98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0017 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0017  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  548  1e-155  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000871636  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0429  hypothetical protein  44.37 
 
 
295 aa  196  3e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3008  hypothetical protein  38.52 
 
 
273 aa  171  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1465  hypothetical protein  49.28 
 
 
284 aa  168  9e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.944037 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0092  hypothetical protein  44.04 
 
 
310 aa  168  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2468  hypothetical protein  37.55 
 
 
248 aa  136  4e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000271324  hitchhiker  0.000588391 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3906  PP-loop domain-containing protein  35.34 
 
 
296 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000213353  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0342  PP-loop domain protein  37.31 
 
 
268 aa  123  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.09066e-30 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0536  hypothetical protein  38.29 
 
 
269 aa  120  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.114391  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0361  PP-loop domain protein  36.92 
 
 
268 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0101562  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2511  hypothetical protein  35.78 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0316304 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2987  hypothetical protein  36.36 
 
 
280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000894357  normal  0.775366 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0151  PP-loop domain-containing protein  33.86 
 
 
270 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.31166  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1769  PP-loop domain protein  38.27 
 
 
268 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.325381  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1202  PP-loop domain protein  34.9 
 
 
276 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000899133  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1279  Queuosine synthesis-like protein  37.5 
 
 
261 aa  107  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1385  ExsB family protein  32.49 
 
 
267 aa  106  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000352849  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0368  hypothetical protein  33.06 
 
 
251 aa  105  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0159  hypothetical protein  34.33 
 
 
283 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.018971 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2431  hypothetical protein  37.76 
 
 
273 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04890  conserved hypothetical protein TIGR00268  31.46 
 
 
272 aa  104  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.138392  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1387  hypothetical protein  35.9 
 
 
275 aa  104  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000000185278  normal  0.88629 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1583  ExsB family protein  30.8 
 
 
274 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1608  PP-loop domain protein  30.8 
 
 
274 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1637  PP family ATPase  29.46 
 
 
267 aa  102  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.141063  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1841  hypothetical protein  35.26 
 
 
269 aa  102  9e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000226764  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1079  hypothetical protein  34.52 
 
 
279 aa  102  9e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.218675  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0923  ExsB family protein  36.17 
 
 
269 aa  101  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.625389  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0340  ExsB family protein  31.12 
 
 
265 aa  99.8  4e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6080  ExsB family protein  37.89 
 
 
283 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1708  ExsB family protein  33.64 
 
 
278 aa  99.8  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16911  PP family ATPase  29.41 
 
 
288 aa  99.4  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2185  hypothetical protein  30.52 
 
 
294 aa  98.6  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1049  hypothetical protein  33.58 
 
 
275 aa  98.2  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1063  ExsB family protein  33.52 
 
 
272 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.50687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1342  ExsB family protein  34.29 
 
 
285 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3010  hypothetical protein  29.2 
 
 
276 aa  97.1  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503965  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2865  ExsB family protein  29.84 
 
 
278 aa  97.1  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000508984 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2226  ExsB family protein  38.21 
 
 
265 aa  97.1  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2220  ExsB family protein  35.35 
 
 
286 aa  97.1  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2118  ExsB family protein  35.83 
 
 
268 aa  96.7  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2938  ExsB family protein  32.46 
 
 
261 aa  96.7  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000232553  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1718  hypothetical protein  33.82 
 
 
257 aa  96.7  4e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1629  PP-loop domain-containing protein  34 
 
 
278 aa  95.9  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.212162 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1704  PP-loop domain protein  31.87 
 
 
285 aa  95.5  9e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0697664  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2203  queuosine synthesis-like protein  32.04 
 
 
273 aa  94  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.12352  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1058  ExsB family protein  38.41 
 
 
210 aa  93.6  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000205582 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1060  PP-loop domain-containing protein  31.73 
 
 
276 aa  93.2  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.347146 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0693  PP-loop domain-containing protein  35.03 
 
 
282 aa  93.2  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.443839  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4689  hypothetical protein  30.93 
 
 
281 aa  92.8  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.605066  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1824  PP-loop domain-containing protein  31.08 
 
 
268 aa  92.4  7e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3314  hypothetical protein  32.26 
 
 
275 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1214  PP-loop domain-containing protein  32.67 
 
 
265 aa  91.3  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.494408 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0392  hypothetical protein  30.27 
 
 
275 aa  91.7  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0722  hypothetical protein  32.83 
 
 
272 aa  90.1  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.537478  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20171  PP family ATPase  30.16 
 
 
280 aa  89.4  6e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.700007  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1143  hypothetical protein  30.16 
 
 
280 aa  89  7e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22871  ATP-utilizing enzymes of the PP-loop superfamily protein  31.87 
 
 
279 aa  89  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3800  PP family ATPase  32.81 
 
 
267 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104125  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1595  ExsB family protein  39.25 
 
 
271 aa  88.2  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17581  PP family ATPase  29.32 
 
 
252 aa  87.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.414298  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2603  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  32.84 
 
 
334 aa  87  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.153014  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1612  ExsB family protein  36.42 
 
 
257 aa  87  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.296662  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1781  ExsB family protein  27.31 
 
 
268 aa  86.7  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762321  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0147  ExsB family protein  35.21 
 
 
486 aa  85.9  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00645126 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1937  hypothetical protein  32.98 
 
 
292 aa  86.3  6e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1357  hypothetical protein  32.54 
 
 
273 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.373596  hitchhiker  0.00844883 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1003  hypothetical protein  30.96 
 
 
257 aa  84.3  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.309072  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17621  PP family ATPase  29.13 
 
 
274 aa  83.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1663  hypothetical protein  30.54 
 
 
274 aa  84  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2271  hypothetical protein  39.88 
 
 
284 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17781  PP family ATPase  29.56 
 
 
274 aa  83.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3933  hydrolase  33.73 
 
 
472 aa  82.8  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.158663  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2123  PP-loop domain-containing protein  35.54 
 
 
278 aa  82.4  0.000000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2185  hypothetical protein  28.92 
 
 
270 aa  82  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0999968  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1000  tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyl transferase  30.46 
 
 
289 aa  80.9  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0255  hypothetical protein  30.73 
 
 
275 aa  81.3  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1596  hypothetical protein  36.02 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.659522  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4189  Queuosine synthesis-like protein  30.86 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.653788 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0177  tRNA methyl transferase-like protein  30.09 
 
 
313 aa  79.7  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4914  ExsB family protein  31.35 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1028  tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyl transferase  29.27 
 
 
276 aa  77.8  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2054  asparagine synthase  30.1 
 
 
317 aa  76.6  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2325  hypothetical protein  36.69 
 
 
284 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462799  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1431  hypothetical protein  31.87 
 
 
267 aa  76.3  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1542  hypothetical protein  35.93 
 
 
284 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.138904  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1151  PP-loop domain-containing protein  30.98 
 
 
271 aa  71.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.293565  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2413  hypothetical protein  36.09 
 
 
284 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.246875  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3710  hypothetical protein  30.95 
 
 
274 aa  70.5  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.509319  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1558  hypothetical protein  31.32 
 
 
283 aa  67.8  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1841  hypothetical protein  33.73 
 
 
265 aa  65.9  0.0000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31120  conserved hypothetical protein TIGR00268  29.72 
 
 
328 aa  62  0.000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0485  ExsB family protein  25.93 
 
 
258 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108747  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0553  hypothetical protein  26.88 
 
 
257 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.757724  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0352  PP-loop domain-containing protein  25.93 
 
 
258 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1434  ExsB family protein  24.7 
 
 
258 aa  55.8  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.672941  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0184  ExsB family protein  34.83 
 
 
279 aa  52.4  0.000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.695059  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_5288  predicted protein  29.38 
 
 
188 aa  49.7  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0250872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>