220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2142 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_2142  ATP synthase F0, C subunit  100 
 
 
76 aa  142  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  62.32 
 
 
79 aa  91.7  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3155  ATP synthase F0, C subunit  63.16 
 
 
77 aa  89.4  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0078  ATP synthase F0, C subunit  69.81 
 
 
77 aa  80.1  1e-14  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2182  F0F1 ATP synthase subunit C  62.5 
 
 
70 aa  75.9  2e-13  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.383564  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1714  F0F1 ATP synthase subunit C  62.5 
 
 
70 aa  75.9  2e-13  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2144  F0F1 ATP synthase subunit C  62.5 
 
 
70 aa  75.9  2e-13  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  58.33 
 
 
72 aa  74.7  4e-13  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  58.33 
 
 
72 aa  74.7  4e-13  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  58.33 
 
 
72 aa  74.7  4e-13  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5010  F0F1 ATP synthase subunit C  58.33 
 
 
72 aa  74.7  4e-13  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.222646  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  58.33 
 
 
72 aa  74.7  4e-13  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  58.33 
 
 
72 aa  74.7  4e-13  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  58.33 
 
 
72 aa  74.7  4e-13  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5108  F0F1 ATP synthase subunit C  58.33 
 
 
72 aa  74.7  4e-13  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242215  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5488  F0F1 ATP synthase subunit C  58.33 
 
 
72 aa  74.7  4e-13  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106382  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5432  F0F1 ATP synthase subunit C  58.33 
 
 
72 aa  74.7  4e-13  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  58.33 
 
 
72 aa  74.7  4e-13  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  3.62288e-05  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0660  F0F1-type ATP synthase, subunit c  55.17 
 
 
70 aa  67.4  7e-11  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.307082  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  52.11 
 
 
83 aa  63.5  9e-10  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2170  ATP synthase F0, C subunit  44.93 
 
 
94 aa  61.2  5e-09  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  1.56588e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2330  ATP synthase F0, C subunit  43.48 
 
 
95 aa  59.7  1e-08  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  2.2409e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3308  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 
70 aa  58.5  3e-08  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  8.66069e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  42.25 
 
 
122 aa  58.2  4e-08  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3420  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 
72 aa  57.8  5e-08  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1243  F0F1 ATP synthase subunit C  49.02 
 
 
85 aa  57.4  7e-08  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.290322  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2412  ATP synthase F0, C subunit  52.63 
 
 
68 aa  57.4  7e-08  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1213  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 
81 aa  57  1e-07  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0331  ATP synthase F0, C subunit  52.73 
 
 
76 aa  56.2  1e-07  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2387  ATP synthase F0, C subunit  54.55 
 
 
72 aa  55.8  2e-07  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2192  F0F1 ATP synthase subunit C  48.15 
 
 
82 aa  55.1  3e-07  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0312  ATP synthase F0, C subunit  48.61 
 
 
75 aa  55.5  3e-07  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103627  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1128  F0F1-type ATP synthase subunit C  50.88 
 
 
75 aa  55.1  3e-07  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  40.85 
 
 
82 aa  54.7  4e-07  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0484  F0F1 ATP synthase subunit C  48.15 
 
 
81 aa  55.1  4e-07  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  40.85 
 
 
82 aa  54.7  4e-07  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  39.44 
 
 
81 aa  54.3  6e-07  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  39.44 
 
 
81 aa  54.3  6e-07  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  39.44 
 
 
81 aa  54.3  6e-07  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  39.44 
 
 
81 aa  54.3  6e-07  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  46.3 
 
 
81 aa  53.9  6e-07  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  46.3 
 
 
81 aa  53.9  7e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  40.85 
 
 
111 aa  53.9  7e-07  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1067  ATP synthase F0, C subunit  40.35 
 
 
81 aa  53.5  9e-07  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0600  ATP synthase F0, C subunit  47.76 
 
 
91 aa  53.1  1e-06  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3675  ATP synthase F0, C subunit  42.67 
 
 
75 aa  53.1  1e-06  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  1.61135e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2716  F0F1 ATP synthase subunit C  46.3 
 
 
81 aa  52.4  2e-06  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2203  F0F1 ATP synthase subunit C  44.44 
 
 
81 aa  52.8  2e-06  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0392559  normal  0.227618 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1302  ATP synthase F0, C subunit  47.37 
 
 
74 aa  52  2e-06  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.331137  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3387  F0F1 ATP synthase subunit C  46.3 
 
 
81 aa  52.4  2e-06  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  1.40393e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  46.27 
 
 
91 aa  52.8  2e-06  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0393  ATP synthase F0, C subunit  49.12 
 
 
70 aa  52.4  2e-06  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2812  ATP synthase F0, C subunit  37.68 
 
 
84 aa  52  3e-06  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0167468  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1488  F0F1 ATP synthase subunit C  48 
 
 
82 aa  52  3e-06  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300994  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3334  ATP synthase F0 subunit C  48 
 
 
81 aa  52  3e-06  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2332  F0F1 ATP synthase subunit C  43.55 
 
 
82 aa  52  3e-06  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  5.0881e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09980  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  43.86 
 
 
78 aa  52  3e-06  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697576  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3208  ATP synthase F0, C subunit  37.68 
 
 
84 aa  52  3e-06  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.021594  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2623  F0F1 ATP synthase subunit C  44.44 
 
 
81 aa  52  3e-06  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.989267 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2029  F0F1 ATP synthase subunit C  43.55 
 
 
82 aa  52  3e-06  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  9.4823e-07  normal  0.0236487 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0250  F0F1 ATP synthase subunit C  44.62 
 
 
82 aa  51.2  4e-06  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.436131  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2523  F0F1 ATP synthase subunit C  40.85 
 
 
85 aa  51.6  4e-06  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  4.05757e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0016  ATP synthase F0, C subunit  42.65 
 
 
88 aa  50.8  5e-06  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.29893e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  35.29 
 
 
74 aa  51.2  5e-06  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0188  F0F1 ATP synthase subunit C  43.55 
 
 
81 aa  51.2  5e-06  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450666 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0181  ATP synthase C chain  40.85 
 
 
100 aa  50.8  5e-06  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2143  ATP synthase F0, C subunit  40.85 
 
 
100 aa  50.8  6e-06  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4101  F0F1 ATP synthase subunit C  45.07 
 
 
83 aa  50.8  6e-06  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  1.10269e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1779  ATP synthase F0, C subunit  42.11 
 
 
77 aa  50.8  7e-06  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0475  F0F1 ATP synthase subunit C  44.62 
 
 
89 aa  50.4  7e-06  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0683379  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4875  ATP synthase F0, C subunit  44.93 
 
 
87 aa  50.4  8e-06  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2762  ATP synthase F0, C subunit  47.17 
 
 
82 aa  50.4  8e-06  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 
96 aa  50.4  9e-06  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4300  F0F1 ATP synthase subunit C  38.36 
 
 
82 aa  50.1  9e-06  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00293753  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002025  ATP synthase C chain  39.39 
 
 
84 aa  49.7  1e-05  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  2.13686e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0333  ATP synthase F0, C subunit  44.12 
 
 
91 aa  50.1  1e-05  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000631431  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0367  F0F1 ATP synthase subunit C  44.62 
 
 
82 aa  50.1  1e-05  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.467812  normal  0.384137 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0246  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 
78 aa  49.7  1e-05  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.701859  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00427  F0F1 ATP synthase subunit C  39.39 
 
 
84 aa  49.7  1e-05  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4249  ATP synthase F0, C subunit  41.18 
 
 
91 aa  49.7  1e-05  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  9.50029e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3143  ATP synthase F0, C subunit  44.12 
 
 
91 aa  50.1  1e-05  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00841289  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3360  ATP synthase F0, C subunit  44.12 
 
 
91 aa  50.1  1e-05  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.92065e-05  hitchhiker  0.00459127 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0952  ATP synthase F0, C subunit  43.66 
 
 
88 aa  50.1  1e-05  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.146117  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3079  ATP synthase F0, C subunit  34.25 
 
 
94 aa  50.1  1e-05  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268592  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0198  ATP synthase F0, C subunit  51.11 
 
 
78 aa  49.3  2e-05  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000179911  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0462  ATP synthase F0, C subunit  47.73 
 
 
72 aa  49.3  2e-05  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00357731  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0800  ATP synthase F0, C subunit  39.71 
 
 
321 aa  48.9  2e-05  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0601  ATP synthase F0, C subunit  40.28 
 
 
100 aa  48.9  2e-05  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04088  F0F1 ATP synthase subunit C  42.86 
 
 
73 aa  49.3  2e-05  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0194198  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3064  F0F1 ATP synthase subunit C  39.39 
 
 
85 aa  49.3  2e-05  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3058  F0F1 ATP synthase subunit C  38.03 
 
 
91 aa  48.5  3e-05  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4623  ATP synthase F0, C subunit  35.82 
 
 
92 aa  48.5  3e-05  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0303  F0F1 ATP synthase subunit C  43.08 
 
 
82 aa  48.5  3e-05  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0073525 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2915  F0F1 ATP synthase subunit C  38.03 
 
 
91 aa  48.5  3e-05  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3932  ATP synthase F0, C subunit  39.71 
 
 
91 aa  48.5  3e-05  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  4.4416e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6141  ATP synthase F0, C subunit  40.35 
 
 
73 aa  48.5  3e-05  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4016  ATP synthase F0, C subunit  39.71 
 
 
91 aa  48.5  3e-05  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.64478e-25 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2501  ATP synthase F0, C subunit  41.1 
 
 
78 aa  48.1  3e-05  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0298  F0F1 ATP synthase subunit C  43.08 
 
 
82 aa  48.5  3e-05  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104912  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0415  F0F1 ATP synthase subunit C  43.08 
 
 
82 aa  48.5  3e-05  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.233607  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>