21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2120 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_2120  outer membrane protein-like protein  100 
 
 
374 aa  743    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000810254  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4152  Outer membrane protein-like protein  36.83 
 
 
366 aa  232  6e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000101728  hitchhiker  0.00000035562 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2342  Outer membrane protein-like  39.64 
 
 
333 aa  232  8.000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.454811 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0134  hypothetical protein  31.1 
 
 
394 aa  183  5.0000000000000004e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000263159  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0045  outer membrane efflux protein  34.02 
 
 
370 aa  160  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00077566  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3141  hypothetical protein  24.52 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0837  outer membrane efflux protein  23.22 
 
 
342 aa  54.3  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0284  outer membrane channel protein  25.71 
 
 
465 aa  51.6  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0573  outer membrane channel protein  25.71 
 
 
464 aa  51.2  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0654  outer membrane channel protein  25.71 
 
 
464 aa  51.2  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.945309  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3619  outer membrane channel protein  24.69 
 
 
469 aa  51.2  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  22.86 
 
 
441 aa  49.7  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4268  outer membrane channel protein  23.58 
 
 
497 aa  48.5  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3777  outer membrane channel protein  25.62 
 
 
470 aa  48.5  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0774  outer membrane channel protein  21.63 
 
 
441 aa  43.5  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000983275  unclonable  0.000000000104798 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3332  outer membrane channel protein  24.73 
 
 
431 aa  43.5  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0563453  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0729  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.83 
 
 
444 aa  43.5  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000668163 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0575  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.83 
 
 
444 aa  43.5  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0725  outer membrane channel protein  23.41 
 
 
435 aa  43.1  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000245313  hitchhiker  0.000963429 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0753  outer membrane channel protein  23.41 
 
 
435 aa  43.1  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000555232  normal  0.0190145 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3236  outer membrane channel protein  23.41 
 
 
435 aa  43.1  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000456355  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>