More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2229 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  100 
 
 		 286 aa  551  1e-156  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  49.49 
 
 		 321 aa  242  5e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  46.86 
 
 		 323 aa  231  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  44.26 
 
 		 302 aa  226  4e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2145  parB-like partition protein  46.9 
 
 		 283 aa  221  8e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9383  ParB-like partition protein  47.06 
 
 		 324 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39730  chromosome segregation DNA-binding protein  45.71 
 
 		 328 aa  215  9e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  45 
 
 		 329 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  46.69 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7092  parB-like partition protein  46.9 
 
 		 331 aa  209  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  54.02 
 
 		 306 aa  208  1e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  41.64 
 
 		 282 aa  206  5e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  38.21 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  38.21 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  43.59 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  40 
 
 		 283 aa  202  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  40 
 
 		 295 aa  202  5e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  44.94 
 
 		 309 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  39.16 
 
 		 283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  40.56 
 
 		 298 aa  199  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  45.58 
 
 		 289 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  38.81 
 
 		 283 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4977  parB-like partition protein  42.52 
 
 		 312 aa  199  5e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  38.46 
 
 		 283 aa  199  6e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  38.38 
 
 		 283 aa  198  9e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2551  parB-like partition protein  43.33 
 
 		 379 aa  197  1.0000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00820425  normal  0.388314 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  38.38 
 
 		 283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6480  parB-like partition protein  43.33 
 
 		 358 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_008532  STER_2003  ParB-like nuclease domain-containing protein  41.54 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  38.16 
 
 		 289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  44.77 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  38.46 
 
 		 283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  38.38 
 
 		 283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5406  chromosome segregation DNA-binding protein  44.77 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  44.77 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  38.03 
 
 		 283 aa  195  6e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4693  chromosome segregation DNA-binding protein  41.41 
 
 		 318 aa  195  6e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  47.89 
 
 		 290 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  44.19 
 
 		 529 aa  194  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  43.46 
 
 		 274 aa  194  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5407  parB-like partition protein  44.91 
 
 		 377 aa  194  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  46.64 
 
 		 290 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  38.38 
 
 		 285 aa  193  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  41.47 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  46.64 
 
 		 290 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  40.27 
 
 		 307 aa  193  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6071  parB-like partition proteins  40.19 
 
 		 334 aa  193  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164971 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0835  parB-like partition protein  40.88 
 
 		 331 aa  193  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  39.1 
 
 		 294 aa  193  3e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  38.46 
 
 		 283 aa  192  4e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3719  parB-like partition protein  45.7 
 
 		 383 aa  192  4e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118734  hitchhiker  0.00185127 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  42.05 
 
 		 305 aa  192  4e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  45.83 
 
 		 286 aa  192  5e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  41.99 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4217  parB-like partition protein  44.57 
 
 		 472 aa  191  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31910  ParB-like partition protein  44.19 
 
 		 624 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.517394  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23400  ParB-like partition protein  44.49 
 
 		 268 aa  190  2.9999999999999997e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26960  chromosome segregation DNA-binding protein  42.86 
 
 		 367 aa  189  2.9999999999999997e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  40.39 
 
 		 256 aa  189  5e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  35.23 
 
 		 286 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0133  parB-like partition protein  38.75 
 
 		 294 aa  188  7e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13952  chromosome partitioning protein parB  38.46 
 
 		 344 aa  188  8e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  41 
 
 		 305 aa  188  8e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  42.28 
 
 		 314 aa  187  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37980  chromosome segregation DNA-binding protein  42.59 
 
 		 392 aa  187  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  40.35 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0038  spoOJ protein  37.79 
 
 		 280 aa  187  3e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  40 
 
 		 256 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4540  chromosome segregation DNA-binding protein  45.14 
 
 		 333 aa  187  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  40.74 
 
 		 304 aa  187  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  45.39 
 
 		 290 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  36.9 
 
 		 295 aa  186  4e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  38.11 
 
 		 305 aa  186  5e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  42.96 
 
 		 292 aa  185  6e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4506  parB-like partition protein  42.2 
 
 		 410 aa  186  6e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  37.97 
 
 		 306 aa  185  6e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  39.35 
 
 		 272 aa  185  7e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4857  parB-like partition protein  42.97 
 
 		 391 aa  185  7e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  44.88 
 
 		 280 aa  185  8e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5089  parB-like partition protein  43.3 
 
 		 347 aa  185  9e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  42.31 
 
 		 284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  40.89 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  37.92 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  43.73 
 
 		 295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2174  parB-like partition proteins  41.4 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000145902  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  45.75 
 
 		 287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2086  parB-like partition protein  40.55 
 
 		 292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  40.6 
 
 		 304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  40.69 
 
 		 293 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  37.99 
 
 		 278 aa  183  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  40.83 
 
 		 288 aa  183  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  37.5 
 
 		 314 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  41.22 
 
 		 304 aa  182  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  39.64 
 
 		 284 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  46.29 
 
 		 290 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  38.19 
 
 		 299 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  37.89 
 
 		 297 aa  182  7e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  34.49 
 
 		 281 aa  182  7e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2055  parB-like partition protein  40 
 
 		 298 aa  182  8.000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2942  parB-like partition protein  45.58 
 
 		 294 aa  181  8.000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>