More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2089 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_2089  phosphomannomutase  100 
 
 
467 aa  939    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.631588  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3100  phosphoglucomutase  56.39 
 
 
486 aa  537  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4110  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  55.79 
 
 
470 aa  534  1e-150  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00036282 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1967  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  57.05 
 
 
466 aa  530  1e-149  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0221  phosphoglucomutase  55.27 
 
 
471 aa  501  1e-141  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1132  Phosphoglucomutase  51.28 
 
 
470 aa  484  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.301327  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2040  Phosphomannomutase  44.78 
 
 
467 aa  410  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0022355  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1737  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  44.95 
 
 
475 aa  404  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148942  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1831  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  45.3 
 
 
472 aa  403  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000124706  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1767  phosphoglucosamine mutase  45.53 
 
 
475 aa  400  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2649  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  44.23 
 
 
474 aa  393  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000128846 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2013  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  44.7 
 
 
472 aa  391  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0108375  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1311  phosphomannomutase ManB  44.95 
 
 
473 aa  387  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81653e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0135  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  43.01 
 
 
469 aa  385  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000226581  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1567  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  43.8 
 
 
474 aa  388  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000749576  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3319  Phosphoglucomutase  42.46 
 
 
468 aa  382  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2567  phosphoglucosamine mutase  43.78 
 
 
488 aa  381  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.6066  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0990  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  43.64 
 
 
472 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000661724  normal  0.0347081 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3418  phosphoglucomutase  42.68 
 
 
478 aa  379  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3321  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  41.86 
 
 
469 aa  376  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4381  phosphoglucomutase  41.83 
 
 
469 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000631194  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1752  Phosphoglucomutase  41.14 
 
 
463 aa  372  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1605  Phosphoglucomutase  43.01 
 
 
472 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1751  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  43.32 
 
 
467 aa  370  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2017  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  41.26 
 
 
472 aa  355  1e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000060131  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4050  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  41.95 
 
 
469 aa  352  8.999999999999999e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3964  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  41.53 
 
 
469 aa  351  1e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000701668  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4823  phosphoglucomutase  40.69 
 
 
471 aa  346  5e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0794  Phosphomannomutase  41.65 
 
 
474 aa  340  2e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3855  phosphomannomutase  37.97 
 
 
474 aa  335  7e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0140  putative phosphoglucomutase/phosphomannomutase  40.34 
 
 
470 aa  335  2e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002577  GlcNAc phosphomutase  39.53 
 
 
470 aa  333  5e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03432  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  39.32 
 
 
470 aa  331  2e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0077  Phosphomannomutase  41.52 
 
 
460 aa  329  7e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.133339  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1486  Phosphoglucomutase  36.42 
 
 
457 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000122855  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2585  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  38.22 
 
 
470 aa  327  3e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1936  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  40.64 
 
 
463 aa  323  3e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0991  Phosphomannomutase  38.14 
 
 
458 aa  319  9e-86  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.160254  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0372  Phosphoglucosamine mutase  37.1 
 
 
474 aa  317  4e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28260  phosphomannomutase  37.98 
 
 
473 aa  311  2e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0510  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  36.31 
 
 
475 aa  310  4e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0352  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  41.37 
 
 
475 aa  302  8.000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.345655 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2655  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  40.39 
 
 
484 aa  301  1e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0571  phosphoglucosamine mutase  38.28 
 
 
472 aa  295  1e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1054  Glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase., Phosphoglucomutase  37.11 
 
 
733 aa  294  2e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1768  Phosphomannomutase  36.63 
 
 
480 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1796  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  36.63 
 
 
480 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238511  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3749  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  38.56 
 
 
464 aa  290  3e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1740  phosphoglucomutase  36.84 
 
 
460 aa  287  2e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0251978 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2223  Phosphoglucomutase  37.23 
 
 
490 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0282699 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1140  Phosphomannomutase  38.05 
 
 
482 aa  285  9e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.188407  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0369  phosphomannomutase  34.94 
 
 
501 aa  284  3.0000000000000004e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.391348  hitchhiker  0.00000119855 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0474  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  36.01 
 
 
460 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0970  phosphoglucomutase  34.79 
 
 
479 aa  281  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0168511  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1955  Phosphoglucosamine mutase  37.05 
 
 
503 aa  275  1.0000000000000001e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.404155  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0447  Phosphoglucomutase  35.76 
 
 
460 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000142951  normal  0.775368 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0411  Phosphomannomutase  36.32 
 
 
460 aa  274  3e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.606567 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1899  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  38.41 
 
 
473 aa  271  2e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145231 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0341  Phosphoglucomutase  34.86 
 
 
460 aa  270  4e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03581  phosphotransferase superclass  33.47 
 
 
486 aa  266  5e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.37944  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3839  Phosphoglucosamine mutase  37.21 
 
 
468 aa  265  1e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0486  phosphomannomutase  36.08 
 
 
414 aa  265  2e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.504312  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4933  Phosphoglucomutase  35.86 
 
 
477 aa  263  4e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0612098 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_451  phosphomannomutase  34.72 
 
 
409 aa  262  8e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0496363  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1268  phosphoglucomutase  34.58 
 
 
484 aa  261  2e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.43258  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0410  phosphomannomutase  34.43 
 
 
460 aa  260  3e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.158132  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2367  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  34.04 
 
 
478 aa  259  9e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000518249  normal  0.780869 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0442  Phosphoglucomutase  33.98 
 
 
460 aa  258  1e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1644  phosphomannomutase  33.05 
 
 
486 aa  257  4e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0038  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  32.37 
 
 
480 aa  253  5.000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0114  phosphomannomutase  33.19 
 
 
467 aa  253  6e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.154128  hitchhiker  0.0000359682 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03051  phosphotransferase superclass  32.55 
 
 
485 aa  249  6e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03111  phosphotransferase superclass  30 
 
 
486 aa  245  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.309336  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1893  phosphoglucomutase  35.5 
 
 
465 aa  243  3.9999999999999997e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.576391  normal  0.489627 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0228  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  35.25 
 
 
487 aa  240  4e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03021  phosphotransferase superclass  29.89 
 
 
484 aa  237  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0280  phosphomannomutase  30.59 
 
 
484 aa  236  8e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3078  Phosphoglucosamine mutase  35.5 
 
 
470 aa  234  2.0000000000000002e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0257  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  33.55 
 
 
487 aa  234  2.0000000000000002e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24991  phosphotransferase superclass  33.95 
 
 
487 aa  233  8.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03011  phosphotransferase superclass  29.07 
 
 
484 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0959823  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1292  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  32.37 
 
 
471 aa  213  3.9999999999999995e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0496  Phosphoglucosamine mutase  35.09 
 
 
480 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1269  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  30.98 
 
 
518 aa  198  2.0000000000000003e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000278301  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1254  phosphoglucomutase  30.06 
 
 
546 aa  195  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00445613  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1648  phosphoglucomutase  31.29 
 
 
551 aa  193  5e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.246099  normal  0.694136 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0227  phosphoglucomutase  30.69 
 
 
549 aa  192  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145107 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0294  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  29.45 
 
 
548 aa  187  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.638351  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1989  phosphoglucomutase  29.33 
 
 
550 aa  187  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0755  phosphoglucomutase  30.33 
 
 
547 aa  187  4e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.428968  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1681  phosphoglucomutase  29.25 
 
 
548 aa  186  7e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000458453  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004120  phosphoglucomutase  30.02 
 
 
548 aa  186  8e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1444  phosphoglucomutase  29.47 
 
 
545 aa  186  9e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.402303  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6650  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  29.27 
 
 
545 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0760474 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2017  phosphoglucomutase  27.93 
 
 
547 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0565501  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0744  phosphoglucomutase  29.59 
 
 
550 aa  184  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2654  phosphoglucomutase  29.5 
 
 
552 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2052  phosphoglucomutase alpha-D-glucose phosphate-specific  29.84 
 
 
547 aa  184  4.0000000000000006e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0812178  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0159  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  32.02 
 
 
471 aa  183  7e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.309017  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01060  phosphoglucomutase  29.7 
 
 
572 aa  182  1e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0503822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>