179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_R0010 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_R0010  tRNA-Asn  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00716617  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0075  tRNA-Asn  97.18 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000782806  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0029  tRNA-Asn  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0042  tRNA-Asn  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0090  tRNA-Asn  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0054  tRNA-Asn  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0083  tRNA-Asn  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.233313  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0075  tRNA-Asn  94.37 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0888868  normal  0.929022 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0011  tRNA-Asn  94.37 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.36604 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0046  tRNA-Asn  94.37 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000438638  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0041  tRNA-Asn  98.25 
 
 		 75 bp  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000401156  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0039  tRNA-Asn  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268211  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0027  tRNA-Asn  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.103485  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0013  tRNA-Asn  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0041  tRNA-Asn  91.55 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0057  tRNA-Asn  91.55 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000258126  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0042  tRNA-Asn  91.55 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000213291  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0084  tRNA-Asn  91.55 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000101082  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0047  tRNA-Asn  90.41 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000000251185  normal  0.812325 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0008  tRNA-Asn  90.41 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0851483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0023  tRNA-Asn  91.18 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0800816  normal  0.0382047 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0055  tRNA-Asn  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0338402  normal  0.0404026 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0052  tRNA-Asn  92.98 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.274445  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0013  tRNA-Asn  89.04 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00234115  normal  0.764739 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0032  tRNA-Asn  92.98 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000118975  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0081  tRNA-Asn  88.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0021  tRNA-Asn  88.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000441917  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0019  tRNA-Asn  88.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0021  tRNA-Asn  88.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0601  tRNA-Glu  94.12 
 
 		 155 bp  77.8  0.0000000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0027  tRNA-Asn  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0226012  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07580  tRNA-Asn  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.16811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0043  tRNA-Asn  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0043  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0053  tRNA-Asn  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0280094  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0039  tRNA-Asn  90.91 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092174  hitchhiker  0.00180785 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0029  tRNA-Asn  90.91 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0127801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0010  tRNA-Asn  92 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt06  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00593265  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0056  tRNA-Asn  92 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0033  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00239768  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0649  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000525296  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0682  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000249623  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0589  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0064  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.187513  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0018  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.723624  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5671  tRNA-Asx  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000157902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-5  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000140923  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asn-4  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.043106  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000206575  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5148  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000015109  normal  0.479478 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000655937  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4777  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000213851  hitchhiker  0.0000000000000219436 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0524  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4385300000000005e-28 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5706  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000905345  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0600  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000379275  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0033  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.104706  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0077  tRNA-Asn  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000930167  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0056  tRNA-Asn  88.14 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0036  tRNA-Met  89.09 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582782  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0007  tRNA-Asn  87.93 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0037  tRNA-Asn  88.89 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0034  tRNA-Asn  88.89 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.171102  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0043  tRNA-Asn  88.89 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0112314 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0028  tRNA-Asn  88.89 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0531  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1748  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0021  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0500  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00327724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5656  tRNA-Asx  85.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484594  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  85.29 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014846  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  85.29 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0717839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  85.29 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0120777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-4  tRNA-Asn  85.29 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000216624  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  85.29 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asn-5  tRNA-Asn  85.29 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00125687  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  85.29 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000262097  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-4  tRNA-Asn  85.29 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.449639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-5  tRNA-Asn  85.29 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234243  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0231  tRNA-Asn  85.29 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00193561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4560  tRNA-Glu  85.29 
 
 		 153 bp  56  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000215336  normal  0.0816805 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0042  tRNA-Asn  90.91 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0276832  normal  0.778358 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4984  tRNA-Asn  85.29 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0796  tRNA-Glu  85.29 
 
 		 153 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.41258e-33 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0020  tRNA-Asn  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0246205 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0291  tRNA-Asn  85.29 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000683434  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0033  tRNA-Asn  85.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000091972  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0074  tRNA-Asn  85.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000257453  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0111  tRNA-Asn  85.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00999623  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0120  tRNA-Asn  85.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0269  tRNA-Asn  85.29 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0020  tRNA-Asn  90.91 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.387478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5053  tRNA-Asn  85.29 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000166826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0124  tRNA-Asn  85.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.865634  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0042  tRNA-Asn  85.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000134576  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0115  tRNA-Asn  85.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>