133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0016 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0016  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 246 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000373362  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5095  beta-lactamase domain protein  35.38 
 
 		 293 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.046641  normal  0.029207 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5378  beta-lactamase domain protein  34.47 
 
 		 293 aa  99.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13255  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1235  beta-lactamase-like  28.95 
 
 		 295 aa  85.5  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.643095  normal  0.0366717 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0250  beta-lactamase domain-containing protein  27.8 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  25.84 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0248  beta-lactamase domain-containing protein  27.32 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  24.04 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  27.36 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  26.94 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  25.84 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  30.05 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 		 326 aa  65.5  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  31.47 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1853  beta-lactamase domain-containing protein  26.22 
 
 		 356 aa  63.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113565  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2155  Zn-dependent hydrolase  27.17 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2169  Zn-dependent hydrolase  27.17 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0145337  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2414  metallo-beta-lactamase family protein  27.17 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2235  metallo-beta-lactamase family protein  26.63 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2399  metallo-beta-lactamase family protein  26.63 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.295399  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  30.72 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  30.72 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  24.52 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2362  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2969  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  normal  0.106723 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1920  beta-lactamase domain protein  26.96 
 
 		 320 aa  58.9  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1524  beta-lactamase domain-containing protein  26.34 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  29.14 
 
 		 318 aa  58.5  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4160  SoxH protein-like  29.01 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.671969  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  30.05 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  29.21 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  33.02 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  30.37 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  30.37 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1371  Beta-lactamase  30.71 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265267  normal  0.207163 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  26.67 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1485  beta-lactamase domain-containing protein  25.57 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168088  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4732  beta-lactamase domain-containing protein  31.98 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.851796  normal  0.788219 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2499  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2433  metallo-beta-lactamase family protein  24.46 
 
 		 288 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000453521  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  27.59 
 
 		 316 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  26.11 
 
 		 314 aa  55.5  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  30 
 
 		 319 aa  55.5  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  28.41 
 
 		 318 aa  54.7  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  30.51 
 
 		 438 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2207  beta-lactamase domain-containing protein  23.59 
 
 		 288 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.888574  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  28.83 
 
 		 304 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0272  beta-lactamase domain protein  25.71 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000021825  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6499  beta-lactamase domain protein  25.44 
 
 		 319 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  32.35 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 321 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  32.67 
 
 		 315 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1369  beta-lactamase domain-containing protein  24.24 
 
 		 595 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.923314  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  31.62 
 
 		 339 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  26.44 
 
 		 317 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  27.01 
 
 		 316 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  26.29 
 
 		 317 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  29.49 
 
 		 319 aa  52.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  27.75 
 
 		 327 aa  52.8  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  31.62 
 
 		 339 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  29.49 
 
 		 319 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  32.46 
 
 		 319 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  30.88 
 
 		 319 aa  52.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  32.46 
 
 		 319 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  34.38 
 
 		 329 aa  52  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  32.46 
 
 		 336 aa  52  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  27.31 
 
 		 637 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  29.01 
 
 		 319 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  25.94 
 
 		 314 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1178  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 290 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  29.3 
 
 		 332 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  23.89 
 
 		 305 aa  50.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  30 
 
 		 349 aa  49.7  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  24.55 
 
 		 311 aa  49.7  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2355  beta-lactamase domain protein  26.38 
 
 		 444 aa  48.9  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1870  beta-lactamase domain-containing protein  24.3 
 
 		 591 aa  48.9  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  27.32 
 
 		 319 aa  48.5  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1700  Beta-lactamase-like  32.17 
 
 		 382 aa  48.5  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1902  beta-lactamase domain-containing protein  27.7 
 
 		 287 aa  48.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  25.7 
 
 		 287 aa  48.1  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3260  beta-lactamase domain-containing protein  28.43 
 
 		 275 aa  48.5  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  30.08 
 
 		 310 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3580  beta-lactamase-like  25 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  30.7 
 
 		 319 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2285  beta-lactamase-like  25.83 
 
 		 311 aa  47.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  26.19 
 
 		 315 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3034  beta-lactamase domain-containing protein  28.08 
 
 		 275 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.641137 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1880  Beta-lactamase-like  27.35 
 
 		 367 aa  47  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000360179  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4173  beta-lactamase domain-containing protein  30.16 
 
 		 233 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0717561  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0116  beta-lactamase domain-containing protein  23.19 
 
 		 242 aa  47  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000189379  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0456  beta-lactamase domain protein  25.55 
 
 		 303 aa  47  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  24.67 
 
 		 210 aa  47  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  24.88 
 
 		 318 aa  46.6  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  23.88 
 
 		 312 aa  46.2  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3778  beta-lactamase domain-containing protein  24.39 
 
 		 319 aa  45.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616764 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1866  beta-lactamase domain protein  24.57 
 
 		 320 aa  45.8  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.914687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  32.71 
 
 		 313 aa  45.4  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2200  hypothetical protein  25.16 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000014368  normal  0.0101984 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0686  beta-lactamase domain-containing protein  28.21 
 
 		 597 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.459688 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>