 
191 aa  62  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2019  molybdenum cofactor synthesis domain protein  29.55 
 
 
407 aa  60.1  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00400246  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1664  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  25.13 
 
 
206 aa  59.7  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01917  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2051  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  26.5 
 
 
204 aa  58.2  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.887777 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1329  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  27.04 
 
 
270 aa  57.8  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080332  normal  0.0130791 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5512  molybdenum cofactor synthesis domain protein  29.86 
 
 
422 aa  57  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03854  molybdopterin biosynthesis protein  32.52 
 
 
411 aa  56.6  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.240712  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3776  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  36.76 
 
 
410 aa  56.6  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0208016  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1625  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E  32.95 
 
 
202 aa  55.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0346618  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0146  molybdenum cofactor synthesis domain protein  31.55 
 
 
401 aa  55.8  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0785571  normal  0.0383548 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1669  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  32.67 
 
 
223 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.416027 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2150  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  35.56 
 
 
203 aa  55.5  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.160293 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1423  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  30.41 
 
 
228 aa  55.1  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3049  molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.03 
 
 
410 aa  54.7  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0425  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  32.32 
 
 
206 aa  54.7  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2004  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  27.4 
 
 
196 aa  54.7  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.390285 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2838  MoeA-likedomain-containing protein  30.43 
 
 
403 aa  54.7  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1920  MoeA-like protein  32.17 
 
 
396 aa  55.1  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0346  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  33.7 
 
 
174 aa  54.3  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1467  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E region  32.35 
 
 
205 aa  54.7  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.225313  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1196  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  36.96 
 
 
206 aa  54.3  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>