58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0015 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0015  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  228  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000351673  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2602  hypothetical protein  46.02 
 
 
115 aa  92  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00587907  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0130  hypothetical protein  41.44 
 
 
111 aa  89  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.314669  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0468  hypothetical protein  39.64 
 
 
111 aa  87  8e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0179279  hitchhiker  0.0000000186223 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0466  hypothetical protein  40.91 
 
 
115 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0779  hypothetical protein  43.24 
 
 
115 aa  80.5  0.000000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.790907  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3197  hypothetical protein  37.5 
 
 
114 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.218996 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2357  hypothetical protein  43.75 
 
 
115 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.108043  normal  0.13706 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3253  putative signal peptide protein  35.9 
 
 
152 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3257  putative signal peptide protein  34.48 
 
 
152 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1583  hypothetical protein  29.73 
 
 
119 aa  60.8  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0253638  normal  0.163534 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0065  hypothetical protein  31.58 
 
 
112 aa  60.5  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1822  Domain of unknown function DUF1791  31.3 
 
 
112 aa  59.3  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.699958  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3127  hypothetical protein  34.48 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3455  hypothetical protein  34.48 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3680  hypothetical protein  33.62 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1221  hypothetical protein  31.75 
 
 
127 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0093  hypothetical protein  33.9 
 
 
116 aa  57.8  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1837  hypothetical protein  29.57 
 
 
150 aa  57.8  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3421  putative signal peptide protein  33.33 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0536  hypothetical protein  30.4 
 
 
123 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2431  putative signal peptide protein  27.83 
 
 
137 aa  53.5  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0468  hypothetical protein  30.63 
 
 
112 aa  52.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2158  hypothetical protein  27.41 
 
 
163 aa  52  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0139  hypothetical protein  27.05 
 
 
151 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433672  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1472  hypothetical protein  23.66 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00198336  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1593  hypothetical protein  31.3 
 
 
113 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0563903  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1669  hypothetical protein  32.17 
 
 
113 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2282  hypothetical protein  30.43 
 
 
113 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3773  hypothetical protein  29.91 
 
 
143 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1016  hypothetical protein  29.63 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.041668  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3669  hypothetical protein  25.41 
 
 
150 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.522918  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6946  Domain of unknown function DUF1791  29.82 
 
 
151 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1233  hypothetical protein  26.96 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4871  hypothetical protein  29.82 
 
 
151 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4969  hypothetical protein  24.59 
 
 
150 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4380  hypothetical protein  25.41 
 
 
150 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4145  protein of unknown function DUF1791  33.05 
 
 
153 aa  47  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2894  hypothetical protein  25.41 
 
 
156 aa  47  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1053  hypothetical protein  25.66 
 
 
180 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  0.267344 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1398  domain of unknown function DUF1791  32.5 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0509  hypothetical protein  29.57 
 
 
165 aa  45.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0289752  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4264  hypothetical protein  23.77 
 
 
150 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.901179  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2749  hypothetical protein  30.09 
 
 
110 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.172817  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2369  hypothetical protein  30.09 
 
 
110 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.380561  hitchhiker  0.0000591661 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0564  hypothetical protein  27.78 
 
 
147 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0692  Domain of unknown function DUF1791  28.46 
 
 
147 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0872755 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0120  protein of unknown function DUF1791  34.75 
 
 
154 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0768427 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2301  Domain of unknown function DUF1791  25.64 
 
 
162 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.583301  normal  0.0480111 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0805  hypothetical protein  29.91 
 
 
150 aa  44.3  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1135  hypothetical protein  30.77 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.401796 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1626  hypothetical protein  25.53 
 
 
110 aa  43.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6915  YchN-like domain-containing protein  23.77 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.521749 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0691  Domain of unknown function DUF1791  27.35 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0623346 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0896  hypothetical protein  23.85 
 
 
163 aa  42.4  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0808  hypothetical protein  28.21 
 
 
145 aa  41.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.893436  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1803  hypothetical protein  27.68 
 
 
116 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.268314 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0874  hypothetical protein  35.19 
 
 
171 aa  40.4  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.100983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>