167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2105 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_2105  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 296 aa  608  1e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0828766  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  35.27 
 
 		 373 aa  132  7.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  29.73 
 
 		 319 aa  110  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4483  polysaccharide deacetylase  33.08 
 
 		 695 aa  109  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.367373  normal  0.863016 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4263  polysaccharide deacetylase  31.03 
 
 		 697 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4103  polysaccharide deacetylase  31.03 
 
 		 697 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.871871  normal  0.778137 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3997  polysaccharide deacetylase  31.42 
 
 		 697 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695216  normal  0.336374 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3420  polysaccharide deacetylase  30.65 
 
 		 698 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1941  polysaccharide deacetylase  31.42 
 
 		 697 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3514  polysaccharide deacetylase  31.17 
 
 		 697 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000898006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4286  outer membrane N-deacetylase  32.42 
 
 		 671 aa  95.5  9e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4607  outer membrane N-deacetylase  32.62 
 
 		 671 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0751  polysaccharide deacetylase  25.86 
 
 		 673 aa  95.1  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.442489  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2926  polysaccharide deacetylase  31.08 
 
 		 659 aa  92.4  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3011  polysaccharide deacetylase  32.61 
 
 		 659 aa  92.4  8e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245243  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3118  polysaccharide deacetylase  32.61 
 
 		 660 aa  92  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3765  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 712 aa  90.5  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4842  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 712 aa  90.5  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0178  outer membrane N-deacetylase  29.22 
 
 		 665 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.604403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0883  polysaccharide deacetylase  27.41 
 
 		 298 aa  85.9  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000351632  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0287  putative hemin storage signal peptide protein  27.59 
 
 		 724 aa  82.4  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.111967  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2717  polysaccharide deacetylase  27.15 
 
 		 628 aa  82  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4642  polysaccharide deacetylase  31.72 
 
 		 457 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.921462  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4730  polysaccharide deacetylase  31.72 
 
 		 548 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5025  polysaccharide deacetylase  32.09 
 
 		 548 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.794076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2130  outer membrane N-deacetylase  28.77 
 
 		 673 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2142  outer membrane N-deacetylase  28.77 
 
 		 673 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0474034 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2240  outer membrane N-deacetylase  28.77 
 
 		 673 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04327  biofilm PGA synthesis lipoprotein PgaB  29.87 
 
 		 624 aa  79.3  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.215859  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1138  outer membrane N-deacetylase  27.73 
 
 		 672 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115575  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01025  predicted enzyme associated with biofilm formation  27.73 
 
 		 672 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2620  polysaccharide deacetylase  27.73 
 
 		 672 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01032  hypothetical protein  27.73 
 
 		 672 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1143  outer membrane N-deacetylase  27.73 
 
 		 672 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2573  outer membrane N-deacetylase  27.73 
 
 		 672 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0269291 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1265  outer membrane N-deacetylase  27.73 
 
 		 672 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.798831 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2791  hypothetical protein  29.67 
 
 		 640 aa  77  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.291104  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0136  hemin storage protein  27.03 
 
 		 684 aa  74.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.84788  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0475  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] (glutamineamidotransferase; GMP synthetase)  25.4 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  27.04 
 
 		 363 aa  70.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1233  yggt family protein  28.87 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2692  intercellular adhesion protein B  25.13 
 
 		 290 aa  68.9  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.624067  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2749  intercellular adhesion protein B  25.13 
 
 		 290 aa  68.9  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2295  intercellular adhesion protein B  26.92 
 
 		 289 aa  68.9  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0572032  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  28.63 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  24.35 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4008  polysaccharide deacetylase  23.14 
 
 		 348 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  26.2 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  24.78 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0570  polysaccharide deacetylase  36.52 
 
 		 383 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0342536 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4235  polysaccharide deacetylase  25.43 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  23.15 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  26.81 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2153  xylanase/chitin deacetylase  26.52 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1105  polysaccharide deacetylase  32.28 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2241  polysaccharide deacetylase  24.12 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0722  polysaccharide deacetylase  24.27 
 
 		 284 aa  62.4  0.000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1858  polysaccharide deacetylase  26.88 
 
 		 347 aa  62  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000052436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  22.95 
 
 		 256 aa  62  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  23.67 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0846  polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  22.22 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0811  Shf protein  23.79 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  22.22 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0248  polysaccharide deacetylase  24.77 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  23.65 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  22.48 
 
 		 348 aa  59.3  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  23.11 
 
 		 306 aa  58.9  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  22.94 
 
 		 348 aa  58.9  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3994  polysaccharide deacetylase  24.86 
 
 		 426 aa  58.9  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  21.3 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  23.67 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  25.41 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  21.76 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  21.82 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  23.98 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  22.02 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4408  polysaccharide deacetylase  26.48 
 
 		 263 aa  57  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4541  polysaccharide deacetylase  26.48 
 
 		 263 aa  57  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00515582 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0603  polysaccharide deacetylase  26.45 
 
 		 371 aa  56.2  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  28.48 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1828  polysaccharide deacetylase  26.91 
 
 		 278 aa  55.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  21.46 
 
 		 348 aa  55.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3056  polysaccharide deacetylase  26.95 
 
 		 401 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2170  polysaccharide deacetylase family protein  26.91 
 
 		 256 aa  55.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1265  polysaccharide deacetylase  37.31 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.493777  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1587  polysaccharide deacetylase  25.22 
 
 		 626 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0605374  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  23.17 
 
 		 273 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  23.17 
 
 		 273 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  24.29 
 
 		 319 aa  54.3  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0196  polysaccharide deacetylase domain protein  23.81 
 
 		 409 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2028  polysaccharide deacetylase  27.15 
 
 		 318 aa  53.5  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.30621  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00129  predicted polysaccharide deacetylase lipoprotein  26.06 
 
 		 409 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.530219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3472  polysaccharide deacetylase  26.06 
 
 		 409 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00128  hypothetical protein  26.06 
 
 		 409 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411127  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3529  polysaccharide deacetylase  26.06 
 
 		 409 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0140  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  30.77 
 
 		 409 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0134  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  31.07 
 
 		 409 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  23.17 
 
 		 273 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0199  polysaccharide deacetylase domain protein  23.81 
 
 		 409 aa  52.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.37766  normal  0.364365 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>