More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2216 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  100 
 
 
94 aa  192  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  56.99 
 
 
95 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  58.51 
 
 
95 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  47.83 
 
 
98 aa  112  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  54.26 
 
 
95 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  53.19 
 
 
95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  46.81 
 
 
95 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  43.62 
 
 
95 aa  104  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  43.62 
 
 
96 aa  100  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  43.62 
 
 
96 aa  100  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  43.62 
 
 
96 aa  100  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  43.62 
 
 
96 aa  100  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  43.62 
 
 
96 aa  100  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  43.62 
 
 
96 aa  100  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  42.55 
 
 
96 aa  100  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  42.55 
 
 
96 aa  100  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  42.55 
 
 
96 aa  99.4  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  40.43 
 
 
95 aa  99.4  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  42.55 
 
 
96 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  39.36 
 
 
95 aa  98.6  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  47.83 
 
 
95 aa  99  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  43.62 
 
 
95 aa  96.3  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  43.62 
 
 
95 aa  96.3  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  42.55 
 
 
95 aa  94.7  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0424  30S ribosomal protein S6  42.11 
 
 
98 aa  93.6  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0413  30S ribosomal protein S6  42.11 
 
 
98 aa  93.6  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000259691  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  43.96 
 
 
96 aa  90.9  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1728  30S ribosomal protein S6  44.21 
 
 
96 aa  90.9  6e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000419207  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  46.32 
 
 
97 aa  90.1  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0044  30S ribosomal protein S6  40 
 
 
98 aa  89.4  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1714  30S ribosomal protein S6  42.11 
 
 
95 aa  88.6  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  42.55 
 
 
96 aa  87  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11560  SSU ribosomal protein S6P  41.3 
 
 
97 aa  86.7  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0123194  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3064  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 
135 aa  86.3  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.234735  normal  0.218428 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0515  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 
130 aa  84.3  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.38245  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3260  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 
131 aa  84.3  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000012398  hitchhiker  0.0000109167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0687  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 
131 aa  84.3  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000703568  hitchhiker  0.000317476 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0753  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 
131 aa  83.6  9e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000769486  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0007  30S ribosomal protein S6  44.09 
 
 
98 aa  83.6  9e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000068559  hitchhiker  0.0000000000002413 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  42.55 
 
 
96 aa  83.2  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1046  30S ribosomal protein S6  40.43 
 
 
109 aa  82.4  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000381184  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3930  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 
131 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0711  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 
131 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.165791  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0741  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 
131 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000275832  hitchhiker  0.000127866 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3643  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 
131 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00299983  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  38.46 
 
 
95 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0732  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 
131 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00282194  hitchhiker  0.0000000108888 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0701  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 
131 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000757321  hitchhiker  0.000144082 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2777  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 
122 aa  82  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000778979  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3351  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 
130 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000274411  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2503  30S ribosomal protein S6  41.49 
 
 
97 aa  81.6  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000597267  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002332  SSU ribosomal protein S6p  40.22 
 
 
129 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257781  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27920  ribosomal protein S6  37.23 
 
 
97 aa  81.6  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000627266  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2766  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.431916  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1951  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 
125 aa  81.6  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.380092  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0007  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 
98 aa  80.9  0.000000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132561  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_917  ribosomal protein S6  39.36 
 
 
109 aa  80.9  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000118903  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1970  ribosomal protein S6  41.94 
 
 
98 aa  80.9  0.000000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00222496  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  39.78 
 
 
94 aa  80.5  0.000000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4212  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 
139 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.553377  hitchhiker  0.000271078 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3669  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 
128 aa  80.1  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0045  ribosomal protein S6  42.39 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0929  30S ribosomal protein S6  39.36 
 
 
109 aa  79.7  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000641052  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3284  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 
135 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0114214  hitchhiker  0.000227969 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0757  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.228949  hitchhiker  0.00000160404 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3586  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0940753  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4339  ribosomal protein S6  39.78 
 
 
98 aa  79  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0911  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 
124 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0022  ribosomal protein S6  35.87 
 
 
97 aa  79.3  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000004173  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0010  30S ribosomal protein S6  40.66 
 
 
168 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0055  ribosomal protein S6  35.11 
 
 
94 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000548177  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4169  ribosomal protein S6  38.3 
 
 
94 aa  78.6  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0010  ribosomal protein S6  37.89 
 
 
146 aa  78.2  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000437004  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10052  30S ribosomal protein S6  39.36 
 
 
96 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00129452  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1219  30S ribosomal protein S6  39.56 
 
 
96 aa  77.8  0.00000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1383  ribosomal protein S6  39.13 
 
 
142 aa  77.8  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.760847  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  35.11 
 
 
131 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0446  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453306 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4664  SSU ribosomal protein S6P  39.36 
 
 
96 aa  78.2  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2386  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 
137 aa  78.2  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2446  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 
134 aa  77.8  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045402 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4751  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 
131 aa  77.8  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.502035  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4659  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 
131 aa  77.8  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4669  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 
131 aa  77.8  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0711098  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00023  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 
129 aa  77.8  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2824  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 
134 aa  77.8  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.254018  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  42.39 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4809  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 
131 aa  77.8  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.16196  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3639  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 
130 aa  77.4  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 
124 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0683  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 
130 aa  77.4  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 
124 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0308  ribosomal protein S6  35.87 
 
 
98 aa  77.4  0.00000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.052599 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3784  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 
130 aa  77.4  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 
124 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1897  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 
124 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0154353  hitchhiker  0.0000000595408 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2252  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 
124 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770355  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 
124 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 
124 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6034  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 
96 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342744  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>