More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2206 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 456 aa  934    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  53.91 
 
 		 452 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  49.45 
 
 		 450 aa  458  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  48.22 
 
 		 452 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  46.68 
 
 		 450 aa  432  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  45.23 
 
 		 447 aa  424  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  43.21 
 
 		 461 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  43.36 
 
 		 460 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  47.17 
 
 		 473 aa  401  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  42.32 
 
 		 489 aa  395  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  40.53 
 
 		 457 aa  393  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  40.81 
 
 		 450 aa  389  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  41.48 
 
 		 453 aa  388  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  42.06 
 
 		 476 aa  373  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  42.48 
 
 		 458 aa  360  4e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  37.39 
 
 		 489 aa  357  1.9999999999999998e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  31.07 
 
 		 462 aa  195  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  32.35 
 
 		 484 aa  191  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  30.25 
 
 		 460 aa  187  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  29.74 
 
 		 463 aa  184  3e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  33.07 
 
 		 470 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  36.09 
 
 		 492 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  29.31 
 
 		 476 aa  181  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  29.06 
 
 		 476 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  29.31 
 
 		 476 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  29.1 
 
 		 476 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  28.91 
 
 		 485 aa  173  5.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  27.97 
 
 		 477 aa  171  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  32.15 
 
 		 476 aa  171  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  31.13 
 
 		 453 aa  170  6e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  27.7 
 
 		 447 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  27.51 
 
 		 465 aa  153  7e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  26.01 
 
 		 439 aa  150  6e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  29.78 
 
 		 477 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  26.89 
 
 		 403 aa  137  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  27.75 
 
 		 430 aa  134  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  26.58 
 
 		 464 aa  121  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  23.44 
 
 		 486 aa  114  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  25.07 
 
 		 468 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  22.7 
 
 		 462 aa  114  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  28.02 
 
 		 440 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  24.06 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  35.26 
 
 		 464 aa  105  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  24.55 
 
 		 518 aa  102  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  27.36 
 
 		 436 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  26.84 
 
 		 728 aa  100  6e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  25.14 
 
 		 481 aa  98.2  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  21.61 
 
 		 460 aa  97.4  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  28.12 
 
 		 434 aa  97.4  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  29.11 
 
 		 457 aa  96.3  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  28.83 
 
 		 434 aa  95.9  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0685  radical SAM domain-containing protein  27.03 
 
 		 499 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827758 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  24.93 
 
 		 459 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  25.17 
 
 		 432 aa  91.3  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  23.82 
 
 		 369 aa  90.9  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  26.71 
 
 		 510 aa  90.9  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  24.8 
 
 		 453 aa  89.7  9e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  28.2 
 
 		 443 aa  89.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  26.82 
 
 		 399 aa  89.4  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4244  Radical SAM domain protein  25.34 
 
 		 369 aa  89.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  26.93 
 
 		 429 aa  87.4  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  27.82 
 
 		 446 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.47 
 
 		 398 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3221  radical SAM domain-containing protein  25.33 
 
 		 484 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.726288  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  27.47 
 
 		 438 aa  84.3  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  25 
 
 		 385 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  32.5 
 
 		 474 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 400 aa  83.6  0.000000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  24.71 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  24.71 
 
 		 385 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  24.71 
 
 		 385 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  25.49 
 
 		 496 aa  82.8  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  24.71 
 
 		 385 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  23.37 
 
 		 290 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  24.71 
 
 		 385 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3364  radical SAM domain-containing protein  27.03 
 
 		 484 aa  82.4  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.155713  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  24.71 
 
 		 385 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.36 
 
 		 395 aa  82.4  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  24.71 
 
 		 385 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.5 
 
 		 396 aa  81.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499783  hitchhiker  0.00726967 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2456  radical SAM domain-containing protein  27.17 
 
 		 470 aa  81.3  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0040  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.5 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0376  Radical SAM domain protein  25.08 
 
 		 368 aa  81.6  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1340  radical SAM domain-containing protein  22.41 
 
 		 467 aa  81.6  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.8 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0795005 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1508  radical SAM domain-containing protein  22.83 
 
 		 463 aa  79.3  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.322898  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1467  radical SAM domain-containing protein  22.83 
 
 		 463 aa  79.3  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1084  Radical SAM domain protein  27.15 
 
 		 444 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  24.19 
 
 		 394 aa  79  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  26.22 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  21.96 
 
 		 449 aa  78.6  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0479  radical SAM domain-containing protein  25.84 
 
 		 471 aa  77.8  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1267  radical SAM family protein  26.97 
 
 		 473 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361932  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  26.84 
 
 		 396 aa  77.4  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  25.61 
 
 		 405 aa  77  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0147  radical SAM domain-containing protein  23.85 
 
 		 507 aa  76.6  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0233  radical SAM domain-containing protein  26.22 
 
 		 380 aa  76.6  0.0000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.576221 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  28.3 
 
 		 428 aa  76.6  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 		 365 aa  75.1  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1098  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)-like protein  24.18 
 
 		 275 aa  75.5  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.852177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>