55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2087 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_2087  PRC-barrel domain-containing protein  100 
 
 
83 aa  164  3e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000370117  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3097  PRC-barrel domain-containing protein  55.26 
 
 
86 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4106  sporulation protein, YlmC/YmxH family  53.25 
 
 
83 aa  92  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1965  sporulation protein, YlmC/YmxH family  57.33 
 
 
80 aa  86.7  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0628  sporulation protein, YlmC/YmxH family  50 
 
 
76 aa  82.4  2e-15  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0688  PRC-barrel domain-containing protein  45.45 
 
 
89 aa  81.3  4e-15  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1550  sporulation protein, YlmC/YmxH family  50 
 
 
87 aa  79.7  1e-14  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  5.99646e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1423  PRC-barrel domain-containing protein  45.45 
 
 
87 aa  78.6  3e-14  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.754196  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1069  sporulation protein, YlmC/YmxH family  48.05 
 
 
92 aa  76.3  1e-13  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  5.1036e-09  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1032  sporulation protein, YlmC/YmxH family  43.42 
 
 
80 aa  75.1  3e-13  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  5.77083e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1292  sporulation protein, YlmC/YmxH family  43.42 
 
 
98 aa  73.6  9e-13  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1902  sporulation protein, YlmC/YmxH family  43.42 
 
 
80 aa  73.2  1e-12  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3661  hypothetical protein  44.59 
 
 
92 aa  73.2  1e-12  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  2.06219e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0855  PRC-barrel  47.37 
 
 
89 aa  72.8  2e-12  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0102174  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0948  hypothetical protein  40.26 
 
 
96 aa  71.6  3e-12  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  2.78649e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3947  hypothetical protein  43.24 
 
 
94 aa  72  3e-12  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  1.84665e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2551  sporulation protein YlmC/YmxH  40.54 
 
 
92 aa  71.6  4e-12  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000356426  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3753  hypothetical protein  42.11 
 
 
94 aa  70.9  5e-12  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000104332  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4041  hypothetical protein  42.11 
 
 
94 aa  70.9  5e-12  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  3.97229e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3644  hypothetical protein  42.11 
 
 
94 aa  70.5  7e-12  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.4803e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09180  Sporulation protein YlmC/YmxH  43.21 
 
 
83 aa  70.5  7e-12  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  5.50591e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3954  hypothetical protein  43.24 
 
 
94 aa  70.1  1e-11  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.46273e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0449  hypothetical protein  42.11 
 
 
86 aa  69.7  1e-11  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  7.99213e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1238  hypothetical protein  38.16 
 
 
93 aa  68.6  3e-11  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.44428e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4003  hypothetical protein  39.19 
 
 
93 aa  68.2  4e-11  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  4.78598e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4052  sporulation protein, YlmC/YmxH family  41.33 
 
 
90 aa  67.8  5e-11  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  9.66355e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3916  hypothetical protein  46.27 
 
 
84 aa  67  9e-11  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26945e-10 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1312  sporulation protein, YlmC/YmxH family  38.96 
 
 
91 aa  65.9  2e-10  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.53556e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1999  PRC-barrel domain-containing protein  35.53 
 
 
81 aa  63.9  8e-10  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  4.79009e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3729  sporulation protein YlmC/YmxH  39.47 
 
 
92 aa  59.7  1e-08  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  4.49353e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2060  sporulation protein, YlmC/YmxH family  35.06 
 
 
86 aa  58.2  3e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.07083e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0939  hypothetical protein  33.33 
 
 
92 aa  57  9e-08  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1650  sporulation protein, YlmC/YmxH family  32.47 
 
 
85 aa  57  9e-08  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2057  sporulation protein, YlmC/YmxH family  32.1 
 
 
80 aa  55.5  2e-07  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3174  sporulation protein, YlmC/YmxH family  35.06 
 
 
89 aa  55.8  2e-07  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.276022  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2726  YlmC/YmxH family sporulation protein  35.14 
 
 
86 aa  55.5  3e-07  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  9.03378e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1164  sporulation protein, YlmC/YmxH family  33.33 
 
 
79 aa  53.5  8e-07  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00357705  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2013  PRC-barrel domain-containing protein  26.67 
 
 
90 aa  51.2  5e-06  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1731  PRC-barrel domain-containing protein  26.67 
 
 
90 aa  50.8  6e-06  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.046414  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1945  hypothetical protein  29.87 
 
 
89 aa  50.8  7e-06  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00643926  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1062  hypothetical protein  32.47 
 
 
90 aa  50.1  1e-05  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  3.3681e-06  hitchhiker  0.00140084 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0912  hypothetical protein  30.12 
 
 
89 aa  49.7  2e-05  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3626  sporulation protein YlmC/YmxH  35.44 
 
 
82 aa  47.8  5e-05  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.412892  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1635  PRC-barrel domain-containing protein  31.17 
 
 
83 aa  47.8  5e-05  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.178848  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2456  hypothetical protein  34.62 
 
 
84 aa  47.8  6e-05  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0215941  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3664  sporulation protein, YlmC/YmxH family  32.91 
 
 
93 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.87641e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3842  hypothetical protein  32.05 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3851  hypothetical protein  30.77 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  3.02726e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3563  hypothetical protein  29.49 
 
 
83 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3941  hypothetical protein  29.49 
 
 
83 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3545  hypothetical protein  29.49 
 
 
83 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3655  hypothetical protein  29.49 
 
 
83 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3815  hypothetical protein  29.49 
 
 
83 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.14862e-63 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07980  Sporulation protein YlmC/YmxH  33.33 
 
 
74 aa  41.6  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0118  PRC-barrel domain protein  30 
 
 
301 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>