More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2151 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_2151  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  100 
 
 
358 aa  692  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2395  translation factor SUA5  56 
 
 
352 aa  360  3e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3166  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  54.97 
 
 
354 aa  350  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0126434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5504  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  50.72 
 
 
346 aa  350  3e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  3.76853e-07  unclonable  1.14998e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5448  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  50.43 
 
 
346 aa  347  1e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.011245  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5123  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  51 
 
 
346 aa  345  5e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.401349  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2595  translation factor SUA5  49.57 
 
 
351 aa  345  6e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0328746  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5452  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  50.14 
 
 
346 aa  343  3e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0228845  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5025  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  50.14 
 
 
346 aa  341  1e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00487742  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5009  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  50.14 
 
 
346 aa  341  1e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  8.74149e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5174  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  50.14 
 
 
346 aa  341  1e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5568  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  50.14 
 
 
346 aa  341  1e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00343157  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5417  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  50.14 
 
 
346 aa  341  1e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.7505e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5503  sua5/yciO/yrdC/ywlC family protein  50.14 
 
 
346 aa  341  1e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.13963e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3846  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  50.28 
 
 
347 aa  337  2e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00967711  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0096  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  47.18 
 
 
354 aa  336  4e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3319  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  51.01 
 
 
348 aa  332  8e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.831205  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4831  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  51.47 
 
 
348 aa  324  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0105572  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1813  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.29 
 
 
366 aa  321  1e-86  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00420003  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3432  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.19 
 
 
349 aa  312  5e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0139  translation factor SUA5  46 
 
 
350 aa  307  2e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0257  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.98 
 
 
359 aa  306  3e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00354892  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2011  translation factor SUA5  48.27 
 
 
350 aa  305  8e-82  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3747  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.56 
 
 
352 aa  303  3e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.585251  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4186  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  53.53 
 
 
355 aa  303  4e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302621  hitchhiker  3.30857e-06 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4321  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  52.92 
 
 
356 aa  301  1e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2464  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.03 
 
 
350 aa  294  1e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2174  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.03 
 
 
350 aa  294  2e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143173  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4181  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  48.29 
 
 
343 aa  294  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  8.33844e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2287  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  53.51 
 
 
346 aa  292  7e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.036585  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0807  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  44.97 
 
 
338 aa  291  9e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.172547  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17950  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  46.88 
 
 
364 aa  289  4e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0108517  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0281  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  46.18 
 
 
358 aa  288  8e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000413141 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1075  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  44.61 
 
 
348 aa  286  3e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1722  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.07 
 
 
358 aa  286  3e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0075  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.19 
 
 
335 aa  283  3e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0075  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.57 
 
 
335 aa  275  7e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000138931  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2862  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.05 
 
 
367 aa  273  4e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  5.66964e-06 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0901  translation factor SUA5  43.06 
 
 
367 aa  272  8e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0755  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.09 
 
 
344 aa  269  4e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00940805  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0400  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  49.55 
 
 
345 aa  267  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1345  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  47.48 
 
 
358 aa  266  4e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.165171 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1464  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.72 
 
 
341 aa  265  9e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1129  translation factor SUA5  46.88 
 
 
342 aa  259  6e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.712413 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1749  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  49.55 
 
 
345 aa  258  1e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.172136  normal  0.622284 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1773  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.61 
 
 
344 aa  256  5e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0175  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  49.39 
 
 
327 aa  253  3e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.559973  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0067  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.61 
 
 
338 aa  252  6e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0048533  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0378  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  44.51 
 
 
349 aa  252  9e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.606167  normal  0.126735 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0710  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.72 
 
 
331 aa  251  1e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2777  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  47.35 
 
 
360 aa  251  2e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.389142  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0454  translation factor SUA5  44.14 
 
 
342 aa  249  5e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1580  translation factor SUA5  44.88 
 
 
337 aa  242  7e-63  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1782  translation factor SUA5  42.9 
 
 
337 aa  241  1e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0231  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.82 
 
 
335 aa  241  2e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00706793  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1588  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.65 
 
 
317 aa  240  3e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.704065  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1246  putative translation factor (SUA5)  42.6 
 
 
334 aa  239  4e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.377442  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1394  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.45 
 
 
324 aa  236  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.406188 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0403  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  47.56 
 
 
316 aa  236  4e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0452  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  41.95 
 
 
316 aa  233  4e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.865666 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0607  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  45.15 
 
 
364 aa  233  6e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.97472  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2190  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.49 
 
 
357 aa  231  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.970506  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2152  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  36.49 
 
 
357 aa  231  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4092  translation factor SUA5  46.67 
 
 
321 aa  230  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0499  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  42.28 
 
 
317 aa  228  1e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1598  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  44.48 
 
 
331 aa  227  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.215089 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0487  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  39.94 
 
 
318 aa  228  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4009  hypothetical protein  47.96 
 
 
328 aa  227  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1674  Sua5/YciO/YrdC family protein  45.4 
 
 
328 aa  227  3e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1371  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.4 
 
 
328 aa  227  3e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2023  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  44.38 
 
 
326 aa  226  4e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0150257  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33949  predicted protein  41.58 
 
 
387 aa  226  4e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4305  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  45.37 
 
 
327 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0757875 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1565  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  42.25 
 
 
324 aa  223  3e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2432  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.51 
 
 
341 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0598  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.51 
 
 
341 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0303  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.51 
 
 
341 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0845  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.51 
 
 
341 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0044  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.51 
 
 
341 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.939032  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1995  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  40.98 
 
 
319 aa  223  5e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4587  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  49.25 
 
 
329 aa  223  5e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10771  translation initiation protein Sua5 (AFU_orthologue; AFUA_2G09160)  38.62 
 
 
427 aa  223  5e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0142464  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0840  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.51 
 
 
342 aa  223  5e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1003  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein, putative  45.51 
 
 
342 aa  223  5e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0669  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.03 
 
 
341 aa  222  8e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4473  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  50.32 
 
 
329 aa  222  9e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0444  translation factor SUA5  47.35 
 
 
322 aa  221  1e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193197  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2418  translation factor SUA5  40.8 
 
 
321 aa  221  1e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.85919  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1961  translation factor SUA5  46.86 
 
 
335 aa  221  2e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0598  hypothetical protein  41.16 
 
 
329 aa  221  2e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1722  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  38.05 
 
 
347 aa  221  2e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.231595  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0496  translation factor SUA5  40.43 
 
 
323 aa  220  3e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3265  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  48.12 
 
 
345 aa  219  4e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.327071  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4105  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  49.68 
 
 
329 aa  219  5e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854949  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2842  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  47.13 
 
 
335 aa  216  3e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2696  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  46.88 
 
 
328 aa  216  5e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1193  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  43.62 
 
 
330 aa  216  5e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1267  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  47.5 
 
 
326 aa  216  6e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3271  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  45.21 
 
 
346 aa  216  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.917971 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0695  translation factor SUA5  44.88 
 
 
346 aa  215  9e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.274507  normal  0.401857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>