18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2126 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_2126  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 356 aa  705    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2363  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  31.36 
 
 		 376 aa  125  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.824355  hitchhiker  0.000839626 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4156  putative transmembrane anti-sigma factor  25.13 
 
 		 366 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0909715  hitchhiker  0.000583924 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0131  putative transmembrane anti-sigma factor  29.62 
 
 		 347 aa  86.7  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000144677  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0088  putative transmembrane anti-sigma factor  25.35 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2156  hypothetical protein  28.49 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0151  putative transmembrane anti-sigma factor  28.32 
 
 		 203 aa  50.4  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0155  putative transmembrane anti-sigma factor  24.71 
 
 		 203 aa  50.1  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000067167  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0624  hypothetical protein  40 
 
 		 85 aa  48.5  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1890  hypothetical protein  43.14 
 
 		 78 aa  47  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2153  hypothetical protein  36.36 
 
 		 85 aa  45.4  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0764  putative transmembrane anti-sigma factor  38.46 
 
 		 88 aa  45.1  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0867  putative transmembrane anti-sigma factor  36.54 
 
 		 77 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.71952  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2285  putative transmembrane anti-sigma factor  40.38 
 
 		 360 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000826117  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4250  putative transmembrane protein  46.3 
 
 		 266 aa  43.9  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.939456  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2588  hypothetical protein  44.68 
 
 		 256 aa  43.5  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0040  putative transmembrane anti-sigma factor  26.67 
 
 		 363 aa  43.1  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.411333  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3810  hypothetical protein  51.22 
 
 		 81 aa  42.7  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>