More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2212 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  100 
 
 		 150 aa  290  5e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  52 
 
 		 150 aa  150  5.9999999999999996e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  51.72 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  45.89 
 
 		 148 aa  140  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  46.9 
 
 		 148 aa  137  6e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  50 
 
 		 149 aa  134  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  44.83 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  45.52 
 
 		 146 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  46.58 
 
 		 151 aa  122  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  45.58 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  44.52 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1422  50S ribosomal protein L9  44.97 
 
 		 151 aa  121  3e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0660955  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3412  50S ribosomal protein L9  43.92 
 
 		 149 aa  121  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  45.89 
 
 		 151 aa  121  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  44.52 
 
 		 148 aa  120  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  43.15 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3541  50S ribosomal protein L9  48.97 
 
 		 149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  43.45 
 
 		 147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  44.52 
 
 		 151 aa  118  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  40.56 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  42.28 
 
 		 151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  43.84 
 
 		 148 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  46.21 
 
 		 153 aa  117  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  41.1 
 
 		 148 aa  116  9e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  43.45 
 
 		 147 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  43.15 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  44.14 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 		 148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  44 
 
 		 151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  47.97 
 
 		 151 aa  114  6e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  43.15 
 
 		 149 aa  114  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  40.82 
 
 		 148 aa  113  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 150 aa  113  6.9999999999999995e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  44.83 
 
 		 151 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  44.9 
 
 		 148 aa  113  8.999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  44.14 
 
 		 148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  44.14 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  43.54 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  41.1 
 
 		 148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  41.1 
 
 		 147 aa  110  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  42.66 
 
 		 148 aa  110  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  41.78 
 
 		 151 aa  110  7.000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1359  ribosomal protein L9  40.88 
 
 		 151 aa  110  9e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0122536  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  43.05 
 
 		 151 aa  110  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  42.95 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3352  ribosomal protein L9  41.78 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600621  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0561  ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204129  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  43.45 
 
 		 147 aa  107  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0011  50S ribosomal protein L9  38.26 
 
 		 150 aa  107  7.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.557694  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1112  ribosomal protein L9  39.73 
 
 		 147 aa  106  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573323  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  43.84 
 
 		 148 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 149 aa  105  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  41.1 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  40.41 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 147 aa  104  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  38.62 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  41.78 
 
 		 167 aa  103  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2135  ribosomal protein L9  46.62 
 
 		 148 aa  103  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5262  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 148 aa  103  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00409171  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 149 aa  103  8e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1775  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 		 149 aa  103  8e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000651865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3991  50S ribosomal protein L9  45.65 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00054476 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 148 aa  102  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0830  ribosomal protein L9  40 
 
 		 149 aa  102  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.211438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  35.17 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0534  ribosomal protein L9  43.33 
 
 		 149 aa  102  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4009  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.015297  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39420  LSU ribosomal protein L9P  40.54 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1668  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 		 175 aa  101  4e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.197637  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  39.04 
 
 		 148 aa  100  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5620  50S ribosomal protein L9  41.61 
 
 		 148 aa  100  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000412151  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5657  50S ribosomal protein L9  41.61 
 
 		 148 aa  100  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3480  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 		 146 aa  100  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.34024  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2827  ribosomal protein L9  43.87 
 
 		 150 aa  100  9e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0597  50S ribosomal protein L9  36.91 
 
 		 179 aa  99.4  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  38.06 
 
 		 191 aa  99.4  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  36.55 
 
 		 157 aa  98.6  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0894  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 149 aa  97.8  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000571684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5339  50S ribosomal protein L9  40.94 
 
 		 148 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000103383  hitchhiker  0.00000000147927 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0012  50S ribosomal protein L9  36.91 
 
 		 154 aa  97.4  5e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181348  hitchhiker  0.0000209307 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3528  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 		 168 aa  97.4  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.156676  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5322  50S ribosomal protein L9  40.94 
 
 		 148 aa  97.4  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5150  50S ribosomal protein L9  40.94 
 
 		 148 aa  97.4  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000483517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5166  50S ribosomal protein L9  40.94 
 
 		 148 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0461945  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5579  50S ribosomal protein L9  40.94 
 
 		 148 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17506e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5718  50S ribosomal protein L9  40.94 
 
 		 148 aa  97.4  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000626689  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2007  ribosomal protein L9  36.3 
 
 		 148 aa  97.4  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.474404 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5596  50S ribosomal protein L9  40.94 
 
 		 148 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1063  ribosomal protein L9  38.51 
 
 		 147 aa  97.1  8e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.342712  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0311  ribosomal protein L9  40 
 
 		 148 aa  97.1  8e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0979697 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27890  ribosomal protein L9  41.5 
 
 		 181 aa  96.7  9e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00233062  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0541  50S ribosomal protein L9  41.79 
 
 		 151 aa  96.7  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4166  ribosomal protein L9  38.67 
 
 		 150 aa  96.7  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>