More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2137 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_4607  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.59 
 
 
458 aa  640    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03616  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.38 
 
 
460 aa  642    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4235  ATP synthase F1, beta subunit  68.38 
 
 
460 aa  642    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4132  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.8 
 
 
460 aa  645    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.364679  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.45 
 
 
470 aa  726    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5413  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.02 
 
 
458 aa  642    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278532 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3948  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.38 
 
 
460 aa  642    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.440283  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4365  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.02 
 
 
463 aa  647    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  67.72 
 
 
482 aa  656    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3317  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.74 
 
 
467 aa  640    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.156126  normal  0.0243325 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.79 
 
 
468 aa  665    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0008  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.23 
 
 
460 aa  649    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.366806  normal  0.022382 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4240  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.02 
 
 
458 aa  652    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.695259  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.31 
 
 
471 aa  696    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0197  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.08 
 
 
471 aa  637    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4747  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.45 
 
 
463 aa  657    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5599  ATP synthase F1, beta subunit  68.59 
 
 
459 aa  642    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.57 
 
 
469 aa  663    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.57 
 
 
469 aa  663    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.57 
 
 
469 aa  663    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2957  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.25 
 
 
464 aa  648    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3053  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.02 
 
 
458 aa  641    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2910  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.02 
 
 
458 aa  641    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00570  conserved hypothetical protein  66.74 
 
 
547 aa  638    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0429252  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5121  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.59 
 
 
459 aa  643    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0193  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.7 
 
 
475 aa  635    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.196024  normal  0.0120657 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0603  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.58 
 
 
467 aa  672    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00132647  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3346  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.09 
 
 
467 aa  639    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.185597  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2430  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.66 
 
 
458 aa  657    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0681755  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2797  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.66 
 
 
459 aa  648    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0433  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.51 
 
 
476 aa  639    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.35 
 
 
482 aa  665    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0179  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.25 
 
 
464 aa  648    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.54754  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3074  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.02 
 
 
458 aa  641    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0176  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.82 
 
 
483 aa  645    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0408  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.36 
 
 
480 aa  640    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.364668 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.02 
 
 
468 aa  680    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.02 
 
 
468 aa  680    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3288  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.03 
 
 
464 aa  648    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.51 
 
 
482 aa  672    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.3 
 
 
462 aa  672    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.02 
 
 
470 aa  722    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.34 
 
 
470 aa  672    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.197353  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1587  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.25 
 
 
459 aa  647    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.986893  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.57 
 
 
469 aa  663    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2922  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.95 
 
 
509 aa  643    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3150  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.13 
 
 
472 aa  755    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5295  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.02 
 
 
458 aa  642    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.122474 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.52 
 
 
471 aa  696    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4486  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.81 
 
 
458 aa  650    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000121569 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.05 
 
 
462 aa  724    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3308  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.25 
 
 
464 aa  648    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0659546  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4348  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.64 
 
 
482 aa  648    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3015  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.25 
 
 
464 aa  648    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.676639  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0290  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.94 
 
 
469 aa  647    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00322689  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2402  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.39 
 
 
481 aa  638    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119590  ATP synthase beta chain, mitochondrial precursor  67.02 
 
 
530 aa  645    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.114737  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77492  F1F0-ATPase complex, F1 beta subunit  68.75 
 
 
503 aa  636    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.686531  normal  0.984135 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0106  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.01 
 
 
474 aa  635    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.49 
 
 
481 aa  683    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3956  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.81 
 
 
463 aa  647    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0165608  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2744  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.15 
 
 
465 aa  645    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.885602  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4176  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.59 
 
 
460 aa  642    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0938283  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0040  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.6 
 
 
464 aa  644    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0581071  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3752  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.09 
 
 
463 aa  664    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00277276  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.59 
 
 
470 aa  715    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0325  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.28 
 
 
472 aa  663    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4462  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.38 
 
 
458 aa  643    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.718336  hitchhiker  0.0000000225829 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6356  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.23 
 
 
458 aa  637    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3494  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.38 
 
 
467 aa  646    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000137861  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3355  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.25 
 
 
464 aa  648    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3968  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.25 
 
 
464 aa  648    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4366  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.02 
 
 
463 aa  647    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521445  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.06 
 
 
464 aa  672    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2949  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.6 
 
 
464 aa  644    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1181  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.18 
 
 
468 aa  645    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.186447  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4295  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.09 
 
 
461 aa  644    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.797845  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3218  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.09 
 
 
519 aa  636    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.16 
 
 
465 aa  650    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.38 
 
 
465 aa  652    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1696  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.44 
 
 
457 aa  654    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4042  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.25 
 
 
464 aa  648    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3925  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.66 
 
 
463 aa  658    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0179078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4017  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.66 
 
 
463 aa  659    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.436457  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2869  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.02 
 
 
458 aa  649    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.761227  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4045  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.24 
 
 
463 aa  651    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.632906  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2382  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.66 
 
 
476 aa  669    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3845  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.95 
 
 
458 aa  648    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000208529 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0097  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.82 
 
 
464 aa  645    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.26731  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73240  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.23 
 
 
458 aa  637    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.66 
 
 
462 aa  663    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0026  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.38 
 
 
466 aa  642    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.122802  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2195  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.95 
 
 
470 aa  682    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3875  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.87 
 
 
464 aa  650    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4507  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.02 
 
 
463 aa  647    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0605714 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0106  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.6 
 
 
464 aa  644    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2582  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.43 
 
 
469 aa  671    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.646569  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4247  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.38 
 
 
460 aa  642    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000144412  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4130  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.66 
 
 
463 aa  658    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.145707 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3644  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.59 
 
 
462 aa  650    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0562091  hitchhiker  0.000849017 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>