255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2238 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_2238  ribosomal protein L34  100 
 
 		 44 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.773424  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0092  ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  63.2  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4370  ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  61.6  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.09492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2065  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  61.2  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000217746  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2935  ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000367166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4432  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 49 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3089  ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1437  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3434  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002542  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3562  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0046  ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  58.2  0.00000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3545  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1898  ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 54 aa  58.2  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000611674  hitchhiker  3.5180100000000004e-26 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2414  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 		 44 aa  58.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000429596  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4796  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4143  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.281365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5015  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  58.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0521  ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.907647  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4361  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 49 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4517  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 49 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1864  50S ribosomal protein L34P  70.45 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.670126  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3626  50S ribosomal protein L34  69.05 
 
 		 49 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.118828  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4498  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 49 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4908  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.442664 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4116  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0205607  normal  0.0561719 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4388  ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 44 aa  57  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000381173 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2119  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4245  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000109099  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf883  ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 48 aa  57  0.00000007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4138  ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 45 aa  57.4  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00368218  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6059  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 44 aa  57  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0823674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3608  ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  57  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2334  50S ribosomal protein L34  74.36 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1944  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00370795  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1568  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 47 aa  56.6  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0660974  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0709  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 48 aa  55.5  0.0000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0204  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4487  ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849089  hitchhiker  0.00000000110171 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3828  50S ribosomal protein L34P  69.05 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5639  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5341  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000589989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5185  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165607  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4204  50S ribosomal protein L34  71.79 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000294632  decreased coverage  0.00182284 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5615  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.106423  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2243  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.914999  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5281  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130444  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5738  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0731881  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5320  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5675  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5598  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4045  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 46 aa  55.1  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486459 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4028  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.105181  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0828  50S ribosomal protein L34  60.47 
 
 		 47 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6078  50S ribosomal protein L34  60.47 
 
 		 47 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0153372  normal  0.186265 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5302  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2950  ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 44 aa  54.3  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000318423  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4243  ribosomal protein L34  60.47 
 
 		 47 aa  53.9  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0239803  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1787  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 44 aa  53.9  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0214193  normal  0.25456 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3117  50S ribosomal protein L34  66.67 
 
 		 47 aa  54.3  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000116193  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1540  ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000041199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2088  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 44 aa  53.9  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.149936  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0001  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 45 aa  53.9  0.0000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000166725  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl682.1  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  53.9  0.0000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2793  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 45 aa  53.9  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.202877  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0135a  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  53.9  0.0000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000390368  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3463  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 44 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00766604  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4864  ribosomal protein L34  60.47 
 
 		 47 aa  53.5  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0279  ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 52 aa  52.8  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6371  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13959  50S ribosomal protein L34  58.14 
 
 		 47 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7341  50S ribosomal protein L34  58.14 
 
 		 45 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.880784 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4315  ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000480274  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2161  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 45 aa  53.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0551  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0134  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 52 aa  53.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3921  ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 55 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250811  normal  0.369762 
 
 
-
 
NC_002936  DET1043  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 46 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000531959  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3461  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0820  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  52.8  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9056  ribosomal protein L34  58.14 
 
 		 45 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00101546  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0001  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.549372  normal  0.504139 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1041  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  52.8  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00984353  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52480  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28540  LSU ribosomal protein L34P  65.12 
 
 		 44 aa  52.4  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000649644  hitchhiker  0.00109369 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0553  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  52.8  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_914  ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 46 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000254245  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3760  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3898  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  52  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.035137  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4868  ribosomal protein L34  61.9 
 
 		 47 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000339328  hitchhiker  0.00961108 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0984  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  52.8  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0751945  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3101  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000038228 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3184  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278531 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6523  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  51.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0104  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4463  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.404373  normal  0.0831526 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3102  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0409092 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2552  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.941562  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5413  50S ribosomal protein L34  60.47 
 
 		 47 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5789  50S ribosomal protein L34  60.47 
 
 		 47 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.885674  normal  0.0150043 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2238  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>