More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2183 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_2183  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
162 aa  330  7e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00948662  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3193  AsnC family transcriptional regulator  56.96 
 
 
159 aa  191  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.680188  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0047  transcriptional regulator, AsnC family  55.56 
 
 
162 aa  190  9e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00562884  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1189  AsnC family transcriptional regulator  52.87 
 
 
167 aa  181  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000169629  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0186  AsnC family transcriptional regulator  51.23 
 
 
162 aa  180  8e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  6.83645e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1123  transcriptional regulator, AsnC family  55.33 
 
 
160 aa  178  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1152  AsnC family transcriptional regulator  54 
 
 
160 aa  177  5e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2209  transcriptional regulator, AsnC family  53.29 
 
 
159 aa  173  1e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.928029  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3008  transcriptional regulator, AsnC family  47.53 
 
 
178 aa  172  2e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1341  AsnC family transcriptional regulator  53.33 
 
 
160 aa  171  3e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1415  transcriptional regulator, AsnC family  48.15 
 
 
162 aa  171  5e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.959948  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1206  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 
162 aa  170  8e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0362  AsnC family transcriptional regulator  50.64 
 
 
159 aa  164  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3513  AsnC family transcriptional regulator  45.06 
 
 
164 aa  162  2e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4724  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
165 aa  159  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2862  transcriptional regulator, AsnC family  48.67 
 
 
166 aa  157  5e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0149  AsnC family transcriptional regulator  45.86 
 
 
160 aa  157  7e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5013  transcriptional regulator, AsnC family  43.83 
 
 
165 aa  156  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5134  AsnC family transcriptional regulator  43.83 
 
 
168 aa  156  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4634  AsnC family transcriptional regulator  43.83 
 
 
168 aa  156  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5041  AsnC family transcriptional regulator  43.83 
 
 
165 aa  156  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4612  AsnC family transcriptional regulator  43.83 
 
 
168 aa  156  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4772  AsnC family transcriptional regulator  43.83 
 
 
168 aa  156  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5046  transcriptional regulator, AsnC family  43.83 
 
 
165 aa  155  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5034  transcriptional regulator, AsnC family  44.44 
 
 
165 aa  155  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0638366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0200  transcriptional regulator, AsnC family  44.44 
 
 
165 aa  155  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2404  transcriptional regulator, AsnC family  46.84 
 
 
165 aa  154  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  6.68055e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3464  AsnC family transcriptional regulator  46.91 
 
 
163 aa  154  5e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00420636 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0700  AsnC family transcriptional regulator  48.72 
 
 
160 aa  150  7e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.567855  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0706  AsnC family transcriptional regulator  48.72 
 
 
160 aa  150  7e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1532  transcriptional regulator, AsnC family  44.59 
 
 
161 aa  149  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2663  transcriptional regulator, AsnC family  45.57 
 
 
164 aa  147  5e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00226227  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2857  transcriptional regulator, AsnC family  42.59 
 
 
162 aa  145  2e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.301241  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2100  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 
163 aa  145  2e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0879  AsnC family transcriptional regulator  43.59 
 
 
159 aa  144  5e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3534  transcriptional regulator, AsnC family  41.03 
 
 
162 aa  144  6e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0002  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
163 aa  137  8e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2150  transcriptional regulator, AsnC family  40.24 
 
 
164 aa  136  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.171869 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1320  transcriptional regulator, AsnC family  40.74 
 
 
162 aa  136  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3528  transcriptional regulator, AsnC family  45.22 
 
 
161 aa  135  3e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0541368  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0002  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 
163 aa  133  9e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355793  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0002  transcriptional regulator, AsnC family  37.65 
 
 
163 aa  127  9e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00778678 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2472  AsnC family transcriptional regulator  38.06 
 
 
163 aa  126  1e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1770  transcriptional regulator, AsnC family  40.25 
 
 
161 aa  126  2e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  7.58756e-06  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2838  AsnC family transcriptional regulator  42.14 
 
 
162 aa  124  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258755 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0002  AsnC family transcriptional regulator  30.52 
 
 
163 aa  105  4e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  26.57 
 
 
170 aa  64.3  7e-10  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2886  AsnC family transcriptional regulator  30.34 
 
 
156 aa  62.8  2e-09  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  28.67 
 
 
154 aa  62.8  2e-09  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1694  AsnC family transcriptional regulator  25.35 
 
 
158 aa  62  3e-09  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.43137  normal  0.666184 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1324  AsnC family transcriptional regulator  28.99 
 
 
150 aa  62.4  3e-09  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.719808  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  27.86 
 
 
156 aa  61.6  4e-09  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07108  transcriptional regulator  28.06 
 
 
161 aa  61.6  4e-09  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 
160 aa  61.2  6e-09  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001024  PutR transcriptional activator of PutA and PutP  27.34 
 
 
158 aa  60.8  8e-09  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0174  AsnC family transcriptional regulator  28.26 
 
 
160 aa  59.3  2e-08  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2516  AsnC family transcriptional regulator  30.14 
 
 
169 aa  59.3  2e-08  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1372  regulatory protein AsnC/Lrp family  27.4 
 
 
155 aa  58.9  3e-08  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  29.45 
 
 
156 aa  58.2  5e-08  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0204  transcriptional regulator, AsnC family  28.99 
 
 
153 aa  58.2  5e-08  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138221  normal  0.141193 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  25.93 
 
 
156 aa  57.4  7e-08  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3095  AsnC family transcriptional regulator  27.33 
 
 
174 aa  57.4  8e-08  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679009  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  27.54 
 
 
153 aa  57.4  9e-08  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1452  leucine-responsive regulatory protein  24.31 
 
 
156 aa  56.6  1e-07  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0172  transcriptional regulator, AsnC family  28.19 
 
 
172 aa  56.6  1e-07  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1502  leucine-responsive regulatory protein  24.31 
 
 
156 aa  56.6  1e-07  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3205  AsnC family transcriptional regulator  28.97 
 
 
158 aa  57  1e-07  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1662  AsnC family transcriptional regulator  24.31 
 
 
156 aa  56.6  1e-07  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.070464  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2279  AsnC family transcriptional regulator  27.33 
 
 
174 aa  56.6  1e-07  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37580  putative leucine-responsive regulatory protein  28.97 
 
 
158 aa  56.6  1e-07  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.777021  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0671  transcriptional regulator, AsnC family  27.66 
 
 
145 aa  56.2  2e-07  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0943569  hitchhiker  0.00922833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  28.67 
 
 
156 aa  56.6  2e-07  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3837  AsnC family transcriptional regulator  23.78 
 
 
150 aa  55.8  2e-07  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261619  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  28.86 
 
 
155 aa  56.6  2e-07  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  3.13702e-08  unclonable  2.26618e-07 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2165  AsnC family transcriptional regulator  26.81 
 
 
151 aa  55.8  2e-07  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  31.91 
 
 
155 aa  55.8  2e-07  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  34.07 
 
 
152 aa  55.8  2e-07  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  25.19 
 
 
156 aa  55.5  3e-07  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2327  AsnC family transcriptional regulator  26.81 
 
 
151 aa  55.5  3e-07  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0714715  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0837  AsnC family transcriptional regulator  26.81 
 
 
158 aa  55.8  3e-07  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0388954  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2969  AsnC family transcriptional regulator  26.67 
 
 
174 aa  55.5  3e-07  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1319  transcription regulator AsnC  26.67 
 
 
174 aa  55.5  3e-07  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  28.75 
 
 
229 aa  55.1  4e-07  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  1.3017e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2173  AsnC family transcriptional regulator  29.86 
 
 
156 aa  55.1  4e-07  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.815708  normal  0.596394 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  26.21 
 
 
165 aa  54.7  5e-07  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  29.1 
 
 
172 aa  53.9  8e-07  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  25.52 
 
 
155 aa  53.9  9e-07  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  26.95 
 
 
157 aa  53.5  1e-06  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3495  AsnC family transcriptional regulator  24.11 
 
 
176 aa  53.5  1e-06  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0302787 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  30.56 
 
 
158 aa  53.5  1e-06  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3419  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 
154 aa  53.5  1e-06  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.729086 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  31.91 
 
 
157 aa  53.1  1e-06  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  24.11 
 
 
156 aa  53.5  1e-06  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2217  AsnC family transcriptional regulator  23.61 
 
 
157 aa  53.5  1e-06  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0872223  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0797  transcriptional regulator, AsnC family  26.81 
 
 
165 aa  53.5  1e-06  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163413  normal  0.817989 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  24.48 
 
 
157 aa  52.8  2e-06  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  31.21 
 
 
165 aa  52.8  2e-06  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1053  regulatory proteins, AsnC/Lrp  29.41 
 
 
142 aa  53.1  2e-06  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0738  AsnC family transcriptional regulator  28.77 
 
 
147 aa  52.8  2e-06  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0104  transcriptional regulator, AsnC family  26.92 
 
 
148 aa  52.8  2e-06  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  2.74571e-08  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>