52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_R0014 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_R0014  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  6.05229e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0045  tRNA-Met  88.52 
 
 
77 bp  65.9  1e-09  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0018  tRNA-Met  88.52 
 
 
77 bp  65.9  1e-09  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0583906 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0022  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  61.9  2e-08  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.243282  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0010  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  61.9  2e-08  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.528642 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0044  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  61.9  2e-08  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.503694  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0027  tRNA-Met  85.92 
 
 
77 bp  61.9  2e-08  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.800046  normal  0.352894 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0020  tRNA-Met  85.14 
 
 
74 bp  60  8e-08  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.070977  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0013  tRNA-Met  85.14 
 
 
74 bp  60  8e-08  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0024  tRNA-Met  86.15 
 
 
77 bp  58  3e-07  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.71351e-13  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0014  tRNA-Met  87.3 
 
 
73 bp  54  5e-06  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0720319  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0041  tRNA-Met  96.77 
 
 
77 bp  54  5e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.904043  normal  0.246653 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0010  tRNA-Met  85.71 
 
 
74 bp  54  5e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159974  normal  0.242309 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0014  tRNA-Met  96.77 
 
 
77 bp  54  5e-06  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.65159  normal  0.954278 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0043  tRNA-Met  96.77 
 
 
77 bp  54  5e-06  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.931817  normal  0.538604 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0043  tRNA-Met  96.77 
 
 
77 bp  54  5e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.48657 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0028  tRNA-Met  96.77 
 
 
77 bp  54  5e-06  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570656  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0058  tRNA-Met  96.77 
 
 
77 bp  54  5e-06  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.272265 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0010  tRNA-Met  85.33 
 
 
76 bp  54  5e-06  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.373592  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0016  tRNA-Met  96.77 
 
 
77 bp  54  5e-06  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.5439  normal  0.106443 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0038  tRNA-Met  96.77 
 
 
77 bp  54  5e-06  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.545151  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0003  tRNA-Met  96.77 
 
 
77 bp  54  5e-06  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124761  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0025  tRNA-Met  96.77 
 
 
77 bp  54  5e-06  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0720614  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0038  tRNA-Met  96.77 
 
 
77 bp  54  5e-06  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0040  tRNA-Met  84.51 
 
 
77 bp  54  5e-06  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0666979  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0051  tRNA-Met  85.33 
 
 
76 bp  54  5e-06  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0039  tRNA-Met  84.51 
 
 
77 bp  54  5e-06  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.10538  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0005  tRNA-Met  83.78 
 
 
74 bp  52  2e-05  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0072  tRNA-Met  87.1 
 
 
73 bp  52  2e-05  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.916606  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0043  tRNA-Met  85.96 
 
 
77 bp  50.1  8e-05  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.50689  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0067  tRNA-Met  84.42 
 
 
76 bp  50.1  8e-05  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268357  normal  0.588554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0047  tRNA-Met  83.12 
 
 
77 bp  50.1  8e-05  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.921613  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Met-1  tRNA-Met  86.15 
 
 
73 bp  50.1  8e-05  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0495998  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0060  tRNA-Met  83.12 
 
 
77 bp  50.1  8e-05  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0064072  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0030  tRNA-Met  85.71 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00179539  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0048  tRNA-Met  85.71 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565374  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0016  tRNA-Met  82.89 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03520  tRNA-Met  85.71 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.673814  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0018  tRNA-Met  85.71 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0025  tRNA-Met  88.37 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  1.57655e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0047  tRNA-Met  87.34 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00104453  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0024  tRNA-Met  88.37 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA14  tRNA-Met  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0043  tRNA-Met  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0051  tRNA-Met  85.71 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0027  tRNA-Met  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0053  tRNA-Met  85.71 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.796609 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1025  tRNA-Met  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0262205  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0026  tRNA-Met  84.75 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  3.11751e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0016  tRNA-Met  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0009  tRNA-Met  88.37 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1546  tRNA-Met  93.55 
 
 
79 bp  46.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>