More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_R0012 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_R0012  tRNA-Met  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  6.64581e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0076  tRNA-Met  98.68 
 
 
77 bp  135  2e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0262196  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0013  tRNA-Met  98.68 
 
 
77 bp  135  2e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.474812  normal  0.0245771 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0056  tRNA-Met  98.68 
 
 
77 bp  135  2e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0020  tRNA-Met  98.68 
 
 
77 bp  135  2e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.798024  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0030  tRNA-Met  98.68 
 
 
77 bp  135  2e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0073  tRNA-Met  98.68 
 
 
77 bp  135  2e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0113  tRNA-Met  98.68 
 
 
77 bp  135  2e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000187631  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0042  tRNA-Met  98.68 
 
 
77 bp  135  2e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0020  tRNA-Met  98.68 
 
 
77 bp  135  2e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5678  tRNA-Met  97.37 
 
 
79 bp  127  4e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.015213  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-3  tRNA-Met  97.37 
 
 
80 bp  127  4e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000267735  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-2  tRNA-Met  97.37 
 
 
80 bp  127  4e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0383767  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5710  tRNA-Met  97.37 
 
 
79 bp  127  4e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  9.1391e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-8  tRNA-Met  97.37 
 
 
80 bp  127  4e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5737  tRNA-Met  97.37 
 
 
79 bp  127  4e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.12746e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0790  tRNA-Met  97.37 
 
 
79 bp  127  4e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3991e-32 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4773  tRNA-Met  97.37 
 
 
79 bp  127  4e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  6.65438e-06  hitchhiker  6.54659e-16 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0068  tRNA-Met  97.37 
 
 
77 bp  127  4e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-2  tRNA-Met  97.37 
 
 
77 bp  127  4e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.527253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0282  tRNA-Met  97.37 
 
 
79 bp  127  4e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-4  tRNA-Met  97.37 
 
 
77 bp  127  4e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  7.68608e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0529  tRNA-Met  97.37 
 
 
79 bp  127  4e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.17979e-29 
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-6  tRNA-Met  97.37 
 
 
80 bp  127  4e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.255e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5667  tRNA-Met  97.37 
 
 
79 bp  127  4e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  8.79492e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-4  tRNA-Met  97.37 
 
 
80 bp  127  4e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0024  tRNA-Met  97.37 
 
 
77 bp  127  4e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  1.57655e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0023  tRNA-Met  97.37 
 
 
77 bp  127  4e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  3.39625e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5675  tRNA-Met  97.37 
 
 
77 bp  127  4e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  3.76256e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5807  tRNA-Met  97.37 
 
 
79 bp  127  4e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00231597  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0043  tRNA-Met  97.37 
 
 
77 bp  127  4e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.399945  normal  0.221378 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5667  tRNA-Met  97.37 
 
 
77 bp  127  4e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5699  tRNA-Met  97.37 
 
 
77 bp  127  4e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  3.50684e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0306  tRNA-Met  97.37 
 
 
79 bp  127  4e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0604  tRNA-Met  97.37 
 
 
79 bp  127  4e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  9.69852e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-3  tRNA-Met  97.37 
 
 
80 bp  127  4e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00436106  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-7  tRNA-Met  97.37 
 
 
80 bp  127  4e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0069  tRNA-Met  97.37 
 
 
77 bp  127  4e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-2  tRNA-Met  97.37 
 
 
80 bp  127  4e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0182265  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0865  tRNA-Met  97.37 
 
 
79 bp  127  4e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  8.13952e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2792  tRNA-Met  96 
 
 
76 bp  125  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  9.35283e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2481  tRNA-Met  96 
 
 
76 bp  125  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000303707  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0025  tRNA-Met  96 
 
 
76 bp  125  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2478  tRNA-Met  96 
 
 
76 bp  125  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00948036  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0050  tRNA-Met  98.59 
 
 
77 bp  125  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.540362  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2795  tRNA-Met  96 
 
 
76 bp  125  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  1.69803e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0064  tRNA-Met  96.05 
 
 
77 bp  119  1e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0043  tRNA-Met  96.05 
 
 
77 bp  119  1e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0057  tRNA-Met  96.05 
 
 
77 bp  119  1e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0026  tRNA-Met  96.05 
 
 
77 bp  119  1e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0368817  normal  0.25242 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4991  tRNA-Met  96.05 
 
 
79 bp  119  1e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5049  tRNA-Met  96.05 
 
 
79 bp  119  1e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  2.36234e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0082  tRNA-Met  96.05 
 
 
77 bp  119  1e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000739583  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0081  tRNA-Met  96.05 
 
 
77 bp  119  1e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000214937  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0046  tRNA-Met  96.05 
 
 
77 bp  119  1e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  1.50428e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0022  tRNA-Met  96.05 
 
 
77 bp  119  1e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.136375  normal  0.0369046 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0023  tRNA-Met  96.05 
 
 
77 bp  119  1e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205789  normal  0.0373381 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5022  tRNA-Met  96.05 
 
 
79 bp  119  1e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00192595  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0052  tRNA-Met  96.05 
 
 
77 bp  119  1e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0858392  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0025  tRNA-Met  96.05 
 
 
77 bp  119  1e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.279282  normal  0.0688605 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0057  tRNA-Met  96.05 
 
 
77 bp  119  1e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  6.30751e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0127  tRNA-Met  96.05 
 
 
77 bp  119  1e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00272429  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0105  tRNA-Met  96.05 
 
 
77 bp  119  1e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0093247  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0078  tRNA-Met  96.05 
 
 
77 bp  119  1e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  6.12862e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0224  tRNA-Met  96.05 
 
 
79 bp  119  1e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  9.3753e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4566  tRNA-Met  96.05 
 
 
79 bp  119  1e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  2.36234e-08  normal  0.0841904 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5037  tRNA-Met  96.05 
 
 
79 bp  119  1e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.794581  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0131  tRNA-Met  96.05 
 
 
77 bp  119  1e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.14207  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0027  tRNA-Met  96.05 
 
 
77 bp  119  1e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0686525  normal  0.260083 
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-5  tRNA-Met  96.05 
 
 
80 bp  119  1e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.996221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-5  tRNA-Met  96.05 
 
 
80 bp  119  1e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  5.20832e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt41  tRNA-Met  96.05 
 
 
77 bp  119  1e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0048  tRNA-Met  96.05 
 
 
77 bp  119  1e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.459863  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt41  tRNA-Met  96.05 
 
 
77 bp  119  1e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-6  tRNA-Met  96.05 
 
 
77 bp  119  1e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00021362  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0080  tRNA-Met  96.05 
 
 
77 bp  119  1e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00406069  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0031  tRNA-Met  96.05 
 
 
77 bp  119  1e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0010  tRNA-Met  96.05 
 
 
77 bp  119  1e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  5.63126e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-4  tRNA-Met  96.05 
 
 
80 bp  119  1e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00179817  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-3  tRNA-Met  96.05 
 
 
77 bp  119  1e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  1.04946e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0054  tRNA-Met  96.05 
 
 
77 bp  119  1e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Met-2  tRNA-Met  96.05 
 
 
77 bp  119  1e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0047  tRNA-Met  96.05 
 
 
77 bp  119  1e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS03940  tRNA-Met  96.05 
 
 
77 bp  119  1e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5720  tRNA-Met  96.05 
 
 
77 bp  119  1e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0159176  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-3  tRNA-Met  96.05 
 
 
80 bp  119  1e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  1.74152e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0010  tRNA-Met  96.05 
 
 
77 bp  119  1e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00010521  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0060  tRNA-Met  96.05 
 
 
77 bp  119  1e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS03939  tRNA-Met  96.05 
 
 
77 bp  119  1e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0034  tRNA-Met  97.18 
 
 
77 bp  117  4e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0131764 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0086  tRNA-Met  94.67 
 
 
76 bp  117  4e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0042  tRNA-Met  94.67 
 
 
76 bp  117  4e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.324618  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0014  tRNA-Met  94.67 
 
 
76 bp  117  4e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0026  tRNA-Met  94.67 
 
 
76 bp  117  4e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  6.52648e-26  unclonable  4.88908e-08 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0024  tRNA-Met  94.67 
 
 
76 bp  117  4e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0898053 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0019  tRNA-Met  94.67 
 
 
76 bp  117  4e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0324694  normal  0.0212218 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0007  tRNA-Met  94.67 
 
 
76 bp  117  4e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269923  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3136  tRNA-Met  94.74 
 
 
77 bp  111  2e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.364243  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3478  tRNA-Met  94.74 
 
 
77 bp  111  2e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0035  tRNA-Met  94.74 
 
 
77 bp  111  2e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.84698e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>