98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_R0029 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112966  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0035  tRNA-Leu  89.53 
 
 		 88 bp  85.7  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000252903  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0055  tRNA-Leu  89.53 
 
 		 85 bp  83.8  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000760879  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0074  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  83.8  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000023542  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0055  tRNA-Leu  97.78 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000135944  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0040  tRNA-Leu  97.78 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000586892  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0067  tRNA-Leu  91.04 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000338605  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0070  tRNA-Leu  91.07 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00142723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.316898  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0056  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0055  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00000273568  normal  0.583061 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0001  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.484304  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0035  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 88 bp  54  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17070  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 88 bp  54  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.779723 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0067  tRNA-Leu  93.02 
 
 		 83 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00988664 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0045  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259532  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207592  hitchhiker  0.00400711 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0025  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0069  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.649401 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0028  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.380759  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00430  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.366056  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.48253  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0050  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.155875  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14022  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0016  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.730547 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0027  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0037  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.994208  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0029  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711987 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0112279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0072  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0047  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.343405  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  50.1  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0055  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0868413 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.068778  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0063  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.727445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0034  tRNA-Leu  90 
 
 		 81 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.874898  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0063  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16310  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.352958  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0036  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000019352  hitchhiker  0.000141748 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0030  tRNA-Leu  90 
 
 		 81 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0040  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00145069  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0030  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0290157  normal  0.678466 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0024  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.7456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0027  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.994542  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0036  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0018  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0024  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.478295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0035  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0033  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.34016  normal  0.730319 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0086  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  46.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0989322 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.98053 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309291  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.932316 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0002  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.867688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0026  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.123748  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00250  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.427381  normal  0.701235 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.012184 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0030  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0046  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.592692  normal  0.555862 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.333155  hitchhiker  0.000426709 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0027  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.787126 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0008  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0007  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14003  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0039  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000240942  unclonable  0.0000109748 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.589576  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0026  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.46023  hitchhiker  0.0000702886 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0048  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.451467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00820  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0503548  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11760  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.764156  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0028  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.639598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0055  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.924042  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1519  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428065  normal  0.832242 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.531024  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03620  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0256458  normal  0.0430862 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0004  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.549944  normal  0.0458093 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0072  tRNA-Leu  84.85 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000217176  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0072  tRNA-Leu  84.85 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000050044  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0056  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.756385 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0049  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000350278 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0041  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0056  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.177317  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02220  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00225863  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31720  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0014  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000108759  hitchhiker  0.00000048604 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0033  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.37116 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0009  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3379  hypothetical protein  96.15 
 
 		 174 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0022  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0051  tRNA-Leu  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0246748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>