118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_R0019 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  172  9e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.531024  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0038  tRNA-Leu  89.66 
 
 
86 bp  93.7  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00225863  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0027  tRNA-Leu  89.77 
 
 
87 bp  87.7  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  85.19 
 
 
87 bp  65.9  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0054  tRNA-Leu  95.56 
 
 
88 bp  65.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0001  tRNA-Leu  95.12 
 
 
87 bp  65.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.484304  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0025  tRNA-Leu  95.12 
 
 
84 bp  65.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.333902  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0019  tRNA-Leu  94.87 
 
 
85 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000126286  hitchhiker  0.0000000180291 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0072  tRNA-Leu  85.9 
 
 
86 bp  60  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000050044  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0072  tRNA-Leu  85.9 
 
 
86 bp  60  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000217176  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0019  tRNA-Leu  93.48 
 
 
87 bp  60  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0357055  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0598  tRNA-Leu  94.74 
 
 
86 bp  60  0.00000009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0076  tRNA-Leu  86.59 
 
 
87 bp  60  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000528748  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0066  tRNA-Leu  95.24 
 
 
87 bp  60  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.557427  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0008  tRNA-Leu  85.19 
 
 
85 bp  60  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0407905  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0050  tRNA-Leu  85.19 
 
 
86 bp  58  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000589808  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0005  tRNA-Leu  95 
 
 
84 bp  56  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0022  tRNA-Leu  95 
 
 
87 bp  56  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0054  tRNA-Leu  93.18 
 
 
86 bp  56  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000628501  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0020  tRNA-Leu  95 
 
 
85 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0381951  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0017  tRNA-Leu  95 
 
 
85 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0015  tRNA-Leu  94.87 
 
 
82 bp  54  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0181398  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0050  tRNA-Leu  94.87 
 
 
82 bp  54  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.167619  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0030  tRNA-Leu  83.95 
 
 
85 bp  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169426  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0051  tRNA-Leu  92.86 
 
 
84 bp  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0035  tRNA-Leu  92.86 
 
 
87 bp  52  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.986583  normal  0.610194 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0027  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  50.1  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.994542  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0024  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  50.1  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.478295  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  50.1  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.711987 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0024  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  50.1  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.7456  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0036  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  50.1  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14022  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  50.1  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0028  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  50.1  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.639598  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0049  tRNA-Leu  90.24 
 
 
83 bp  50.1  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000122389  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0031  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  50.1  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0989322 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17070  tRNA-Leu  100 
 
 
88 bp  50.1  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.779723 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0044  tRNA-Leu  92.68 
 
 
87 bp  50.1  0.00009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000291154  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0022  tRNA-Leu  92.68 
 
 
86 bp  50.1  0.00009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000969844  normal  0.805987 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0061  tRNA-Leu  90.24 
 
 
83 bp  50.1  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0103  tRNA-Leu  90.24 
 
 
83 bp  50.1  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0040  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  50.1  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00145069  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  48.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.873101  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0003  tRNA-Leu  93.75 
 
 
86 bp  48.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.589576  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0028  tRNA-Leu  100 
 
 
88 bp  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.380759  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0039  tRNA-Leu  92.5 
 
 
84 bp  48.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000063325  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0033  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.34016  normal  0.730319 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0034  tRNA-Leu  100 
 
 
83 bp  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0750  tRNA-Leu  90.91 
 
 
84 bp  48.1  0.0003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0003  tRNA-Leu  93.75 
 
 
83 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.123748  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0029  tRNA-Leu  90 
 
 
84 bp  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0406184  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1580  tRNA-Leu  92.5 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1615  tRNA-Leu  92.5 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.622416 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0040  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0360515  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0057  tRNA-Leu  90.91 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0404485  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0006  tRNA-Leu  92.5 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0789376  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0030  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0003  tRNA-Leu  93.75 
 
 
83 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.012184 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0003  tRNA-Leu  93.75 
 
 
83 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0003  tRNA-Leu  93.75 
 
 
83 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.98053 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0002  tRNA-Leu  93.75 
 
 
83 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.867688  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  48.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0025  tRNA-Leu  92.5 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000676753  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14003  tRNA-Leu  93.75 
 
 
86 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.994208  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0058  tRNA-Leu  92.5 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000819667  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0045  tRNA-Leu  86.11 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21120  tRNA-Leu  100 
 
 
83 bp  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.387136  normal  0.20293 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000434442 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0027  tRNA-Leu  92.5 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0033  tRNA-Leu  92.5 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21100  tRNA-Leu  100 
 
 
83 bp  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570038  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0056  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.177317  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13650  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00181798  normal  0.743101 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0036  tRNA-Leu  100 
 
 
88 bp  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0619619  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 
88 bp  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0612357  normal  0.0343105 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0036  tRNA-Leu  100 
 
 
83 bp  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000019352  hitchhiker  0.000141748 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00250  tRNA-Leu  93.75 
 
 
83 bp  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.427381  normal  0.701235 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0003  tRNA-Leu  93.75 
 
 
86 bp  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0002  tRNA-Leu  92.31 
 
 
82 bp  46.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.318863  normal  0.56109 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0031  tRNA-Leu  92.31 
 
 
84 bp  46.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.045624  normal  0.187566 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1519  tRNA-Leu  91.43 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428065  normal  0.832242 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0036  tRNA-Leu  90.7 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0033  tRNA-Leu  92.31 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0022  tRNA-Leu  92.31 
 
 
84 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0028  tRNA-Leu  92.31 
 
 
82 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444964  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0055  tRNA-Leu  92.31 
 
 
82 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143811  hitchhiker  0.0000015114 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0055  tRNA-Leu  96.3 
 
 
86 bp  46.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0868413 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0004  tRNA-Leu  92.31 
 
 
82 bp  46.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.446366  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0031  tRNA-Leu  92.31 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000305297  normal  0.643449 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0004  tRNA-Leu  93.55 
 
 
83 bp  46.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.889028 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  96.15 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.0000012405  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  83.33 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.3138200000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  83.33 
 
 
89 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000162179  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  83.33 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000815391  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0003  tRNA-Leu  90.48 
 
 
84 bp  44.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0112279  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207592  hitchhiker  0.00400711 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0050  tRNA-Leu  83.33 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000197413  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>